RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329146.8

CRIP2-201, Transcript of cysteine rich protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP2, Length 1,857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2-201ENST00000329146 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.58■■■■■ 4.89
CRIP2-201ENST00000329146 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.53■■■■■ 4.88
CRIP2-201ENST00000329146 SYNJ2O15056 1496 aa45.43■■■■■ 4.86
CRIP2-201ENST00000329146 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
CRIP2-201ENST00000329146 GRIN2AQ12879 1464 aa45.39■■■■■ 4.86
CRIP2-201ENST00000329146 FBLN2P98095 1184 aa45.36■■■■■ 4.85
CRIP2-201ENST00000329146 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.36■■■■■ 4.85
CRIP2-201ENST00000329146 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
CRIP2-201ENST00000329146 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.25■■■■■ 4.84
CRIP2-201ENST00000329146 APLP2Q06481 763 aa45.2■■■■■ 4.83
CRIP2-201ENST00000329146 ARAP1Q96P48 1450 aa45.19■■■■■ 4.82
CRIP2-201ENST00000329146 CEP170Q5SW79 1584 aa45.13■■■■■ 4.81
CRIP2-201ENST00000329146 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
CRIP2-201ENST00000329146 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.1■■■■■ 4.81
CRIP2-201ENST00000329146 IQGAP2Q13576 1575 aa45.1■■■■■ 4.81
CRIP2-201ENST00000329146 NUP160Q12769 1436 aa45.08■■■■■ 4.81
CRIP2-201ENST00000329146 P3H3Q8IVL6 736 aa45.06■■■■■ 4.8
CRIP2-201ENST00000329146 CHD1O14646 1710 aa45.03■■■■■ 4.8
CRIP2-201ENST00000329146 EFCAB5A4FU69 1503 aa45■■■■■ 4.79
CRIP2-201ENST00000329146 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.94■■■■■ 4.79
CRIP2-201ENST00000329146 SAMD9Q5K651 1589 aa44.94■■■■■ 4.78
CRIP2-201ENST00000329146 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.89■■■■■ 4.78
CRIP2-201ENST00000329146 JPH4Q96JJ6 628 aa44.77■■■■■ 4.76
CRIP2-201ENST00000329146 DISP1Q96F81 1524 aa44.74■■■■■ 4.75
CRIP2-201ENST00000329146 KIAA0556O60303 1618 aa44.66■■■■■ 4.74
CRIP2-201ENST00000329146 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
CRIP2-201ENST00000329146 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
CRIP2-201ENST00000329146 FMN1Q68DA7 1419 aa44.63■■■■■ 4.73
CRIP2-201ENST00000329146 MAP3K1Q13233 1512 aa44.6■■■■■ 4.73
CRIP2-201ENST00000329146 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
CRIP2-201ENST00000329146 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.54■■■■■ 4.72
CRIP2-201ENST00000329146 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
CRIP2-201ENST00000329146 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.52■■■■■ 4.72
CRIP2-201ENST00000329146 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.52■■■■■ 4.72
CRIP2-201ENST00000329146 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
CRIP2-201ENST00000329146 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
CRIP2-201ENST00000329146 SHROOM2Q13796 1616 aa44.47■■■■■ 4.71
CRIP2-201ENST00000329146 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.47■■■■■ 4.71
CRIP2-201ENST00000329146 TIAM1Q13009 1591 aa44.4■■■■■ 4.7
CRIP2-201ENST00000329146 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
CRIP2-201ENST00000329146 OSCARQ8IYS5 282 aa44.36■■■■■ 4.69
CRIP2-201ENST00000329146 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
CRIP2-201ENST00000329146 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.31■■■■■ 4.68
CRIP2-201ENST00000329146 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.22■■■■■ 4.67
CRIP2-201ENST00000329146 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.21■■■■■ 4.67
CRIP2-201ENST00000329146 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.2■■■■■ 4.67
CRIP2-201ENST00000329146 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.2■■■■■ 4.67
CRIP2-201ENST00000329146 HECW1Q76N89 1606 aa44.18■■■■■ 4.66
CRIP2-201ENST00000329146 PTPRGP23470 1445 aa44.18■■■■■ 4.66
CRIP2-201ENST00000329146 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.16■■■■■ 4.66
CRIP2-201ENST00000329146 ARID3CA6NKF2 412 aa44.13■■■■■ 4.66
