RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.33■■□□□ 1.65
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TSNARE1-201ENST00000307180 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1-201ENST00000307180 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.31■■□□□ 1.64
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TSNARE1-201ENST00000307180 ABCA8O94911 1581 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-201ENST00000307180 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.69■■□□□ 1.54
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TSNARE1-201ENST00000307180 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.38■■□□□ 1.49
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TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.32■■□□□ 1.48
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TSNARE1-201ENST00000307180 CD109Q6YHK3 1445 aa24.19■■□□□ 1.46
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TSNARE1-201ENST00000307180 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1-201ENST00000307180 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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TSNARE1-201ENST00000307180 PLCH2O75038 1416 aa24.01■■□□□ 1.43
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TSNARE1-201ENST00000307180 NCOA2Q15596 1464 aa23.97■■□□□ 1.43
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