RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357658.4

SZT2-201, Transcript of SZT2, KICSTOR complex subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SZT2, Length 1,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2-201ENST00000357658 SHROOM2Q13796 1616 aa31.53■■■□□ 2.64
SZT2-201ENST00000357658 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.49■■■□□ 2.63
SZT2-201ENST00000357658 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.45■■■□□ 2.63
SZT2-201ENST00000357658 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
SZT2-201ENST00000357658 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.38■■■□□ 2.61
SZT2-201ENST00000357658 ARAP1Q96P48 1450 aa31.35■■■□□ 2.61
SZT2-201ENST00000357658 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.34■■■□□ 2.61
SZT2-201ENST00000357658 JPH4Q96JJ6 628 aa31.34■■■□□ 2.61
SZT2-201ENST00000357658 IQGAP2Q13576 1575 aa31.33■■■□□ 2.61
SZT2-201ENST00000357658 KIF21BO75037 1637 aa31.32■■■□□ 2.6
SZT2-201ENST00000357658 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
SZT2-201ENST00000357658 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.19■■■□□ 2.58
SZT2-201ENST00000357658 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.17■■■□□ 2.58
SZT2-201ENST00000357658 DISP1Q96F81 1524 aa31.13■■■□□ 2.57
SZT2-201ENST00000357658 GOLGA3Q08378 1498 aa31.08■■■□□ 2.57
SZT2-201ENST00000357658 KIAA0556O60303 1618 aa31.06■■■□□ 2.56
SZT2-201ENST00000357658 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.05■■■□□ 2.56
SZT2-201ENST00000357658 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.96■■■□□ 2.55
SZT2-201ENST00000357658 SAMD9Q5K651 1589 aa30.95■■■□□ 2.55
SZT2-201ENST00000357658 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.94■■■□□ 2.54
SZT2-201ENST00000357658 PTPRGP23470 1445 aa30.91■■■□□ 2.54
SZT2-201ENST00000357658 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
SZT2-201ENST00000357658 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.87■■■□□ 2.53
SZT2-201ENST00000357658 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.8■■■□□ 2.52
SZT2-201ENST00000357658 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
SZT2-201ENST00000357658 UACAQ9BZF9 1416 aa30.74■■■□□ 2.51
SZT2-201ENST00000357658 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.74■■■□□ 2.51
SZT2-201ENST00000357658 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
SZT2-201ENST00000357658 P3H3Q8IVL6 736 aa30.73■■■□□ 2.51
SZT2-201ENST00000357658 ABCC2Q92887 1545 aa30.73■■■□□ 2.51
SZT2-201ENST00000357658 ABCA8O94911 1581 aa30.71■■■□□ 2.51
SZT2-201ENST00000357658 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.7■■■□□ 2.5
SZT2-201ENST00000357658 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.7■■■□□ 2.5
SZT2-201ENST00000357658 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.69■■■□□ 2.5
SZT2-201ENST00000357658 MAPKBP1O60336 1514 aa30.61■■■□□ 2.49
SZT2-201ENST00000357658 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.61■■■□□ 2.49
SZT2-201ENST00000357658 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.58■■■□□ 2.49
SZT2-201ENST00000357658 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.57■■■□□ 2.48
SZT2-201ENST00000357658 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
SZT2-201ENST00000357658 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.54■■■□□ 2.48
SZT2-201ENST00000357658 CLIP1P30622 1438 aa30.52■■■□□ 2.48
SZT2-201ENST00000357658 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.48■■■□□ 2.47
SZT2-201ENST00000357658 FMN1Q68DA7 1419 aa30.46■■■□□ 2.47
SZT2-201ENST00000357658 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SZT2-201ENST00000357658 CEP162Q5TB80 1403 aa30.45■■■□□ 2.47
SZT2-201ENST00000357658 ASXL2Q76L83 1435 aa30.43■■■□□ 2.46
SZT2-201ENST00000357658 ATP10BO94823 1461 aa30.42■■■□□ 2.46
SZT2-201ENST00000357658 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.41■■■□□ 2.46
SZT2-201ENST00000357658 DIP2BQ9P265 1576 aa30.41■■■□□ 2.46
SZT2-201ENST00000357658 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
