RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 ITGAEP38570 1179 aa31.24■■■□□ 2.59
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERCC6Q03468 1493 aa31.16■■■□□ 2.58
UBE2Q1-201ENST00000292211 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.16■■■□□ 2.58
UBE2Q1-201ENST00000292211 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.13■■■□□ 2.57
UBE2Q1-201ENST00000292211 CUL7Q14999 1698 aa31.08■■■□□ 2.57
UBE2Q1-201ENST00000292211 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.06■■■□□ 2.56
UBE2Q1-201ENST00000292211 BCL11AQ9H165 835 aa31.03■■■□□ 2.56
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRC2Q9UBG0 1479 aa31■■■□□ 2.55
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.99■■■□□ 2.55
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR97A6NE52 1622 aa30.99■■■□□ 2.55
UBE2Q1-201ENST00000292211 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.552e-7■■■■□ 26.4
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UBE2Q1-201ENST00000292211 TIAM1Q13009 1591 aa30.95■■■□□ 2.54
UBE2Q1-201ENST00000292211 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.89■■■□□ 2.54
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.88■■■□□ 2.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.86■■■□□ 2.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 FMN1Q68DA7 1419 aa30.81■■■□□ 2.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.81■■■□□ 2.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAP3K1Q13233 1512 aa30.79■■■□□ 2.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.77■■■□□ 2.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.76■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.73■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARID3CA6NKF2 412 aa30.73■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRIN2BQ13224 1484 aa30.71■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR62O43379 1518 aa30.7■■■□□ 2.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 PBRM1Q86U86 1689 aa30.69■■■□□ 2.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBLN2P98095 1184 aa30.69■■■□□ 2.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 IFT140Q96RY7 1462 aa30.68■■■□□ 2.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.65■■■□□ 2.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1-201ENST00000292211 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.59■■■□□ 2.49
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADAMTS12P58397 1594 aa30.58■■■□□ 2.49
UBE2Q1-201ENST00000292211 SAMD9Q5K651 1589 aa30.58■■■□□ 2.49
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.56■■■□□ 2.48
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
UBE2Q1-201ENST00000292211 IQGAP2Q13576 1575 aa30.54■■■□□ 2.48
UBE2Q1-201ENST00000292211 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.51■■■□□ 2.47
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
UBE2Q1-201ENST00000292211 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.42■■■□□ 2.46
UBE2Q1-201ENST00000292211 NCOA2Q15596 1464 aa30.39■■■□□ 2.46
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRIN2AQ12879 1464 aa30.36■■■□□ 2.45
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.36■■■□□ 2.45
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.34■■■□□ 2.45
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.3■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.3■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.3■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.3■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.28■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 HECW1Q76N89 1606 aa30.28■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
UBE2Q1-201ENST00000292211 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.26■■■□□ 2.43
UBE2Q1-201ENST00000292211 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.436e-7■■■□□ 14.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.24■■■□□ 2.43
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
UBE2Q1-201ENST00000292211 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.22■■■□□ 2.43
UBE2Q1-201ENST00000292211 SYNJ2O15056 1496 aa30.21■■■□□ 2.43
UBE2Q1-201ENST00000292211 MIER1Q8N108 512 aa30.21■■■□□ 2.43
UBE2Q1-201ENST00000292211 JPH4Q96JJ6 628 aa30.2■■■□□ 2.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 DISP1Q96F81 1524 aa30.19■■■□□ 2.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAPKBP1O60336 1514 aa30.18■■■□□ 2.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTPRKQ15262 1439 aa30.18■■■□□ 2.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIAA0556O60303 1618 aa30.16■■■□□ 2.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.1■■■□□ 2.41
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP170Q5SW79 1584 aa30.1■■■□□ 2.41
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM52Q96A61 297 aa30.09■■■□□ 2.41
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.08■■■□□ 2.41
UBE2Q1-201ENST00000292211 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.07■■■□□ 2.4
UBE2Q1-201ENST00000292211 HFM1A2PYH4 1435 aa30.05■■■□□ 2.4
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.03■■■□□ 2.4
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAIPQ13075 1403 aa30.01■■■□□ 2.4
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30■■■□□ 2.39
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGEF11O15085 1522 aa30■■■□□ 2.39
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUP160Q12769 1436 aa29.96■■■□□ 2.39
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
UBE2Q1-201ENST00000292211 UACAQ9BZF9 1416 aa29.94■■■□□ 2.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 TONSLQ96HA7 1378 aa29.94■■■□□ 2.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 MIA2Q96PC5 1412 aa29.93■■■□□ 2.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.89■■■□□ 2.38
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.85■■■□□ 2.37
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