RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328957.12

GALNT9-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT9, Length 2,410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT9-201ENST00000328957 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.51■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 MAP3K1Q13233 1512 aa25.5■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.5■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.48■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.47■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.47■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
GALNT9-201ENST00000328957 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.43■■□□□ 1.66
GALNT9-201ENST00000328957 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.42■■□□□ 1.66
GALNT9-201ENST00000328957 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.42■■□□□ 1.66
GALNT9-201ENST00000328957 CUL7Q14999 1698 aa25.38■■□□□ 1.65
GALNT9-201ENST00000328957 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.38■■□□□ 1.65
GALNT9-201ENST00000328957 WDR97A6NE52 1622 aa25.37■■□□□ 1.65
GALNT9-201ENST00000328957 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.36■■□□□ 1.65
GALNT9-201ENST00000328957 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
GALNT9-201ENST00000328957 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
GALNT9-201ENST00000328957 MAPKBP1O60336 1514 aa25.33■■□□□ 1.65
GALNT9-201ENST00000328957 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.32■■□□□ 1.64
GALNT9-201ENST00000328957 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.3■■□□□ 1.64
GALNT9-201ENST00000328957 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.29■■□□□ 1.64
GALNT9-201ENST00000328957 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.29■■□□□ 1.64
GALNT9-201ENST00000328957 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.28■■□□□ 1.64
GALNT9-201ENST00000328957 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.24■■□□□ 1.63
GALNT9-201ENST00000328957 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.23■■□□□ 1.63
GALNT9-201ENST00000328957 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
GALNT9-201ENST00000328957 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.21■■□□□ 1.63
GALNT9-201ENST00000328957 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.2■■□□□ 1.62
GALNT9-201ENST00000328957 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.17■■□□□ 1.62
GALNT9-201ENST00000328957 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.16■■□□□ 1.62
GALNT9-201ENST00000328957 FMN1Q68DA7 1419 aa25.16■■□□□ 1.62
GALNT9-201ENST00000328957 SAMD9Q5K651 1589 aa25.15■■□□□ 1.62
GALNT9-201ENST00000328957 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GALNT9-201ENST00000328957 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.09■■□□□ 1.61
GALNT9-201ENST00000328957 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.07■■□□□ 1.6
GALNT9-201ENST00000328957 GRIN2BQ13224 1484 aa25.06■■□□□ 1.6
GALNT9-201ENST00000328957 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
GALNT9-201ENST00000328957 PTPRKQ15262 1439 aa25.04■■□□□ 1.6
GALNT9-201ENST00000328957 NCOA2Q15596 1464 aa24.99■■□□□ 1.59
GALNT9-201ENST00000328957 PBRM1Q86U86 1689 aa24.98■■□□□ 1.59
GALNT9-201ENST00000328957 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.96■■□□□ 1.59
GALNT9-201ENST00000328957 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.92■■□□□ 1.58
GALNT9-201ENST00000328957 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.92■■□□□ 1.58
GALNT9-201ENST00000328957 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GALNT9-201ENST00000328957 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GALNT9-201ENST00000328957 KCNH8Q96L42 1107 aa24.9■■□□□ 1.58
GALNT9-201ENST00000328957 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.89■■□□□ 1.58
GALNT9-201ENST00000328957 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.89■■□□□ 1.58
GALNT9-201ENST00000328957 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 ADAMTS12P58397 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 HFM1A2PYH4 1435 aa24.88■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.87■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.86■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 ARID3CA6NKF2 412 aa24.85■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 IQGAP2Q13576 1575 aa24.85■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 NAIPQ13075 1403 aa24.85■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 ARHGEF11O15085 1522 aa24.84■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
GALNT9-201ENST00000328957 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.81■■□□□ 1.56
GALNT9-201ENST00000328957 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
GALNT9-201ENST00000328957 UACAQ9BZF9 1416 aa24.81■■□□□ 1.56
GALNT9-201ENST00000328957 HECW1Q76N89 1606 aa24.79■■□□□ 1.56
GALNT9-201ENST00000328957 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.78■■□□□ 1.56
GALNT9-201ENST00000328957 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GALNT9-201ENST00000328957 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.77■■□□□ 1.56
GALNT9-201ENST00000328957 WDR62O43379 1518 aa24.74■■□□□ 1.55
GALNT9-201ENST00000328957 TONSLQ96HA7 1378 aa24.73■■□□□ 1.55
GALNT9-201ENST00000328957 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GALNT9-201ENST00000328957 KDM6BO15054 1643 aa24.7■■□□□ 1.54
GALNT9-201ENST00000328957 IFT140Q96RY7 1462 aa24.69■■□□□ 1.54
GALNT9-201ENST00000328957 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GALNT9-201ENST00000328957 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.65■■□□□ 1.54
GALNT9-201ENST00000328957 DISP1Q96F81 1524 aa24.64■■□□□ 1.53
GALNT9-201ENST00000328957 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.63■■□□□ 1.53
GALNT9-201ENST00000328957 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GALNT9-201ENST00000328957 KIAA0556O60303 1618 aa24.61■■□□□ 1.53
GALNT9-201ENST00000328957 TRIM52Q96A61 297 aa24.6■■□□□ 1.53
GALNT9-201ENST00000328957 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.59■■□□□ 1.53
GALNT9-201ENST00000328957 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GALNT9-201ENST00000328957 MIA2Q96PC5 1412 aa24.58■■□□□ 1.52
GALNT9-201ENST00000328957 GRIN2AQ12879 1464 aa24.56■■□□□ 1.52
GALNT9-201ENST00000328957 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GALNT9-201ENST00000328957 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GALNT9-201ENST00000328957 FOXD1Q16676 465 aa24.54■■□□□ 1.52
GALNT9-201ENST00000328957 AKNAQ7Z591 1439 aa24.52■■□□□ 1.52
GALNT9-201ENST00000328957 MYT1Q01538 1121 aa24.52■■□□□ 1.52
GALNT9-201ENST00000328957 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.51■■□□□ 1.51
GALNT9-201ENST00000328957 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.5■■□□□ 1.51
GALNT9-201ENST00000328957 DAPK1P53355 1430 aa24.48■■□□□ 1.51
GALNT9-201ENST00000328957 ANP32CO43423 234 aa24.47■■□□□ 1.51
GALNT9-201ENST00000328957 ABCC5O15440 1437 aa24.46■■□□□ 1.51
GALNT9-201ENST00000328957 ERCC6Q03468 1493 aa24.46■■□□□ 1.51
GALNT9-201ENST00000328957 CEP170Q5SW79 1584 aa24.45■■□□□ 1.5
GALNT9-201ENST00000328957 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GALNT9-201ENST00000328957 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms