RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.29■■■□□ 2.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 JPH4Q96JJ6 628 aa33.24■■■□□ 2.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.2■■■□□ 2.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQGAP2Q13576 1575 aa33.11■■■□□ 2.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRXQ9BXM0 1461 aa33.06■■■□□ 2.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.99■■■□□ 2.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEA1Q15075 1411 aa32.94■■■□□ 2.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.93■■■□□ 2.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.91■■■□□ 2.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.9■■■□□ 2.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 DISP1Q96F81 1524 aa32.9■■■□□ 2.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.88■■■□□ 2.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.87■■■□□ 2.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.83■■■□□ 2.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0556O60303 1618 aa32.83■■■□□ 2.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRGP23470 1445 aa32.81■■■□□ 2.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF21BO75037 1637 aa32.69■■■□□ 2.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPKBP1O60336 1514 aa32.69■■■□□ 2.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA3Q08378 1498 aa32.67■■■□□ 2.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.63■■■□□ 2.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.63■■■□□ 2.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC2Q92887 1545 aa32.61■■■□□ 2.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 UACAQ9BZF9 1416 aa32.61■■■□□ 2.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.61■■■□□ 2.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMD9Q5K651 1589 aa32.55■■■□□ 2.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.54■■■□□ 2.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIP2BQ9P265 1576 aa32.53■■■□□ 2.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.48■■■□□ 2.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.48■■■□□ 2.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA8O94911 1581 aa32.48■■■□□ 2.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASXL2Q76L83 1435 aa32.41■■■□□ 2.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.39■■■□□ 2.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 P3H3Q8IVL6 736 aa32.38■■■□□ 2.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.33■■■□□ 2.77
PTPRCAP-201ENST00000326294 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.31■■■□□ 2.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.29■■■□□ 2.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLI2P10070 1586 aa32.28■■■□□ 2.76
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.26■■■□□ 2.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPOAP1O95153 1857 aa32.23■■■□□ 2.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.23■■■□□ 2.75
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.15■■■□□ 2.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP10BO94823 1461 aa32.15■■■□□ 2.74
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.13■■■□□ 2.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARID3CA6NKF2 412 aa32.1■■■□□ 2.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM6BO15054 1643 aa32.04■■■□□ 2.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.02■■■□□ 2.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 FMN1Q68DA7 1419 aa31.97■■■□□ 2.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNH8Q96L42 1107 aa31.96■■■□□ 2.71
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.94■■■□□ 2.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 HECW1Q76N89 1606 aa31.92■■■□□ 2.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.9■■■□□ 2.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD109Q6YHK3 1445 aa31.9■■■□□ 2.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.9■■■□□ 2.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLIP1P30622 1438 aa31.83■■■□□ 2.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.76■■■□□ 2.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.73■■■□□ 2.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.7■■■□□ 2.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.7■■■□□ 2.67
PTPRCAP-201ENST00000326294 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.66■■■□□ 2.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP162Q5TB80 1403 aa31.65■■■□□ 2.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.63■■■□□ 2.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.62■■■□□ 2.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEO1Q92859 1461 aa31.62■■■□□ 2.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF14Q15058 1648 aa31.6■■■□□ 2.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.57■■■□□ 2.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.54■■■□□ 2.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.53■■■□□ 2.64
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.51■■■□□ 2.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 FANCAO15360 1455 aa31.51■■■□□ 2.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.49■■■□□ 2.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLCH2O75038 1416 aa31.47■■■□□ 2.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKNAQ7Z591 1439 aa31.45■■■□□ 2.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 RICTORQ6R327 1708 aa31.41■■■□□ 2.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAPGEF3O95398 923 aa31.39■■■□□ 2.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PREX2Q70Z35 1606 aa31.35■■■□□ 2.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRL1O94910 1474 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.34■■■□□ 2.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms