RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.1■□□□□ 0.65
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HPS1-201ENST00000325103 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.08■□□□□ 0.65
HPS1-201ENST00000325103 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.07■□□□□ 0.64
HPS1-201ENST00000325103 NEUROD1Q13562 356 aa19.07■□□□□ 0.64
HPS1-201ENST00000325103 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.02■□□□□ 0.64
HPS1-201ENST00000325103 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.02■□□□□ 0.64
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HPS1-201ENST00000325103 IFT140Q96RY7 1462 aa18.87■□□□□ 0.61
HPS1-201ENST00000325103 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
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HPS1-201ENST00000325103 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.77■□□□□ 0.6
HPS1-201ENST00000325103 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.77■□□□□ 0.6
HPS1-201ENST00000325103 CUL7Q14999 1698 aa18.77■□□□□ 0.6
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HPS1-201ENST00000325103 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.74■□□□□ 0.59
HPS1-201ENST00000325103 KCNH8Q96L42 1107 aa18.73■□□□□ 0.59
HPS1-201ENST00000325103 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HPS1-201ENST00000325103 WDR62O43379 1518 aa18.72■□□□□ 0.59
HPS1-201ENST00000325103 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.72■□□□□ 0.59
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HPS1-201ENST00000325103 TIAM1Q13009 1591 aa18.7■□□□□ 0.58
HPS1-201ENST00000325103 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HPS1-201ENST00000325103 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HPS1-201ENST00000325103 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.67■□□□□ 0.58
HPS1-201ENST00000325103 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.66■□□□□ 0.58
HPS1-201ENST00000325103 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
HPS1-201ENST00000325103 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.65■□□□□ 0.58
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HPS1-201ENST00000325103 WDR97A6NE52 1622 aa18.63■□□□□ 0.57
HPS1-201ENST00000325103 GRIN2AQ12879 1464 aa18.63■□□□□ 0.57
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HPS1-201ENST00000325103 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
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HPS1-201ENST00000325103 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.57■□□□□ 0.56
HPS1-201ENST00000325103 TONSLQ96HA7 1378 aa18.56■□□□□ 0.56
HPS1-201ENST00000325103 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HPS1-201ENST00000325103 MIER1Q8N108 512 aa18.54■□□□□ 0.56
HPS1-201ENST00000325103 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HPS1-201ENST00000325103 TSPY4P0CV99 314 aa18.52■□□□□ 0.56
HPS1-201ENST00000325103 TSPY10P0CW01 314 aa18.52■□□□□ 0.56
HPS1-201ENST00000325103 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.51■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 PTPRGP23470 1445 aa18.5■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HPS1-201ENST00000325103 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
HPS1-201ENST00000325103 MAP3K1Q13233 1512 aa18.44■□□□□ 0.54
HPS1-201ENST00000325103 DISP1Q96F81 1524 aa18.42■□□□□ 0.54
HPS1-201ENST00000325103 SAMD9Q5K651 1589 aa18.41■□□□□ 0.54
HPS1-201ENST00000325103 HECW1Q76N89 1606 aa18.4■□□□□ 0.54
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HPS1-201ENST00000325103 CEP170Q5SW79 1584 aa18.39■□□□□ 0.53
HPS1-201ENST00000325103 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.38■□□□□ 0.53
HPS1-201ENST00000325103 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.38■□□□□ 0.53
HPS1-201ENST00000325103 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.37■□□□□ 0.53
HPS1-201ENST00000325103 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.35■□□□□ 0.53
HPS1-201ENST00000325103 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HPS1-201ENST00000325103 PTPRKQ15262 1439 aa18.34■□□□□ 0.53
HPS1-201ENST00000325103 NUP160Q12769 1436 aa18.34■□□□□ 0.53
HPS1-201ENST00000325103 KIAA0556O60303 1618 aa18.33■□□□□ 0.52
HPS1-201ENST00000325103 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HPS1-201ENST00000325103 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.32■□□□□ 0.52
HPS1-201ENST00000325103 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.31■□□□□ 0.52
HPS1-201ENST00000325103 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
HPS1-201ENST00000325103 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
HPS1-201ENST00000325103 PKD2Q13563 968 aa18.28■□□□□ 0.52
HPS1-201ENST00000325103 RGL3Q3MIN7 710 aa18.27■□□□□ 0.52
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