RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 GRIN2AQ12879 1464 aa16.01■□□□□ 0.15
GINS3-201ENST00000318129 CEP162Q5TB80 1403 aa16.01■□□□□ 0.15
GINS3-201ENST00000318129 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.98■□□□□ 0.15
GINS3-201ENST00000318129 FBLN2P98095 1184 aa15.97■□□□□ 0.15
GINS3-201ENST00000318129 CLIP1P30622 1438 aa15.96■□□□□ 0.14
GINS3-201ENST00000318129 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.92■□□□□ 0.14
GINS3-201ENST00000318129 NUP160Q12769 1436 aa15.92■□□□□ 0.14
GINS3-201ENST00000318129 MYT1Q01538 1121 aa15.9■□□□□ 0.14
GINS3-201ENST00000318129 CHD1O14646 1710 aa15.9■□□□□ 0.14
GINS3-201ENST00000318129 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
GINS3-201ENST00000318129 IQGAP2Q13576 1575 aa15.89■□□□□ 0.13
GINS3-201ENST00000318129 CEP170Q5SW79 1584 aa15.88■□□□□ 0.13
GINS3-201ENST00000318129 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.86■□□□□ 0.13
GINS3-201ENST00000318129 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.85■□□□□ 0.13
GINS3-201ENST00000318129 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
GINS3-201ENST00000318129 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.83■□□□□ 0.12
GINS3-201ENST00000318129 SAMD9Q5K651 1589 aa15.8■□□□□ 0.12
GINS3-201ENST00000318129 ARAP1Q96P48 1450 aa15.8■□□□□ 0.12
GINS3-201ENST00000318129 JPH4Q96JJ6 628 aa15.79■□□□□ 0.12
GINS3-201ENST00000318129 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.79■□□□□ 0.12
GINS3-201ENST00000318129 P3H3Q8IVL6 736 aa15.75■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.75■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 OSCARQ8IYS5 282 aa15.75■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.74■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.74■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 DISP1Q96F81 1524 aa15.73■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 FMN1Q68DA7 1419 aa15.73■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 KIAA0556O60303 1618 aa15.72■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 SHROOM2Q13796 1616 aa15.72■□□□□ 0.11
GINS3-201ENST00000318129 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
GINS3-201ENST00000318129 APLP2Q06481 763 aa15.68■□□□□ 0.1
GINS3-201ENST00000318129 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.66■□□□□ 0.1
GINS3-201ENST00000318129 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.63■□□□□ 0.09
GINS3-201ENST00000318129 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
GINS3-201ENST00000318129 PTPRGP23470 1445 aa15.6■□□□□ 0.09
GINS3-201ENST00000318129 MAP3K1Q13233 1512 aa15.59■□□□□ 0.09
GINS3-201ENST00000318129 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GINS3-201ENST00000318129 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 HECW1Q76N89 1606 aa15.56■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.55■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.55■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.54■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 TIAM1Q13009 1591 aa15.53■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 ABCA8O94911 1581 aa15.52■□□□□ 0.08
GINS3-201ENST00000318129 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.51■□□□□ 0.07
GINS3-201ENST00000318129 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.51■□□□□ 0.07
GINS3-201ENST00000318129 UACAQ9BZF9 1416 aa15.5■□□□□ 0.07
GINS3-201ENST00000318129 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GINS3-201ENST00000318129 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GINS3-201ENST00000318129 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GINS3-201ENST00000318129 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.47■□□□□ 0.07
GINS3-201ENST00000318129 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.47■□□□□ 0.07
GINS3-201ENST00000318129 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.45■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 ABCC2Q92887 1545 aa15.44■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.43■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 ARHGEF11O15085 1522 aa15.43■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 ATP10BO94823 1461 aa15.41■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 ARID3CA6NKF2 412 aa15.41■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.41■□□□□ 0.06
GINS3-201ENST00000318129 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.37■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.36■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.36■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.36■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.36■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.35■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.34■□□□□ 0.05
GINS3-201ENST00000318129 NCOA2Q15596 1464 aa15.32■□□□□ 0.04
GINS3-201ENST00000318129 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
GINS3-201ENST00000318129 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
GINS3-201ENST00000318129 NEUROD1Q13562 356 aa15.31■□□□□ 0.04
GINS3-201ENST00000318129 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.29■□□□□ 0.04
GINS3-201ENST00000318129 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.29■□□□□ 0.04
GINS3-201ENST00000318129 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
GINS3-201ENST00000318129 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.26■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 KIF14Q15058 1648 aa15.26■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.25■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.23■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.22■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.22■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 MIA2Q96PC5 1412 aa15.22■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.21■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 ASXL2Q76L83 1435 aa15.21■□□□□ 0.03
GINS3-201ENST00000318129 KCNH8Q96L42 1107 aa15.2■□□□□ 0.02
GINS3-201ENST00000318129 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.19■□□□□ 0.02
GINS3-201ENST00000318129 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
GINS3-201ENST00000318129 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
GINS3-201ENST00000318129 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
GINS3-201ENST00000318129 MAPKBP1O60336 1514 aa15.16■□□□□ 0.02
GINS3-201ENST00000318129 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
GINS3-201ENST00000318129 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms