RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319511.6

TMUB2-201, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMUB2, Length 2,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-201ENST00000319511 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.2■□□□□ 0.66
TMUB2-201ENST00000319511 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.16■□□□□ 0.66
TMUB2-201ENST00000319511 CUX2O14529 1486 aa19.16■□□□□ 0.66
TMUB2-201ENST00000319511 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.15■□□□□ 0.66
TMUB2-201ENST00000319511 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
TMUB2-201ENST00000319511 TOPBP1Q92547 1522 aa19.13■□□□□ 0.65
TMUB2-201ENST00000319511 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
TMUB2-201ENST00000319511 IGF1RP08069 1367 aa19.09■□□□□ 0.65
TMUB2-201ENST00000319511 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.09■□□□□ 0.65
TMUB2-201ENST00000319511 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.07■□□□□ 0.64
TMUB2-201ENST00000319511 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
TMUB2-201ENST00000319511 ARAP1Q96P48 1450 aa19.05■□□□□ 0.64
TMUB2-201ENST00000319511 WDR97A6NE52 1622 aa19.04■□□□□ 0.64
TMUB2-201ENST00000319511 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
TMUB2-201ENST00000319511 MSH5O43196 834 aa19.02■□□□□ 0.63
TMUB2-201ENST00000319511 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TMUB2-201ENST00000319511 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.99■□□□□ 0.63
TMUB2-201ENST00000319511 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.99■□□□□ 0.63
TMUB2-201ENST00000319511 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
TMUB2-201ENST00000319511 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.98■□□□□ 0.63
TMUB2-201ENST00000319511 CUL7Q14999 1698 aa18.96■□□□□ 0.63
TMUB2-201ENST00000319511 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.95■□□□□ 0.62
TMUB2-201ENST00000319511 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.92■□□□□ 0.62
TMUB2-201ENST00000319511 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.89■□□□□ 0.61
TMUB2-201ENST00000319511 NEFLP07196 543 aa18.88■□□□□ 0.61
TMUB2-201ENST00000319511 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TMUB2-201ENST00000319511 MIER1Q8N108 512 aa18.85■□□□□ 0.61
TMUB2-201ENST00000319511 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
TMUB2-201ENST00000319511 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.84■□□□□ 0.61
TMUB2-201ENST00000319511 WDR62O43379 1518 aa18.82■□□□□ 0.6
TMUB2-201ENST00000319511 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.82■□□□□ 0.6
TMUB2-201ENST00000319511 IL27Q8NEV9 243 aa18.79■□□□□ 0.6
TMUB2-201ENST00000319511 MAP3K1Q13233 1512 aa18.78■□□□□ 0.6
TMUB2-201ENST00000319511 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.78■□□□□ 0.6
TMUB2-201ENST00000319511 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.77■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 PDE4CQ08493 712 aa18.75■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 PBRM1Q86U86 1689 aa18.73■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 TIAM1Q13009 1591 aa18.71■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
TMUB2-201ENST00000319511 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.7■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.7■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 ZMYND15Q9H091 742 aa18.69■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.69■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 SAMD9Q5K651 1589 aa18.66■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.583e-6■■■□□ 18.3
TMUB2-201ENST00000319511 FGD1P98174 961 aa18.64■□□□□ 0.58
TMUB2-201ENST00000319511 ADAMTS12P58397 1594 aa18.63■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.62■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 KLHL34Q8N239 644 aa18.62■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 IFT140Q96RY7 1462 aa18.62■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.61■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.61■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.6■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.59■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TMUB2-201ENST00000319511 BCANQ96GW7 911 aa18.58■□□□□ 0.56
TMUB2-201ENST00000319511 GRIN2BQ13224 1484 aa18.57■□□□□ 0.56
TMUB2-201ENST00000319511 FMN1Q68DA7 1419 aa18.54■□□□□ 0.56
TMUB2-201ENST00000319511 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
TMUB2-201ENST00000319511 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.54■□□□□ 0.56
TMUB2-201ENST00000319511 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.53■□□□□ 0.56
TMUB2-201ENST00000319511 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.53■□□□□ 0.56
TMUB2-201ENST00000319511 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TMUB2-201ENST00000319511 AAMPQ13685 434 aa18.51■□□□□ 0.55
TMUB2-201ENST00000319511 P3H3Q8IVL6 736 aa18.5■□□□□ 0.55
TMUB2-201ENST00000319511 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TMUB2-201ENST00000319511 IQGAP2Q13576 1575 aa18.49■□□□□ 0.55
TMUB2-201ENST00000319511 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TMUB2-201ENST00000319511 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.48■□□□□ 0.55
TMUB2-201ENST00000319511 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TMUB2-201ENST00000319511 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.45■□□□□ 0.54
TMUB2-201ENST00000319511 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.43■□□□□ 0.54
TMUB2-201ENST00000319511 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.43■□□□□ 0.54
TMUB2-201ENST00000319511 NBR1Q14596 966 aa18.42■□□□□ 0.54
TMUB2-201ENST00000319511 FKBP8Q14318 412 aa18.39■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 GRIN2AQ12879 1464 aa18.37■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.36■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 HECW1Q76N89 1606 aa18.36■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.35■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.34■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 OSCARQ8IYS5 282 aa18.33■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 ARXQ96QS3 562 aa18.33■□□□□ 0.53
TMUB2-201ENST00000319511 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.32■□□□□ 0.52
TMUB2-201ENST00000319511 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TMUB2-201ENST00000319511 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
TMUB2-201ENST00000319511 KIAA0556O60303 1618 aa18.31■□□□□ 0.52
TMUB2-201ENST00000319511 ARHGEF11O15085 1522 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.4 ms