RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342892.4

PKP4-AS1-201, PKP4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PKP4-AS1, Length 4,067 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-AS1-201ENST00000342892 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.31□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.29□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 FMN1Q68DA7 1419 aa11.29□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.29□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.28□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.28□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.28□□□□□ -0.6
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.27□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.22□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.22□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PKP4-AS1-201ENST00000342892 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.21□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 SAMD9Q5K651 1589 aa11.2□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 P3H3Q8IVL6 736 aa11.2□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.19□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ITGAEP38570 1179 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 PBRM1Q86U86 1689 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-AS1-201ENST00000342892 GRIN2BQ13224 1484 aa11.15□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.15□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 IFT140Q96RY7 1462 aa11.15□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ADAMTS12P58397 1594 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 IQGAP2Q13576 1575 aa11.11□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.11□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 HECW1Q76N89 1606 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 WDR62O43379 1518 aa11.1□□□□□ -0.63
PKP4-AS1-201ENST00000342892 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.07□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 NCOA2Q15596 1464 aa11.06□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.06□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 MAPKBP1O60336 1514 aa11.05□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ERCC6Q03468 1493 aa11.03□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.03□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 HFM1A2PYH4 1435 aa11.03□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 NEUROD1Q13562 356 aa11.03□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 MIER1Q8N108 512 aa11.02□□□□□ -0.64
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ARHGEF11O15085 1522 aa11.01□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 MIA2Q96PC5 1412 aa11.01□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.01□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 UACAQ9BZF9 1416 aa11□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 GRIN2AQ12879 1464 aa10.99□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 AKNAQ7Z591 1439 aa10.99□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 KIAA0556O60303 1618 aa10.97□□□□□ -0.65
PKP4-AS1-201ENST00000342892 TONSLQ96HA7 1378 aa10.96□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 SYNJ2O15056 1496 aa10.95□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 NAIPQ13075 1403 aa10.95□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.94□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.94□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.93□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.93□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.93□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 DISP1Q96F81 1524 aa10.93□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.92□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 PTPRKQ15262 1439 aa10.91□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ROCK1Q13464 1354 aa10.9□□□□□ -0.66
PKP4-AS1-201ENST00000342892 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 NUP160Q12769 1436 aa10.87□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.87□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 TRIM52Q96A61 297 aa10.86□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CEP170Q5SW79 1584 aa10.86□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.85□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 DAPK1P53355 1430 aa10.85□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 FBLN2P98095 1184 aa10.84□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.84□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.84□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 JPH4Q96JJ6 628 aa10.84□□□□□ -0.67
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ARID3CA6NKF2 412 aa10.81□□□□□ -0.68
PKP4-AS1-201ENST00000342892 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PKP4-AS1-201ENST00000342892 ABCC5O15440 1437 aa10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms