RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340833.4

CDC25B-202, Transcript of cell division cycle 25B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC25B, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25B-202ENST00000340833 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.23■■■□□ 2.43
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CDC25B-202ENST00000340833 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.22■■■□□ 2.43
CDC25B-202ENST00000340833 ARHGEF11O15085 1522 aa30.21■■■□□ 2.43
CDC25B-202ENST00000340833 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.2■■■□□ 2.43
CDC25B-202ENST00000340833 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.2■■■□□ 2.43
CDC25B-202ENST00000340833 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.2■■■□□ 2.43
CDC25B-202ENST00000340833 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.19■■■□□ 2.42
CDC25B-202ENST00000340833 IQGAP2Q13576 1575 aa30.17■■■□□ 2.42
CDC25B-202ENST00000340833 JPH4Q96JJ6 628 aa30.11■■■□□ 2.41
CDC25B-202ENST00000340833 GOLGA3Q08378 1498 aa30.08■■■□□ 2.41
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CDC25B-202ENST00000340833 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.83■■■□□ 2.37
CDC25B-202ENST00000340833 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.83■■■□□ 2.37
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CDC25B-202ENST00000340833 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.75■■■□□ 2.35
CDC25B-202ENST00000340833 PTPRGP23470 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
CDC25B-202ENST00000340833 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.69■■■□□ 2.34
CDC25B-202ENST00000340833 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.68■■■□□ 2.34
CDC25B-202ENST00000340833 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.68■■■□□ 2.34
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CDC25B-202ENST00000340833 CEP162Q5TB80 1403 aa29.56■■■□□ 2.32
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CDC25B-202ENST00000340833 ABCA8O94911 1581 aa29.53■■■□□ 2.32
CDC25B-202ENST00000340833 ABCC2Q92887 1545 aa29.52■■■□□ 2.32
CDC25B-202ENST00000340833 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.48■■■□□ 2.31
CDC25B-202ENST00000340833 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.46■■■□□ 2.31
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CDC25B-202ENST00000340833 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.37■■■□□ 2.29
CDC25B-202ENST00000340833 FMN1Q68DA7 1419 aa29.37■■■□□ 2.29
CDC25B-202ENST00000340833 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CDC25B-202ENST00000340833 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CDC25B-202ENST00000340833 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.31■■■□□ 2.28
CDC25B-202ENST00000340833 MAPKBP1O60336 1514 aa29.3■■■□□ 2.28
CDC25B-202ENST00000340833 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
CDC25B-202ENST00000340833 ATP10BO94823 1461 aa29.28■■■□□ 2.28
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CDC25B-202ENST00000340833 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CDC25B-202ENST00000340833 ASXL2Q76L83 1435 aa29.23■■■□□ 2.27
CDC25B-202ENST00000340833 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CDC25B-202ENST00000340833 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.22■■■□□ 2.27
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CDC25B-202ENST00000340833 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.12■■■□□ 2.25
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CDC25B-202ENST00000340833 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.11■■■□□ 2.25
CDC25B-202ENST00000340833 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.04■■■□□ 2.24
CDC25B-202ENST00000340833 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.03■■■□□ 2.24
CDC25B-202ENST00000340833 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.01■■■□□ 2.23
CDC25B-202ENST00000340833 KCNH8Q96L42 1107 aa29.01■■■□□ 2.23
CDC25B-202ENST00000340833 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.97■■■□□ 2.23
CDC25B-202ENST00000340833 GLI2P10070 1586 aa28.97■■■□□ 2.23
CDC25B-202ENST00000340833 TSPOAP1O95153 1857 aa28.96■■■□□ 2.23
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CDC25B-202ENST00000340833 KIF14Q15058 1648 aa28.94■■■□□ 2.22
CDC25B-202ENST00000340833 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.93■■■□□ 2.22
CDC25B-202ENST00000340833 TIAM1Q13009 1591 aa28.92■■■□□ 2.22
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CDC25B-202ENST00000340833 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.89■■■□□ 2.22
CDC25B-202ENST00000340833 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.89■■■□□ 2.22
CDC25B-202ENST00000340833 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
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CDC25B-202ENST00000340833 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.79■■■□□ 2.2
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CDC25B-202ENST00000340833 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.67■■■□□ 2.18
CDC25B-202ENST00000340833 NCOA2Q15596 1464 aa28.64■■■□□ 2.18
CDC25B-202ENST00000340833 PREX2Q70Z35 1606 aa28.64■■■□□ 2.18
CDC25B-202ENST00000340833 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.64■■■□□ 2.18
CDC25B-202ENST00000340833 PLCH2O75038 1416 aa28.63■■■□□ 2.17
CDC25B-202ENST00000340833 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
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CDC25B-202ENST00000340833 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
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