RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349062.6

TRIM4-201, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 3,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-201ENST00000349062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.47■□□□□ 0.87
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TRIM4-201ENST00000349062 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TRIM4-201ENST00000349062 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.42■□□□□ 0.86
TRIM4-201ENST00000349062 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.4■□□□□ 0.86
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TRIM4-201ENST00000349062 ERCC6Q03468 1493 aa20.33■□□□□ 0.84
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TRIM4-201ENST00000349062 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.29■□□□□ 0.84
TRIM4-201ENST00000349062 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRIM4-201ENST00000349062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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TRIM4-201ENST00000349062 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.24■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.23■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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TRIM4-201ENST00000349062 TIAM1Q13009 1591 aa20.2■□□□□ 0.82
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TRIM4-201ENST00000349062 CUL7Q14999 1698 aa20.09■□□□□ 0.81
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TRIM4-201ENST00000349062 GRIN2BQ13224 1484 aa20.02■□□□□ 0.8
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TRIM4-201ENST00000349062 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.01■□□□□ 0.79
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TRIM4-201ENST00000349062 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.99■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
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TRIM4-201ENST00000349062 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
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TRIM4-201ENST00000349062 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.86■□□□□ 0.77
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TRIM4-201ENST00000349062 ADAMTS12P58397 1594 aa19.84■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 KCNH8Q96L42 1107 aa19.84■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.82■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 GRIN2AQ12879 1464 aa19.81■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.81■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 MAPKBP1O60336 1514 aa19.81■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 SAMD9Q5K651 1589 aa19.8■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.79■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 WDR62O43379 1518 aa19.78■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.77■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.76■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.76■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.76■□□□□ 0.75
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TRIM4-201ENST00000349062 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 NAIPQ13075 1403 aa19.71■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.71■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.71■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 DISP1Q96F81 1524 aa19.71■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 HECW1Q76N89 1606 aa19.69■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.68■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.68■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 SYNJ2O15056 1496 aa19.67■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.67■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 HFM1A2PYH4 1435 aa19.66■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.64■□□□□ 0.73
TRIM4-201ENST00000349062 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.63■□□□□ 0.731e-7■■■■□ 20.2
TRIM4-201ENST00000349062 CEP170Q5SW79 1584 aa19.62■□□□□ 0.73
TRIM4-201ENST00000349062 KIAA0556O60303 1618 aa19.62■□□□□ 0.73
TRIM4-201ENST00000349062 UACAQ9BZF9 1416 aa19.62■□□□□ 0.73
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