SZT2-201ENST00000357658 HECW1Q76N89 1606 aa30.34■■■□□ 2.45
SZT2-201ENST00000357658 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.32■■■□□ 2.45
SZT2-201ENST00000357658 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.32■■■□□ 2.44
SZT2-201ENST00000357658 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
SZT2-201ENST00000357658 ARID3CA6NKF2 412 aa30.32■■■□□ 2.44
SZT2-201ENST00000357658 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
SZT2-201ENST00000357658 GLI2P10070 1586 aa30.27■■■□□ 2.44
SZT2-201ENST00000357658 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.27■■■□□ 2.44
SZT2-201ENST00000357658 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
SZT2-201ENST00000357658 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.25■■■□□ 2.43
SZT2-201ENST00000357658 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.23■■■□□ 2.43
SZT2-201ENST00000357658 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.17■■■□□ 2.42
SZT2-201ENST00000357658 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SZT2-201ENST00000357658 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
SZT2-201ENST00000357658 TSPOAP1O95153 1857 aa30.15■■■□□ 2.42
SZT2-201ENST00000357658 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
SZT2-201ENST00000357658 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
SZT2-201ENST00000357658 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.12■■■□□ 2.41
SZT2-201ENST00000357658 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.11■■■□□ 2.41
SZT2-201ENST00000357658 KCNH8Q96L42 1107 aa30.09■■■□□ 2.41
SZT2-201ENST00000357658 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.09■■■□□ 2.41
SZT2-201ENST00000357658 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.08■■■□□ 2.41
SZT2-201ENST00000357658 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.07■■■□□ 2.4
SZT2-201ENST00000357658 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.02■■■□□ 2.4
SZT2-201ENST00000357658 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
SZT2-201ENST00000357658 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
SZT2-201ENST00000357658 CD109Q6YHK3 1445 aa29.98■■■□□ 2.39
SZT2-201ENST00000357658 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SZT2-201ENST00000357658 KIF14Q15058 1648 aa29.97■■■□□ 2.39
SZT2-201ENST00000357658 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.97■■■□□ 2.39
SZT2-201ENST00000357658 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.9■■■□□ 2.38
SZT2-201ENST00000357658 TIAM1Q13009 1591 aa29.88■■■□□ 2.37
SZT2-201ENST00000357658 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.83■■■□□ 2.37
SZT2-201ENST00000357658 MAP3K1Q13233 1512 aa29.83■■■□□ 2.37
SZT2-201ENST00000357658 KDM6BO15054 1643 aa29.82■■■□□ 2.36
SZT2-201ENST00000357658 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.81■■■□□ 2.36
SZT2-201ENST00000357658 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
SZT2-201ENST00000357658 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.78■■■□□ 2.36
SZT2-201ENST00000357658 PLCH2O75038 1416 aa29.77■■■□□ 2.36
SZT2-201ENST00000357658 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.77■■■□□ 2.36
SZT2-201ENST00000357658 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.76■■■□□ 2.35
SZT2-201ENST00000357658 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.76■■■□□ 2.35
SZT2-201ENST00000357658 NEO1Q92859 1461 aa29.75■■■□□ 2.35
SZT2-201ENST00000357658 PREX2Q70Z35 1606 aa29.73■■■□□ 2.35
SZT2-201ENST00000357658 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.73■■■□□ 2.35
SZT2-201ENST00000357658 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.73■■■□□ 2.35
SZT2-201ENST00000357658 FANCAO15360 1455 aa29.72■■■□□ 2.35
SZT2-201ENST00000357658 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.7■■■□□ 2.34
SZT2-201ENST00000357658 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
SZT2-201ENST00000357658 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms