RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.82■■■□□ 2.36
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CXCL16-201ENST00000293778 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.75■■■□□ 2.35
CXCL16-201ENST00000293778 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.73■■■□□ 2.35
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CXCL16-201ENST00000293778 NCOA2Q15596 1464 aa29.2■■■□□ 2.26
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CXCL16-201ENST00000293778 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
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CXCL16-201ENST00000293778 ABCC5O15440 1437 aa28.57■■■□□ 2.16
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