RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 IGF1RP08069 1367 aa27.69■■■□□ 2.02
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SYCE1-202ENST00000343131 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.62■■■□□ 2.01
SYCE1-202ENST00000343131 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.59■■■□□ 2.01
SYCE1-202ENST00000343131 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.53■■■□□ 2
SYCE1-202ENST00000343131 IQGAP2Q13576 1575 aa27.5■■□□□ 1.99
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SYCE1-202ENST00000343131 DIP2BQ9P265 1576 aa27.43■■□□□ 1.98
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SYCE1-202ENST00000343131 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.35■■□□□ 1.97
SYCE1-202ENST00000343131 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.34■■□□□ 1.97
SYCE1-202ENST00000343131 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.32■■□□□ 1.96
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SYCE1-202ENST00000343131 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
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SYCE1-202ENST00000343131 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
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SYCE1-202ENST00000343131 KIAA0556O60303 1618 aa27.27■■□□□ 1.96
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SYCE1-202ENST00000343131 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.27■■□□□ 1.96
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SYCE1-202ENST00000343131 ABCC2Q92887 1545 aa27.23■■□□□ 1.95
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SYCE1-202ENST00000343131 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
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SYCE1-202ENST00000343131 ASXL2Q76L83 1435 aa27.12■■□□□ 1.93
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SYCE1-202ENST00000343131 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27■■□□□ 1.91
SYCE1-202ENST00000343131 ABCA8O94911 1581 aa26.97■■□□□ 1.91
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SYCE1-202ENST00000343131 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.79■■□□□ 1.88
SYCE1-202ENST00000343131 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.79■■□□□ 1.88
SYCE1-202ENST00000343131 EEA1Q15075 1411 aa26.78■■□□□ 1.88
SYCE1-202ENST00000343131 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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SYCE1-202ENST00000343131 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.74■■□□□ 1.87
SYCE1-202ENST00000343131 KIF21BO75037 1637 aa26.72■■□□□ 1.87
SYCE1-202ENST00000343131 ARID3CA6NKF2 412 aa26.69■■□□□ 1.86
SYCE1-202ENST00000343131 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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SYCE1-202ENST00000343131 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.65■■□□□ 1.86
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SYCE1-202ENST00000343131 CD109Q6YHK3 1445 aa26.64■■□□□ 1.85
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SYCE1-202ENST00000343131 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.44■■□□□ 1.82
SYCE1-202ENST00000343131 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.43■■□□□ 1.82
SYCE1-202ENST00000343131 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
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SYCE1-202ENST00000343131 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SYCE1-202ENST00000343131 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.4■■□□□ 1.82
SYCE1-202ENST00000343131 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.4■■□□□ 1.82
SYCE1-202ENST00000343131 NEO1Q92859 1461 aa26.36■■□□□ 1.81
SYCE1-202ENST00000343131 HECW1Q76N89 1606 aa26.34■■□□□ 1.81
SYCE1-202ENST00000343131 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.33■■□□□ 1.81
SYCE1-202ENST00000343131 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.32■■□□□ 1.8
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SYCE1-202ENST00000343131 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.3■■□□□ 1.8
SYCE1-202ENST00000343131 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.27■■□□□ 1.8
SYCE1-202ENST00000343131 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.25■■□□□ 1.79
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.24■■□□□ 1.79
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SYCE1-202ENST00000343131 RAPGEF3O95398 923 aa26.24■■□□□ 1.79
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SYCE1-202ENST00000343131 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SYCE1-202ENST00000343131 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.14■■□□□ 1.78
SYCE1-202ENST00000343131 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SYCE1-202ENST00000343131 MADDQ8WXG6 1647 aa26.14■■□□□ 1.77
SYCE1-202ENST00000343131 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.13■■□□□ 1.77
SYCE1-202ENST00000343131 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.08■■□□□ 1.77
SYCE1-202ENST00000343131 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SYCE1-202ENST00000343131 PLCH2O75038 1416 aa26.05■■□□□ 1.76
SYCE1-202ENST00000343131 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SYCE1-202ENST00000343131 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.05■■□□□ 1.76
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