RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
PDE4D-204ENST00000358923 WDR97A6NE52 1622 aa27.25■■□□□ 1.95
PDE4D-204ENST00000358923 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.21■■□□□ 1.95
PDE4D-204ENST00000358923 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.21■■□□□ 1.95
PDE4D-204ENST00000358923 FBLN2P98095 1184 aa27.16■■□□□ 1.94
PDE4D-204ENST00000358923 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PDE4D-204ENST00000358923 WDR62O43379 1518 aa27.1■■□□□ 1.93
PDE4D-204ENST00000358923 ARID3CA6NKF2 412 aa27.09■■□□□ 1.93
PDE4D-204ENST00000358923 CUL7Q14999 1698 aa27.08■■□□□ 1.93
PDE4D-204ENST00000358923 ITGAEP38570 1179 aa27.07■■□□□ 1.92
PDE4D-204ENST00000358923 IFT140Q96RY7 1462 aa27.02■■□□□ 1.92
PDE4D-204ENST00000358923 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PDE4D-204ENST00000358923 PBRM1Q86U86 1689 aa26.99■■□□□ 1.91
PDE4D-204ENST00000358923 GRIN2BQ13224 1484 aa26.98■■□□□ 1.91
PDE4D-204ENST00000358923 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.96■■□□□ 1.91
PDE4D-204ENST00000358923 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.95■■□□□ 1.9
PDE4D-204ENST00000358923 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.92■■□□□ 1.9
PDE4D-204ENST00000358923 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-204ENST00000358923 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PDE4D-204ENST00000358923 ADAMTS12P58397 1594 aa26.88■■□□□ 1.89
PDE4D-204ENST00000358923 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PDE4D-204ENST00000358923 TIAM1Q13009 1591 aa26.79■■□□□ 1.88
PDE4D-204ENST00000358923 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PDE4D-204ENST00000358923 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.76■■□□□ 1.87
PDE4D-204ENST00000358923 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.74■■□□□ 1.87
PDE4D-204ENST00000358923 GRIN2AQ12879 1464 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-204ENST00000358923 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.72■■□□□ 1.87
PDE4D-204ENST00000358923 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PDE4D-204ENST00000358923 IQGAP2Q13576 1575 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-204ENST00000358923 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.7■■□□□ 1.86
PDE4D-204ENST00000358923 FMN1Q68DA7 1419 aa26.7■■□□□ 1.86
PDE4D-204ENST00000358923 SAMD9Q5K651 1589 aa26.69■■□□□ 1.86
PDE4D-204ENST00000358923 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-204ENST00000358923 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.63■■□□□ 1.85
PDE4D-204ENST00000358923 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PDE4D-204ENST00000358923 SYNJ2O15056 1496 aa26.61■■□□□ 1.85
PDE4D-204ENST00000358923 CEP170Q5SW79 1584 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-204ENST00000358923 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-204ENST00000358923 JPH4Q96JJ6 628 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.59■■□□□ 1.85
PDE4D-204ENST00000358923 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PDE4D-204ENST00000358923 NEUROD1Q13562 356 aa26.57■■□□□ 1.84
PDE4D-204ENST00000358923 DISP1Q96F81 1524 aa26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-204ENST00000358923 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PDE4D-204ENST00000358923 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-204ENST00000358923 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-204ENST00000358923 MAP3K1Q13233 1512 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4D-204ENST00000358923 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.5■■□□□ 1.83
PDE4D-204ENST00000358923 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-204ENST00000358923 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA0556O60303 1618 aa26.43■■□□□ 1.82
PDE4D-204ENST00000358923 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PDE4D-204ENST00000358923 NCOA2Q15596 1464 aa26.41■■□□□ 1.82
PDE4D-204ENST00000358923 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-204ENST00000358923 NUP160Q12769 1436 aa26.4■■□□□ 1.82
PDE4D-204ENST00000358923 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.38■■□□□ 1.81
PDE4D-204ENST00000358923 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PDE4D-204ENST00000358923 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.35■■□□□ 1.81
PDE4D-204ENST00000358923 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PDE4D-204ENST00000358923 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PDE4D-204ENST00000358923 PTPRKQ15262 1439 aa26.32■■□□□ 1.8
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PDE4D-204ENST00000358923 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PDE4D-204ENST00000358923 HECW1Q76N89 1606 aa26.3■■□□□ 1.8
PDE4D-204ENST00000358923 CHD1O14646 1710 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4D-204ENST00000358923 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.28■■□□□ 1.8
PDE4D-204ENST00000358923 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.26■■□□□ 1.79
PDE4D-204ENST00000358923 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.26■■□□□ 1.79
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.24■■□□□ 1.79
PDE4D-204ENST00000358923 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-204ENST00000358923 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-204ENST00000358923 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.22■■□□□ 1.79
PDE4D-204ENST00000358923 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.21■■□□□ 1.79
PDE4D-204ENST00000358923 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PDE4D-204ENST00000358923 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.2■■□□□ 1.78
PDE4D-204ENST00000358923 PTPRGP23470 1445 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4D-204ENST00000358923 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PDE4D-204ENST00000358923 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.1■■□□□ 1.77
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF11O15085 1522 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.08■■□□□ 1.77
PDE4D-204ENST00000358923 ATP10BO94823 1461 aa26.07■■□□□ 1.76
PDE4D-204ENST00000358923 BCL11AQ9H165 835 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-204ENST00000358923 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PDE4D-204ENST00000358923 KIF14Q15058 1648 aa26.04■■□□□ 1.76
PDE4D-204ENST00000358923 KCNH8Q96L42 1107 aa26.04■■□□□ 1.76
PDE4D-204ENST00000358923 MAPKBP1O60336 1514 aa26.02■■□□□ 1.76
PDE4D-204ENST00000358923 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM52Q96A61 297 aa26■■□□□ 1.75
PDE4D-204ENST00000358923 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
PDE4D-204ENST00000358923 NAIPQ13075 1403 aa25.99■■□□□ 1.75
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PDE4D-204ENST00000358923 FOXD1Q16676 465 aa25.98■■□□□ 1.75
PDE4D-204ENST00000358923 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PDE4D-204ENST00000358923 ABCA8O94911 1581 aa25.98■■□□□ 1.75
PDE4D-204ENST00000358923 HFM1A2PYH4 1435 aa25.93■■□□□ 1.74
PDE4D-204ENST00000358923 KDM6BO15054 1643 aa25.92■■□□□ 1.74
PDE4D-204ENST00000358923 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
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