RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 NUP160Q12769 1436 aa33.65■■■□□ 2.98
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RALGPS1-202ENST00000319107 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.6■■■□□ 2.97
RALGPS1-202ENST00000319107 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.57■■■□□ 2.96
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RALGPS1-202ENST00000319107 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.34■■■□□ 2.93
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RALGPS1-202ENST00000319107 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.73■■■□□ 2.83
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RALGPS1-202ENST00000319107 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.54■■■□□ 2.8
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RALGPS1-202ENST00000319107 FMN1Q68DA7 1419 aa32.49■■■□□ 2.79
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RALGPS1-202ENST00000319107 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.23■■■□□ 2.75
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RALGPS1-202ENST00000319107 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.16■■■□□ 2.74
RALGPS1-202ENST00000319107 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.15■■■□□ 2.74
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RALGPS1-202ENST00000319107 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.1■■■□□ 2.73
RALGPS1-202ENST00000319107 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
RALGPS1-202ENST00000319107 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
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RALGPS1-202ENST00000319107 MAP3K1Q13233 1512 aa31.92■■■□□ 2.7
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RALGPS1-202ENST00000319107 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
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RALGPS1-202ENST00000319107 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.68■■■□□ 2.66
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RALGPS1-202ENST00000319107 NEO1Q92859 1461 aa31.65■■■□□ 2.66
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