RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 SYNJ2O15056 1496 aa11.42□□□□□ -0.58
CCR6-202ENST00000349984 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.42□□□□□ -0.58
CCR6-202ENST00000349984 CEP170Q5SW79 1584 aa11.4□□□□□ -0.58
CCR6-202ENST00000349984 EEA1Q15075 1411 aa11.4□□□□□ -0.58
CCR6-202ENST00000349984 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.4□□□□□ -0.58
CCR6-202ENST00000349984 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.38□□□□□ -0.59
CCR6-202ENST00000349984 GRIN2AQ12879 1464 aa11.38□□□□□ -0.59
CCR6-202ENST00000349984 ARAP1Q96P48 1450 aa11.36□□□□□ -0.59
CCR6-202ENST00000349984 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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CCR6-202ENST00000349984 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.33□□□□□ -0.6
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CCR6-202ENST00000349984 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.29□□□□□ -0.6
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CCR6-202ENST00000349984 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.27□□□□□ -0.61
CCR6-202ENST00000349984 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.24□□□□□ -0.61
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CCR6-202ENST00000349984 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CCR6-202ENST00000349984 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.19□□□□□ -0.62
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CCR6-202ENST00000349984 SAMD9Q5K651 1589 aa11.16□□□□□ -0.62
CCR6-202ENST00000349984 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CCR6-202ENST00000349984 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
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CCR6-202ENST00000349984 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.15□□□□□ -0.62
CCR6-202ENST00000349984 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.15□□□□□ -0.62
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CCR6-202ENST00000349984 PRXQ9BXM0 1461 aa11.11□□□□□ -0.63
CCR6-202ENST00000349984 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.11□□□□□ -0.63
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CCR6-202ENST00000349984 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.1□□□□□ -0.63
CCR6-202ENST00000349984 DISP1Q96F81 1524 aa11.1□□□□□ -0.63
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CCR6-202ENST00000349984 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.08□□□□□ -0.64
CCR6-202ENST00000349984 NEUROD1Q13562 356 aa11.07□□□□□ -0.64
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CCR6-202ENST00000349984 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.05□□□□□ -0.64
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CCR6-202ENST00000349984 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.04□□□□□ -0.64
CCR6-202ENST00000349984 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.04□□□□□ -0.64
CCR6-202ENST00000349984 PTPRGP23470 1445 aa11.03□□□□□ -0.64
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CCR6-202ENST00000349984 TNIKQ9UKE5 1360 aa11□□□□□ -0.65
CCR6-202ENST00000349984 TSPOAP1O95153 1857 aa11□□□□□ -0.65
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CCR6-202ENST00000349984 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.94□□□□□ -0.66
CCR6-202ENST00000349984 ABCA8O94911 1581 aa10.94□□□□□ -0.66
CCR6-202ENST00000349984 ASXL2Q76L83 1435 aa10.92□□□□□ -0.66
CCR6-202ENST00000349984 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
CCR6-202ENST00000349984 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.91□□□□□ -0.66
CCR6-202ENST00000349984 BCORL1Q5H9F3 1711 aa10.91□□□□□ -0.66
CCR6-202ENST00000349984 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.91□□□□□ -0.66
CCR6-202ENST00000349984 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.89□□□□□ -0.67
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CCR6-202ENST00000349984 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CCR6-202ENST00000349984 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.87□□□□□ -0.67
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CCR6-202ENST00000349984 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.86□□□□□ -0.67
CCR6-202ENST00000349984 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.86□□□□□ -0.67
CCR6-202ENST00000349984 REREQ9P2R6 1566 aa10.85□□□□□ -0.67
CCR6-202ENST00000349984 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.85□□□□□ -0.67
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CCR6-202ENST00000349984 ATP10BO94823 1461 aa10.85□□□□□ -0.67
CCR6-202ENST00000349984 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CCR6-202ENST00000349984 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
CCR6-202ENST00000349984 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
CCR6-202ENST00000349984 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.82□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.82□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.8□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 PLEKHG5O94827 1062 aa10.79□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 KDM6BO15054 1643 aa10.78□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 HECW1Q76N89 1606 aa10.78□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
CCR6-202ENST00000349984 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.75□□□□□ -0.69
CCR6-202ENST00000349984 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.74□□□□□ -0.69
CCR6-202ENST00000349984 CLIP1P30622 1438 aa10.74□□□□□ -0.69
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