RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.66■■■■□ 3.62
TMIE-201ENST00000326431 ARAP1Q96P48 1450 aa37.64■■■■□ 3.62
TMIE-201ENST00000326431 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.57■■■■□ 3.6
TMIE-201ENST00000326431 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
TMIE-201ENST00000326431 IQGAP2Q13576 1575 aa37.52■■■■□ 3.6
TMIE-201ENST00000326431 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.5■■■■□ 3.59
TMIE-201ENST00000326431 FBLN2P98095 1184 aa37.49■■■■□ 3.59
TMIE-201ENST00000326431 CEP170Q5SW79 1584 aa37.48■■■■□ 3.59
TMIE-201ENST00000326431 CHD1O14646 1710 aa37.46■■■■□ 3.59
TMIE-201ENST00000326431 SAMD9Q5K651 1589 aa37.44■■■■□ 3.58
TMIE-201ENST00000326431 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.42■■■■□ 3.58
TMIE-201ENST00000326431 NUP160Q12769 1436 aa37.39■■■■□ 3.58
TMIE-201ENST00000326431 P3H3Q8IVL6 736 aa37.36■■■■□ 3.57
TMIE-201ENST00000326431 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.34■■■■□ 3.57
TMIE-201ENST00000326431 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.32■■■■□ 3.56
TMIE-201ENST00000326431 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
TMIE-201ENST00000326431 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
TMIE-201ENST00000326431 KIAA0556O60303 1618 aa37.15■■■■□ 3.54
TMIE-201ENST00000326431 DISP1Q96F81 1524 aa37.15■■■■□ 3.54
TMIE-201ENST00000326431 FMN1Q68DA7 1419 aa37.12■■■■□ 3.53
TMIE-201ENST00000326431 APLP2Q06481 763 aa37.11■■■■□ 3.53
TMIE-201ENST00000326431 JPH4Q96JJ6 628 aa37.06■■■■□ 3.52
TMIE-201ENST00000326431 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
TMIE-201ENST00000326431 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.04■■■■□ 3.52
TMIE-201ENST00000326431 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.04■■■■□ 3.52
TMIE-201ENST00000326431 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
TMIE-201ENST00000326431 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.99■■■■□ 3.51
TMIE-201ENST00000326431 TIAM1Q13009 1591 aa36.96■■■■□ 3.51
TMIE-201ENST00000326431 SHROOM2Q13796 1616 aa36.96■■■■□ 3.51
TMIE-201ENST00000326431 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.95■■■■□ 3.51
TMIE-201ENST00000326431 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.95■■■■□ 3.51
TMIE-201ENST00000326431 MAP3K1Q13233 1512 aa36.94■■■■□ 3.5
TMIE-201ENST00000326431 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.94■■■■□ 3.5
TMIE-201ENST00000326431 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.94■■■■□ 3.5
TMIE-201ENST00000326431 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
TMIE-201ENST00000326431 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
TMIE-201ENST00000326431 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
TMIE-201ENST00000326431 HECW1Q76N89 1606 aa36.83■■■■□ 3.49
TMIE-201ENST00000326431 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.78■■■■□ 3.48
TMIE-201ENST00000326431 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.76■■■■□ 3.48
TMIE-201ENST00000326431 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.73■■■■□ 3.47
TMIE-201ENST00000326431 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.69■■■■□ 3.46
TMIE-201ENST00000326431 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
TMIE-201ENST00000326431 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.67■■■■□ 3.46
TMIE-201ENST00000326431 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
TMIE-201ENST00000326431 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
TMIE-201ENST00000326431 ABCA8O94911 1581 aa36.62■■■■□ 3.45
TMIE-201ENST00000326431 OSCARQ8IYS5 282 aa36.6■■■■□ 3.45
TMIE-201ENST00000326431 PTPRGP23470 1445 aa36.6■■■■□ 3.45
TMIE-201ENST00000326431 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.54■■■■□ 3.44
TMIE-201ENST00000326431 ARID3CA6NKF2 412 aa36.53■■■■□ 3.44
TMIE-201ENST00000326431 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.52■■■■□ 3.44
TMIE-201ENST00000326431 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.51■■■■□ 3.44
TMIE-201ENST00000326431 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
TMIE-201ENST00000326431 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.41■■■■□ 3.42
TMIE-201ENST00000326431 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
TMIE-201ENST00000326431 UACAQ9BZF9 1416 aa36.4■■■■□ 3.42
TMIE-201ENST00000326431 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TMIE-201ENST00000326431 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
TMIE-201ENST00000326431 NCOA2Q15596 1464 aa36.35■■■■□ 3.41
TMIE-201ENST00000326431 ATP10BO94823 1461 aa36.34■■■■□ 3.41
TMIE-201ENST00000326431 ABCC2Q92887 1545 aa36.33■■■■□ 3.41
TMIE-201ENST00000326431 ARHGEF11O15085 1522 aa36.31■■■■□ 3.4
TMIE-201ENST00000326431 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.28■■■■□ 3.4
TMIE-201ENST00000326431 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
TMIE-201ENST00000326431 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TMIE-201ENST00000326431 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.23■■■■□ 3.39
TMIE-201ENST00000326431 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.2■■■■□ 3.39
TMIE-201ENST00000326431 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.18■■■■□ 3.38
TMIE-201ENST00000326431 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.16■■■■□ 3.38
TMIE-201ENST00000326431 KIF14Q15058 1648 aa36.16■■■■□ 3.38
TMIE-201ENST00000326431 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.12■■■■□ 3.37
TMIE-201ENST00000326431 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.1■■■■□ 3.37
TMIE-201ENST00000326431 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.05■■■■□ 3.36
TMIE-201ENST00000326431 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
TMIE-201ENST00000326431 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.36
TMIE-201ENST00000326431 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.99■■■■□ 3.35
TMIE-201ENST00000326431 MIA2Q96PC5 1412 aa35.97■■■■□ 3.35
TMIE-201ENST00000326431 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.96■■■■□ 3.35
TMIE-201ENST00000326431 ITGAEP38570 1179 aa35.96■■■■□ 3.35
TMIE-201ENST00000326431 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.95■■■■□ 3.35
TMIE-201ENST00000326431 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.95■■■■□ 3.35
TMIE-201ENST00000326431 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.95■■■■□ 3.35
TMIE-201ENST00000326431 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.95■■■■□ 3.35
TMIE-201ENST00000326431 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
TMIE-201ENST00000326431 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
TMIE-201ENST00000326431 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.33
TMIE-201ENST00000326431 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.83■■■■□ 3.33
TMIE-201ENST00000326431 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.79■■■■□ 3.32
TMIE-201ENST00000326431 PREX2Q70Z35 1606 aa35.78■■■■□ 3.32
TMIE-201ENST00000326431 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
TMIE-201ENST00000326431 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.76■■■■□ 3.32
TMIE-201ENST00000326431 KCNH8Q96L42 1107 aa35.76■■■■□ 3.31
TMIE-201ENST00000326431 PTPRKQ15262 1439 aa35.76■■■■□ 3.31
TMIE-201ENST00000326431 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.75■■■■□ 3.31
TMIE-201ENST00000326431 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.74■■■■□ 3.31
TMIE-201ENST00000326431 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
TMIE-201ENST00000326431 HRCP23327 699 aa35.72■■■■□ 3.31
TMIE-201ENST00000326431 ASXL2Q76L83 1435 aa35.71■■■■□ 3.31
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