RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308941.9

PHYHD1-201, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PHYHD1, Length 1,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-201ENST00000308941 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.88■■■□□ 2.21
PHYHD1-201ENST00000308941 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.82■■■□□ 2.2
PHYHD1-201ENST00000308941 JPH4Q96JJ6 628 aa28.82■■■□□ 2.2
PHYHD1-201ENST00000308941 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.81■■■□□ 2.2
PHYHD1-201ENST00000308941 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PHYHD1-201ENST00000308941 PRXQ9BXM0 1461 aa28.73■■■□□ 2.19
PHYHD1-201ENST00000308941 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PHYHD1-201ENST00000308941 IQGAP2Q13576 1575 aa28.7■■■□□ 2.18
PHYHD1-201ENST00000308941 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.67■■■□□ 2.18
PHYHD1-201ENST00000308941 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.64■■■□□ 2.17
PHYHD1-201ENST00000308941 EEA1Q15075 1411 aa28.61■■■□□ 2.17
PHYHD1-201ENST00000308941 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PHYHD1-201ENST00000308941 DISP1Q96F81 1524 aa28.53■■■□□ 2.16
PHYHD1-201ENST00000308941 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.51■■■□□ 2.16
PHYHD1-201ENST00000308941 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.47■■■□□ 2.15
PHYHD1-201ENST00000308941 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.46■■■□□ 2.15
PHYHD1-201ENST00000308941 KIAA0556O60303 1618 aa28.45■■■□□ 2.14
PHYHD1-201ENST00000308941 KIF21BO75037 1637 aa28.44■■■□□ 2.14
PHYHD1-201ENST00000308941 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.44■■■□□ 2.14
PHYHD1-201ENST00000308941 PTPRGP23470 1445 aa28.41■■■□□ 2.14
PHYHD1-201ENST00000308941 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.41■■■□□ 2.14
PHYHD1-201ENST00000308941 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PHYHD1-201ENST00000308941 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PHYHD1-201ENST00000308941 P3H3Q8IVL6 736 aa28.28■■■□□ 2.12
PHYHD1-201ENST00000308941 GOLGA3Q08378 1498 aa28.28■■■□□ 2.12
PHYHD1-201ENST00000308941 SAMD9Q5K651 1589 aa28.24■■■□□ 2.11
PHYHD1-201ENST00000308941 UACAQ9BZF9 1416 aa28.22■■■□□ 2.11
PHYHD1-201ENST00000308941 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.2■■■□□ 2.1
PHYHD1-201ENST00000308941 ABCC2Q92887 1545 aa28.2■■■□□ 2.1
PHYHD1-201ENST00000308941 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PHYHD1-201ENST00000308941 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
PHYHD1-201ENST00000308941 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.17■■■□□ 2.1
PHYHD1-201ENST00000308941 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.16■■■□□ 2.1
PHYHD1-201ENST00000308941 MAPKBP1O60336 1514 aa28.15■■■□□ 2.1
PHYHD1-201ENST00000308941 ABCA8O94911 1581 aa28.13■■■□□ 2.09
PHYHD1-201ENST00000308941 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.12■■■□□ 2.09
PHYHD1-201ENST00000308941 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PHYHD1-201ENST00000308941 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.07■■■□□ 2.08
PHYHD1-201ENST00000308941 DIP2BQ9P265 1576 aa28.06■■■□□ 2.08
PHYHD1-201ENST00000308941 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.05■■■□□ 2.08
PHYHD1-201ENST00000308941 ASXL2Q76L83 1435 aa28.03■■■□□ 2.08
PHYHD1-201ENST00000308941 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.03■■■□□ 2.08
PHYHD1-201ENST00000308941 ARID3CA6NKF2 412 aa28.03■■■□□ 2.08
PHYHD1-201ENST00000308941 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.01■■■□□ 2.07
PHYHD1-201ENST00000308941 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.98■■■□□ 2.07
PHYHD1-201ENST00000308941 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.98■■■□□ 2.07
PHYHD1-201ENST00000308941 TSPOAP1O95153 1857 aa27.93■■■□□ 2.06
PHYHD1-201ENST00000308941 ATP10BO94823 1461 aa27.89■■■□□ 2.06
PHYHD1-201ENST00000308941 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
