RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 FBLN2P98095 1184 aa31.43■■■□□ 2.62
CCDC71-201ENST00000321895 CHD1O14646 1710 aa31.43■■■□□ 2.62
CCDC71-201ENST00000321895 NUP160Q12769 1436 aa31.38■■■□□ 2.61
CCDC71-201ENST00000321895 CEP170Q5SW79 1584 aa31.38■■■□□ 2.61
CCDC71-201ENST00000321895 IQGAP2Q13576 1575 aa31.37■■■□□ 2.61
CCDC71-201ENST00000321895 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.36■■■□□ 2.61
CCDC71-201ENST00000321895 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.3■■■□□ 2.6
CCDC71-201ENST00000321895 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.29■■■□□ 2.6
CCDC71-201ENST00000321895 ARAP1Q96P48 1450 aa31.23■■■□□ 2.59
CCDC71-201ENST00000321895 SAMD9Q5K651 1589 aa31.23■■■□□ 2.59
CCDC71-201ENST00000321895 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.22■■■□□ 2.59
CCDC71-201ENST00000321895 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.16■■■□□ 2.58
CCDC71-201ENST00000321895 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.08■■■□□ 2.57
CCDC71-201ENST00000321895 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.07■■■□□ 2.56
CCDC71-201ENST00000321895 DISP1Q96F81 1524 aa31.05■■■□□ 2.56
CCDC71-201ENST00000321895 KIAA0556O60303 1618 aa31.05■■■□□ 2.56
CCDC71-201ENST00000321895 P3H3Q8IVL6 736 aa31.05■■■□□ 2.56
CCDC71-201ENST00000321895 JPH4Q96JJ6 628 aa31.05■■■□□ 2.56
CCDC71-201ENST00000321895 SHROOM2Q13796 1616 aa31.03■■■□□ 2.56
CCDC71-201ENST00000321895 FMN1Q68DA7 1419 aa30.98■■■□□ 2.55
CCDC71-201ENST00000321895 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.98■■■□□ 2.55
CCDC71-201ENST00000321895 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CCDC71-201ENST00000321895 OSCARQ8IYS5 282 aa30.92■■■□□ 2.54
CCDC71-201ENST00000321895 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CCDC71-201ENST00000321895 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.86■■■□□ 2.53
CCDC71-201ENST00000321895 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.86■■■□□ 2.53
CCDC71-201ENST00000321895 APLP2Q06481 763 aa30.79■■■□□ 2.52
CCDC71-201ENST00000321895 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.75■■■□□ 2.51
CCDC71-201ENST00000321895 MAP3K1Q13233 1512 aa30.74■■■□□ 2.51
CCDC71-201ENST00000321895 HECW1Q76N89 1606 aa30.73■■■□□ 2.51
CCDC71-201ENST00000321895 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.7■■■□□ 2.5
CCDC71-201ENST00000321895 TIAM1Q13009 1591 aa30.69■■■□□ 2.5
CCDC71-201ENST00000321895 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.69■■■□□ 2.5
CCDC71-201ENST00000321895 PTPRGP23470 1445 aa30.69■■■□□ 2.5
CCDC71-201ENST00000321895 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CCDC71-201ENST00000321895 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CCDC71-201ENST00000321895 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.65■■■□□ 2.5
CCDC71-201ENST00000321895 ABCA8O94911 1581 aa30.63■■■□□ 2.49
CCDC71-201ENST00000321895 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.63■■■□□ 2.49
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.62■■■□□ 2.49
CCDC71-201ENST00000321895 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CCDC71-201ENST00000321895 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CCDC71-201ENST00000321895 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CCDC71-201ENST00000321895 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.53■■■□□ 2.48
CCDC71-201ENST00000321895 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
CCDC71-201ENST00000321895 UACAQ9BZF9 1416 aa30.52■■■□□ 2.48
CCDC71-201ENST00000321895 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CCDC71-201ENST00000321895 ABCC2Q92887 1545 aa30.47■■■□□ 2.47
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF11O15085 1522 aa30.44■■■□□ 2.46
CCDC71-201ENST00000321895 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.44■■■□□ 2.46
CCDC71-201ENST00000321895 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.42■■■□□ 2.46
CCDC71-201ENST00000321895 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.41■■■□□ 2.46
CCDC71-201ENST00000321895 ARID3CA6NKF2 412 aa30.39■■■□□ 2.46
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
CCDC71-201ENST00000321895 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.38■■■□□ 2.45
CCDC71-201ENST00000321895 ATP10BO94823 1461 aa30.38■■■□□ 2.45
CCDC71-201ENST00000321895 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
CCDC71-201ENST00000321895 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
CCDC71-201ENST00000321895 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
CCDC71-201ENST00000321895 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
CCDC71-201ENST00000321895 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CCDC71-201ENST00000321895 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
CCDC71-201ENST00000321895 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.32■■■□□ 2.44
CCDC71-201ENST00000321895 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CCDC71-201ENST00000321895 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.29■■■□□ 2.44
CCDC71-201ENST00000321895 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CCDC71-201ENST00000321895 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CCDC71-201ENST00000321895 NCOA2Q15596 1464 aa30.23■■■□□ 2.43
CCDC71-201ENST00000321895 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.21■■■□□ 2.43
CCDC71-201ENST00000321895 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.19■■■□□ 2.42
CCDC71-201ENST00000321895 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.19■■■□□ 2.42
CCDC71-201ENST00000321895 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CCDC71-201ENST00000321895 KIF14Q15058 1648 aa30.14■■■□□ 2.41
CCDC71-201ENST00000321895 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.1■■■□□ 2.41
CCDC71-201ENST00000321895 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.07■■■□□ 2.4
CCDC71-201ENST00000321895 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.07■■■□□ 2.4
CCDC71-201ENST00000321895 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.05■■■□□ 2.4
CCDC71-201ENST00000321895 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
CCDC71-201ENST00000321895 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.02■■■□□ 2.4
CCDC71-201ENST00000321895 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.01■■■□□ 2.4
CCDC71-201ENST00000321895 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.01■■■□□ 2.39
CCDC71-201ENST00000321895 MIA2Q96PC5 1412 aa29.98■■■□□ 2.39
CCDC71-201ENST00000321895 ASXL2Q76L83 1435 aa29.98■■■□□ 2.39
CCDC71-201ENST00000321895 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
CCDC71-201ENST00000321895 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.94■■■□□ 2.38
CCDC71-201ENST00000321895 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CCDC71-201ENST00000321895 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.94■■■□□ 2.38
CCDC71-201ENST00000321895 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
CCDC71-201ENST00000321895 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.92■■■□□ 2.38
CCDC71-201ENST00000321895 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CCDC71-201ENST00000321895 MAPKBP1O60336 1514 aa29.9■■■□□ 2.38
CCDC71-201ENST00000321895 KCNH8Q96L42 1107 aa29.89■■■□□ 2.38
CCDC71-201ENST00000321895 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CCDC71-201ENST00000321895 PREX2Q70Z35 1606 aa29.87■■■□□ 2.37
CCDC71-201ENST00000321895 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.86■■■□□ 2.37
CCDC71-201ENST00000321895 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CCDC71-201ENST00000321895 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.83■■■□□ 2.37
CCDC71-201ENST00000321895 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.82■■■□□ 2.36
CCDC71-201ENST00000321895 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms