RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
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PQLC3-201ENST00000295083 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.21■■■■■ 4.03
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PQLC3-201ENST00000295083 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.09■■■■■ 4.01
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PQLC3-201ENST00000295083 CEP162Q5TB80 1403 aa39.79■■■■□ 3.96
PQLC3-201ENST00000295083 ARHGEF11O15085 1522 aa39.79■■■■□ 3.96
PQLC3-201ENST00000295083 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.77■■■■□ 3.96
PQLC3-201ENST00000295083 SAMD9Q5K651 1589 aa39.77■■■■□ 3.96
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PQLC3-201ENST00000295083 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.69■■■■□ 3.94
PQLC3-201ENST00000295083 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.69■■■■□ 3.94
PQLC3-201ENST00000295083 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
PQLC3-201ENST00000295083 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.66■■■■□ 3.94
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PQLC3-201ENST00000295083 UACAQ9BZF9 1416 aa39.3■■■■□ 3.88
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PQLC3-201ENST00000295083 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.22■■■■□ 3.87
PQLC3-201ENST00000295083 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.22■■■■□ 3.87
PQLC3-201ENST00000295083 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.21■■■■□ 3.87
PQLC3-201ENST00000295083 ABCC2Q92887 1545 aa39.19■■■■□ 3.86
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PQLC3-201ENST00000295083 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.17■■■■□ 3.86
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PQLC3-201ENST00000295083 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
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PQLC3-201ENST00000295083 HECW1Q76N89 1606 aa39.06■■■■□ 3.84
PQLC3-201ENST00000295083 ATP10BO94823 1461 aa39.02■■■■□ 3.84
PQLC3-201ENST00000295083 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.02■■■■□ 3.84
PQLC3-201ENST00000295083 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.02■■■■□ 3.84
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PQLC3-201ENST00000295083 MAPKBP1O60336 1514 aa38.74■■■■□ 3.79
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PQLC3-201ENST00000295083 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
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PQLC3-201ENST00000295083 PLCH2O75038 1416 aa38.17■■■■□ 3.7
PQLC3-201ENST00000295083 TSPOAP1O95153 1857 aa38.17■■■■□ 3.7
PQLC3-201ENST00000295083 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.13■■■■□ 3.7
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PQLC3-201ENST00000295083 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.12■■■■□ 3.69
PQLC3-201ENST00000295083 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
PQLC3-201ENST00000295083 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
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