RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 CUL7Q14999 1698 aa29.74■■■□□ 2.35
HPS6-201ENST00000299238 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
HPS6-201ENST00000299238 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.67■■■□□ 2.34
HPS6-201ENST00000299238 TIAM1Q13009 1591 aa29.66■■■□□ 2.34
HPS6-201ENST00000299238 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.66■■■□□ 2.34
HPS6-201ENST00000299238 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.66■■■□□ 2.34
HPS6-201ENST00000299238 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.65■■■□□ 2.34
HPS6-201ENST00000299238 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.63■■■□□ 2.33
HPS6-201ENST00000299238 MAP3K1Q13233 1512 aa29.63■■■□□ 2.33
HPS6-201ENST00000299238 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.61■■■□□ 2.33
HPS6-201ENST00000299238 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
HPS6-201ENST00000299238 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.56■■■□□ 2.32
HPS6-201ENST00000299238 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.56■■■□□ 2.32
HPS6-201ENST00000299238 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.55■■■□□ 2.32
HPS6-201ENST00000299238 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
HPS6-201ENST00000299238 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.54■■■□□ 2.32
HPS6-201ENST00000299238 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.52■■■□□ 2.32
HPS6-201ENST00000299238 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.49■■■□□ 2.31
HPS6-201ENST00000299238 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
HPS6-201ENST00000299238 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.49■■■□□ 2.31
HPS6-201ENST00000299238 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.48■■■□□ 2.31
HPS6-201ENST00000299238 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
HPS6-201ENST00000299238 P3H3Q8IVL6 736 aa29.46■■■□□ 2.31
HPS6-201ENST00000299238 MIER1Q8N108 512 aa29.44■■■□□ 2.3
HPS6-201ENST00000299238 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
HPS6-201ENST00000299238 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.42■■■□□ 2.3
HPS6-201ENST00000299238 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
HPS6-201ENST00000299238 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.37■■■□□ 2.29
HPS6-201ENST00000299238 ITGAEP38570 1179 aa29.34■■■□□ 2.29
HPS6-201ENST00000299238 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.34■■■□□ 2.29
HPS6-201ENST00000299238 SAMD9Q5K651 1589 aa29.34■■■□□ 2.29
HPS6-201ENST00000299238 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.33■■■□□ 2.29
HPS6-201ENST00000299238 PBRM1Q86U86 1689 aa29.31■■■□□ 2.28
HPS6-201ENST00000299238 FMN1Q68DA7 1419 aa29.29■■■□□ 2.28
HPS6-201ENST00000299238 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
HPS6-201ENST00000299238 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.27■■■□□ 2.28
HPS6-201ENST00000299238 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.27■■■□□ 2.28
HPS6-201ENST00000299238 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
HPS6-201ENST00000299238 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.18■■■□□ 2.26
HPS6-201ENST00000299238 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.18■■■□□ 2.26
HPS6-201ENST00000299238 ADAMTS12P58397 1594 aa29.17■■■□□ 2.26
HPS6-201ENST00000299238 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
HPS6-201ENST00000299238 GRIN2BQ13224 1484 aa29.11■■■□□ 2.25
HPS6-201ENST00000299238 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
HPS6-201ENST00000299238 MAPKBP1O60336 1514 aa29.1■■■□□ 2.25
HPS6-201ENST00000299238 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.1■■■□□ 2.25
HPS6-201ENST00000299238 WDR62O43379 1518 aa29.08■■■□□ 2.25
HPS6-201ENST00000299238 IQGAP2Q13576 1575 aa29.06■■■□□ 2.24
HPS6-201ENST00000299238 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
HPS6-201ENST00000299238 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.04■■■□□ 2.24
HPS6-201ENST00000299238 IFT140Q96RY7 1462 aa29.03■■■□□ 2.24
HPS6-201ENST00000299238 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.01■■■□□ 2.24
HPS6-201ENST00000299238 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
HPS6-201ENST00000299238 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.97■■■□□ 2.23
HPS6-201ENST00000299238 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
HPS6-201ENST00000299238 NCOA2Q15596 1464 aa28.94■■■□□ 2.22
HPS6-201ENST00000299238 HECW1Q76N89 1606 aa28.93■■■□□ 2.22
HPS6-201ENST00000299238 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.92■■■□□ 2.22
HPS6-201ENST00000299238 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
HPS6-201ENST00000299238 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.89■■■□□ 2.21
HPS6-201ENST00000299238 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.88■■■□□ 2.21
HPS6-201ENST00000299238 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.87■■■□□ 2.21
HPS6-201ENST00000299238 ARHGEF11O15085 1522 aa28.84■■■□□ 2.21
HPS6-201ENST00000299238 ERCC6Q03468 1493 aa28.84■■■□□ 2.21
HPS6-201ENST00000299238 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
HPS6-201ENST00000299238 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.8■■■□□ 2.2
HPS6-201ENST00000299238 PTPRKQ15262 1439 aa28.79■■■□□ 2.2
HPS6-201ENST00000299238 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.77■■■□□ 2.2
HPS6-201ENST00000299238 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.77■■■□□ 2.2
HPS6-201ENST00000299238 GRIN2AQ12879 1464 aa28.77■■■□□ 2.2
HPS6-201ENST00000299238 KIAA0556O60303 1618 aa28.77■■■□□ 2.2
HPS6-201ENST00000299238 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
HPS6-201ENST00000299238 HFM1A2PYH4 1435 aa28.75■■■□□ 2.19
HPS6-201ENST00000299238 DISP1Q96F81 1524 aa28.72■■■□□ 2.19
HPS6-201ENST00000299238 BCANQ96GW7 911 aa28.68■■■□□ 2.18
HPS6-201ENST00000299238 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
HPS6-201ENST00000299238 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
HPS6-201ENST00000299238 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.67■■■□□ 2.18
HPS6-201ENST00000299238 NAIPQ13075 1403 aa28.66■■■□□ 2.18
HPS6-201ENST00000299238 UACAQ9BZF9 1416 aa28.62■■■□□ 2.17
HPS6-201ENST00000299238 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.61■■■□□ 2.17
HPS6-201ENST00000299238 CEP170Q5SW79 1584 aa28.61■■■□□ 2.17
HPS6-201ENST00000299238 SYNJ2O15056 1496 aa28.6■■■□□ 2.17
HPS6-201ENST00000299238 ARID3CA6NKF2 412 aa28.59■■■□□ 2.17
HPS6-201ENST00000299238 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.59■■■□□ 2.17
HPS6-201ENST00000299238 KCNH8Q96L42 1107 aa28.58■■■□□ 2.17
HPS6-201ENST00000299238 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
HPS6-201ENST00000299238 MIA2Q96PC5 1412 aa28.57■■■□□ 2.16
HPS6-201ENST00000299238 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
HPS6-201ENST00000299238 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
HPS6-201ENST00000299238 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
HPS6-201ENST00000299238 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
HPS6-201ENST00000299238 AKNAQ7Z591 1439 aa28.5■■■□□ 2.15
HPS6-201ENST00000299238 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.49■■■□□ 2.15
HPS6-201ENST00000299238 MSH5O43196 834 aa28.47■■■□□ 2.15
HPS6-201ENST00000299238 NUP160Q12769 1436 aa28.45■■■□□ 2.15
HPS6-201ENST00000299238 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.45■■■□□ 2.14
HPS6-201ENST00000299238 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.45■■■□□ 2.14
HPS6-201ENST00000299238 KDM6BO15054 1643 aa28.43■■■□□ 2.14
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