PHYHD1-201ENST00000308941 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PHYHD1-201ENST00000308941 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.86■■■□□ 2.05
PHYHD1-201ENST00000308941 GLI2P10070 1586 aa27.82■■■□□ 2.04
PHYHD1-201ENST00000308941 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.79■■■□□ 2.04
PHYHD1-201ENST00000308941 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
PHYHD1-201ENST00000308941 KCNH8Q96L42 1107 aa27.78■■■□□ 2.04
PHYHD1-201ENST00000308941 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.76■■■□□ 2.03
PHYHD1-201ENST00000308941 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
PHYHD1-201ENST00000308941 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PHYHD1-201ENST00000308941 CLIP1P30622 1438 aa27.76■■■□□ 2.03
PHYHD1-201ENST00000308941 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PHYHD1-201ENST00000308941 FMN1Q68DA7 1419 aa27.74■■■□□ 2.03
PHYHD1-201ENST00000308941 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
PHYHD1-201ENST00000308941 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.71■■■□□ 2.03
PHYHD1-201ENST00000308941 HECW1Q76N89 1606 aa27.69■■■□□ 2.02
PHYHD1-201ENST00000308941 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
PHYHD1-201ENST00000308941 CEP162Q5TB80 1403 aa27.65■■■□□ 2.02
PHYHD1-201ENST00000308941 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.64■■■□□ 2.02
PHYHD1-201ENST00000308941 KDM6BO15054 1643 aa27.61■■■□□ 2.01
PHYHD1-201ENST00000308941 CD109Q6YHK3 1445 aa27.6■■■□□ 2.01
PHYHD1-201ENST00000308941 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.59■■■□□ 2.01
PHYHD1-201ENST00000308941 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.57■■■□□ 2
PHYHD1-201ENST00000308941 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.56■■■□□ 2
PHYHD1-201ENST00000308941 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PHYHD1-201ENST00000308941 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.52■■■□□ 2
PHYHD1-201ENST00000308941 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.52■■■□□ 2
PHYHD1-201ENST00000308941 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.51■■□□□ 1.99
PHYHD1-201ENST00000308941 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.5■■□□□ 1.99
PHYHD1-201ENST00000308941 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
PHYHD1-201ENST00000308941 KIF14Q15058 1648 aa27.47■■□□□ 1.99
PHYHD1-201ENST00000308941 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.43■■□□□ 1.98
PHYHD1-201ENST00000308941 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
PHYHD1-201ENST00000308941 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PHYHD1-201ENST00000308941 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.31■■□□□ 1.96
PHYHD1-201ENST00000308941 FANCAO15360 1455 aa27.29■■□□□ 1.96
PHYHD1-201ENST00000308941 NEO1Q92859 1461 aa27.29■■□□□ 1.96
PHYHD1-201ENST00000308941 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.28■■□□□ 1.96
PHYHD1-201ENST00000308941 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.28■■□□□ 1.96
PHYHD1-201ENST00000308941 PLCH2O75038 1416 aa27.26■■□□□ 1.95
PHYHD1-201ENST00000308941 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.24■■□□□ 1.95
PHYHD1-201ENST00000308941 RAPGEF3O95398 923 aa27.24■■□□□ 1.95
PHYHD1-201ENST00000308941 AKNAQ7Z591 1439 aa27.23■■□□□ 1.95
PHYHD1-201ENST00000308941 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.23■■□□□ 1.95
PHYHD1-201ENST00000308941 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.23■■□□□ 1.95
PHYHD1-201ENST00000308941 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.21■■□□□ 1.95
PHYHD1-201ENST00000308941 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.19■■□□□ 1.94
PHYHD1-201ENST00000308941 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.19■■□□□ 1.94
PHYHD1-201ENST00000308941 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.19■■□□□ 1.94
PHYHD1-201ENST00000308941 PREX2Q70Z35 1606 aa27.19■■□□□ 1.94
PHYHD1-201ENST00000308941 RICTORQ6R327 1708 aa27.18■■□□□ 1.94
PHYHD1-201ENST00000308941 TIAM1Q13009 1591 aa27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms