RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319041.6

SH3BGRL3-202, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 768 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SYNJ2O15056 1496 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GRIN2AQ12879 1464 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-202ENST00000319041 IQGAP2Q13576 1575 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SAMD9Q5K651 1589 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRL3-202ENST00000319041 APLP2Q06481 763 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRL3-202ENST00000319041 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NUP160Q12769 1436 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FMN1Q68DA7 1419 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.32■■□□□ 1
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CEP170Q5SW79 1584 aa21.31■■□□□ 1
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MAP3K1Q13233 1512 aa21.3■■□□□ 1
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.3■■□□□ 1
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SH3BGRL3-202ENST00000319041 FBLN2P98095 1184 aa21.28■■□□□ 1
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.26■□□□□ 0.99
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SH3BGRL3-202ENST00000319041 P3H3Q8IVL6 736 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIAA0556O60303 1618 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TIAM1Q13009 1591 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CHD1O14646 1710 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DISP1Q96F81 1524 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BGRL3-202ENST00000319041 HECW1Q76N89 1606 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-202ENST00000319041 JPH4Q96JJ6 628 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-202ENST00000319041 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SHROOM2Q13796 1616 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21■□□□□ 0.95
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.95
SH3BGRL3-202ENST00000319041 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ABCA8O94911 1581 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PTPRGP23470 1445 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NCOA2Q15596 1464 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ARHGEF11O15085 1522 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.81■□□□□ 0.92
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SH3BGRL3-202ENST00000319041 UACAQ9BZF9 1416 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-202ENST00000319041 OSCARQ8IYS5 282 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ABCC2Q92887 1545 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ATP10BO94823 1461 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 HRCP23327 699 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MIA2Q96PC5 1412 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ARID3CA6NKF2 412 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIF14Q15058 1648 aa20.67■□□□□ 0.9
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SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ITGAEP38570 1179 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-202ENST00000319041 AKNAQ7Z591 1439 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
SH3BGRL3-202ENST00000319041 HFM1A2PYH4 1435 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PREX2Q70Z35 1606 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-202ENST00000319041 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DAPK1P53355 1430 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.861e-9■■■□□ 16.2
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
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