RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP162Q5TB80 1403 aa43.92■■■■■ 4.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP160Q12769 1436 aa43.9■■■■■ 4.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP170Q5SW79 1584 aa43.87■■■■■ 4.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.86■■■■■ 4.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLIP1P30622 1438 aa43.81■■■■■ 4.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQGAP2Q13576 1575 aa43.8■■■■■ 4.6
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSCARQ8IYS5 282 aa43.63■■■■■ 4.58
CTDNEP1-201ENST00000318988 JPH4Q96JJ6 628 aa43.59■■■■■ 4.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.58■■■■■ 4.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.57■■■■■ 4.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.56■■■■■ 4.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.52■■■■■ 4.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 P3H3Q8IVL6 736 aa43.5■■■■■ 4.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAMD9Q5K651 1589 aa43.45■■■■■ 4.55
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.42■■■■■ 4.54
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARAP1Q96P48 1450 aa43.4■■■■■ 4.54
CTDNEP1-201ENST00000318988 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.37■■■■■ 4.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 DISP1Q96F81 1524 aa43.36■■■■■ 4.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHROOM2Q13796 1616 aa43.35■■■■■ 4.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA0556O60303 1618 aa43.33■■■■■ 4.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.28■■■■■ 4.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 FMN1Q68DA7 1419 aa43.22■■■■■ 4.51
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.07■■■■■ 4.48
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPRGP23470 1445 aa43.04■■■■■ 4.48
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
CTDNEP1-201ENST00000318988 APLP2Q06481 763 aa43■■■■■ 4.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.98■■■■■ 4.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.95■■■■■ 4.47
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.83■■■■■ 4.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.83■■■■■ 4.45
CTDNEP1-201ENST00000318988 HECW1Q76N89 1606 aa42.82■■■■■ 4.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF11O15085 1522 aa42.81■■■■■ 4.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCA8O94911 1581 aa42.76■■■■■ 4.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 UACAQ9BZF9 1416 aa42.76■■■■■ 4.44
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.69■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K1Q13233 1512 aa42.67■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARID3CA6NKF2 412 aa42.66■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.65■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.65■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.65■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIAM1Q13009 1591 aa42.63■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCC2Q92887 1545 aa42.62■■■■■ 4.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.58■■■■■ 4.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.57■■■■■ 4.41
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.55■■■■■ 4.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
CTDNEP1-201ENST00000318988 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.48■■■■■ 4.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP10BO94823 1461 aa42.48■■■■■ 4.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.47■■■■■ 4.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.46■■■■■ 4.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.43■■■■■ 4.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.37■■■■■ 4.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.37■■■■■ 4.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.36■■■■■ 4.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.33■■■■■ 4.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.27■■■■■ 4.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.24■■■■■ 4.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCOA2Q15596 1464 aa42.1■■■■■ 4.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF14Q15058 1648 aa42.04■■■■■ 4.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASXL2Q76L83 1435 aa42.04■■■■■ 4.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.03■■■■■ 4.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNH8Q96L42 1107 aa42.03■■■■■ 4.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42■■■■■ 4.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.96■■■■■ 4.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPKBP1O60336 1514 aa41.91■■■■■ 4.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.9■■■■■ 4.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.86■■■■■ 4.29
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.81■■■■■ 4.283e-9■■□□□ 12.3
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.8■■■■■ 4.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIA2Q96PC5 1412 aa41.76■■■■■ 4.28
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.75■■■■■ 4.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.75■■■■■ 4.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.73■■■■■ 4.27
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.67■■■■■ 4.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.66■■■■■ 4.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.64■■■■■ 4.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.64■■■■■ 4.26
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLCH2O75038 1416 aa41.62■■■■■ 4.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 PREX2Q70Z35 1606 aa41.62■■■■■ 4.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.61■■■■■ 4.252e-14■■■■□ 24.3
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