RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298923.11

SLC6A5-201, Transcript of solute carrier family 6 member 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC6A5, Length 2,356 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A5-201ENST00000298923 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SLC6A5-201ENST00000298923 WDR97A6NE52 1622 aa24.85■■□□□ 1.57
SLC6A5-201ENST00000298923 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.83■■□□□ 1.57
SLC6A5-201ENST00000298923 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.79■■□□□ 1.56
SLC6A5-201ENST00000298923 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC6A5-201ENST00000298923 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC6A5-201ENST00000298923 CUL7Q14999 1698 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC6A5-201ENST00000298923 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.7■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 TIAM1Q13009 1591 aa24.7■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.66■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 ITGAEP38570 1179 aa24.64■■□□□ 1.54
SLC6A5-201ENST00000298923 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC6A5-201ENST00000298923 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC6A5-201ENST00000298923 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 MAP3K1Q13233 1512 aa24.54■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.52■■□□□ 1.52
SLC6A5-201ENST00000298923 PBRM1Q86U86 1689 aa24.5■■□□□ 1.51
SLC6A5-201ENST00000298923 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.47■■□□□ 1.51
SLC6A5-201ENST00000298923 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SLC6A5-201ENST00000298923 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.46■■□□□ 1.51
SLC6A5-201ENST00000298923 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SLC6A5-201ENST00000298923 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.46■■□□□ 1.51
SLC6A5-201ENST00000298923 SAMD9Q5K651 1589 aa24.45■■□□□ 1.51
SLC6A5-201ENST00000298923 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.45■■□□□ 1.5
SLC6A5-201ENST00000298923 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SLC6A5-201ENST00000298923 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.39■■□□□ 1.49
SLC6A5-201ENST00000298923 FMN1Q68DA7 1419 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC6A5-201ENST00000298923 ADAMTS12P58397 1594 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC6A5-201ENST00000298923 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.36■■□□□ 1.49
SLC6A5-201ENST00000298923 MIER1Q8N108 512 aa24.36■■□□□ 1.49
SLC6A5-201ENST00000298923 WDR62O43379 1518 aa24.35■■□□□ 1.49
SLC6A5-201ENST00000298923 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SLC6A5-201ENST00000298923 GRIN2BQ13224 1484 aa24.31■■□□□ 1.48
SLC6A5-201ENST00000298923 IFT140Q96RY7 1462 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC6A5-201ENST00000298923 ERCC6Q03468 1493 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC6A5-201ENST00000298923 IQGAP2Q13576 1575 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC6A5-201ENST00000298923 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC6A5-201ENST00000298923 ARID3CA6NKF2 412 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC6A5-201ENST00000298923 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.24■■□□□ 1.47
SLC6A5-201ENST00000298923 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SLC6A5-201ENST00000298923 MAPKBP1O60336 1514 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC6A5-201ENST00000298923 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC6A5-201ENST00000298923 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SLC6A5-201ENST00000298923 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC6A5-201ENST00000298923 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC6A5-201ENST00000298923 NCOA2Q15596 1464 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC6A5-201ENST00000298923 PTPRKQ15262 1439 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC6A5-201ENST00000298923 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SLC6A5-201ENST00000298923 GRIN2AQ12879 1464 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC6A5-201ENST00000298923 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SLC6A5-201ENST00000298923 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC6A5-201ENST00000298923 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.09■■□□□ 1.45
SLC6A5-201ENST00000298923 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC6A5-201ENST00000298923 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SLC6A5-201ENST00000298923 DISP1Q96F81 1524 aa24.08■■□□□ 1.45
SLC6A5-201ENST00000298923 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC6A5-201ENST00000298923 HECW1Q76N89 1606 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC6A5-201ENST00000298923 FBLN2P98095 1184 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC6A5-201ENST00000298923 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
SLC6A5-201ENST00000298923 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC6A5-201ENST00000298923 KIAA0556O60303 1618 aa24.04■■□□□ 1.44
SLC6A5-201ENST00000298923 ARHGEF11O15085 1522 aa24.03■■□□□ 1.44
SLC6A5-201ENST00000298923 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC6A5-201ENST00000298923 CEP170Q5SW79 1584 aa24.02■■□□□ 1.43
SLC6A5-201ENST00000298923 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24■■□□□ 1.43
SLC6A5-201ENST00000298923 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SLC6A5-201ENST00000298923 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
SLC6A5-201ENST00000298923 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.95■■□□□ 1.42
SLC6A5-201ENST00000298923 SYNJ2O15056 1496 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC6A5-201ENST00000298923 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SLC6A5-201ENST00000298923 HFM1A2PYH4 1435 aa23.93■■□□□ 1.42
SLC6A5-201ENST00000298923 NAIPQ13075 1403 aa23.92■■□□□ 1.42
SLC6A5-201ENST00000298923 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.91■■□□□ 1.42
SLC6A5-201ENST00000298923 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.88■■□□□ 1.41
SLC6A5-201ENST00000298923 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.88■■□□□ 1.41
SLC6A5-201ENST00000298923 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5-201ENST00000298923 KDM6BO15054 1643 aa23.85■■□□□ 1.41
SLC6A5-201ENST00000298923 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SLC6A5-201ENST00000298923 NUP160Q12769 1436 aa23.82■■□□□ 1.4
SLC6A5-201ENST00000298923 JPH4Q96JJ6 628 aa23.82■■□□□ 1.4
SLC6A5-201ENST00000298923 UACAQ9BZF9 1416 aa23.81■■□□□ 1.4
SLC6A5-201ENST00000298923 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SLC6A5-201ENST00000298923 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SLC6A5-201ENST00000298923 MIA2Q96PC5 1412 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC6A5-201ENST00000298923 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SLC6A5-201ENST00000298923 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SLC6A5-201ENST00000298923 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC6A5-201ENST00000298923 KIF14Q15058 1648 aa23.72■■□□□ 1.39
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