CRIP2-201ENST00000329146 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.13■■■■■ 4.65
CRIP2-201ENST00000329146 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
CRIP2-201ENST00000329146 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
CRIP2-201ENST00000329146 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.06■■■■■ 4.64
CRIP2-201ENST00000329146 ABCA8O94911 1581 aa44.05■■■■■ 4.64
CRIP2-201ENST00000329146 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
CRIP2-201ENST00000329146 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.92■■■■■ 4.62
CRIP2-201ENST00000329146 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.91■■■■■ 4.62
CRIP2-201ENST00000329146 UACAQ9BZF9 1416 aa43.9■■■■■ 4.62
CRIP2-201ENST00000329146 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.85■■■■■ 4.61
CRIP2-201ENST00000329146 ATP10BO94823 1461 aa43.8■■■■■ 4.6
CRIP2-201ENST00000329146 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.8■■■■■ 4.6
CRIP2-201ENST00000329146 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.78■■■■■ 4.6
CRIP2-201ENST00000329146 ABCC2Q92887 1545 aa43.75■■■■■ 4.59
CRIP2-201ENST00000329146 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
CRIP2-201ENST00000329146 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.7■■■■■ 4.59
CRIP2-201ENST00000329146 NCOA2Q15596 1464 aa43.68■■■■■ 4.58
CRIP2-201ENST00000329146 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.66■■■■■ 4.58
CRIP2-201ENST00000329146 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
CRIP2-201ENST00000329146 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
CRIP2-201ENST00000329146 ARHGEF11O15085 1522 aa43.62■■■■■ 4.57
CRIP2-201ENST00000329146 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
CRIP2-201ENST00000329146 ITGAEP38570 1179 aa43.57■■■■■ 4.57
CRIP2-201ENST00000329146 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.57■■■■■ 4.56
CRIP2-201ENST00000329146 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
CRIP2-201ENST00000329146 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.54■■■■■ 4.56
CRIP2-201ENST00000329146 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.5■■■■■ 4.55
CRIP2-201ENST00000329146 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.49■■■■■ 4.55
CRIP2-201ENST00000329146 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.46■■■■■ 4.55
CRIP2-201ENST00000329146 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.46■■■■■ 4.55
CRIP2-201ENST00000329146 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
CRIP2-201ENST00000329146 KIF14Q15058 1648 aa43.43■■■■■ 4.54
CRIP2-201ENST00000329146 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.43■■■■■ 4.54
CRIP2-201ENST00000329146 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
CRIP2-201ENST00000329146 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
CRIP2-201ENST00000329146 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
CRIP2-201ENST00000329146 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.29■■■■■ 4.52
CRIP2-201ENST00000329146 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.27■■■■■ 4.52
CRIP2-201ENST00000329146 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
CRIP2-201ENST00000329146 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
CRIP2-201ENST00000329146 MIA2Q96PC5 1412 aa43.22■■■■■ 4.51
CRIP2-201ENST00000329146 KCNH8Q96L42 1107 aa43.22■■■■■ 4.51
CRIP2-201ENST00000329146 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.21■■■■■ 4.51
CRIP2-201ENST00000329146 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.16■■■■■ 4.5
CRIP2-201ENST00000329146 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
CRIP2-201ENST00000329146 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
CRIP2-201ENST00000329146 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.11■■■■■ 4.49
CRIP2-201ENST00000329146 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.11■■■■■ 4.49
CRIP2-201ENST00000329146 ASXL2Q76L83 1435 aa43.11■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms