RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.03■■□□□ 1.6
PKN3-201ENST00000291906 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.02■■□□□ 1.6
PKN3-201ENST00000291906 ERCC6Q03468 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
PKN3-201ENST00000291906 CUL7Q14999 1698 aa25■■□□□ 1.59
PKN3-201ENST00000291906 MRC2Q9UBG0 1479 aa25■■□□□ 1.59
PKN3-201ENST00000291906 FBLN2P98095 1184 aa24.97■■□□□ 1.59
PKN3-201ENST00000291906 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.95■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 WDR97A6NE52 1622 aa24.94■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 TIAM1Q13009 1591 aa24.94■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.91■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.9■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.87■■□□□ 1.57
PKN3-201ENST00000291906 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.86■■□□□ 1.57
PKN3-201ENST00000291906 FMN1Q68DA7 1419 aa24.84■■□□□ 1.57
PKN3-201ENST00000291906 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.83■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.81■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 GRIN2BQ13224 1484 aa24.79■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.77■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 IFT140Q96RY7 1462 aa24.75■■□□□ 1.55
PKN3-201ENST00000291906 PBRM1Q86U86 1689 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-201ENST00000291906 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-201ENST00000291906 MAP3K1Q13233 1512 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-201ENST00000291906 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.69■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 NEUROD1Q13562 356 aa24.68■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 WDR62O43379 1518 aa24.67■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 ADAMTS12P58397 1594 aa24.66■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.65■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 IQGAP2Q13576 1575 aa24.63■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.62■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 SAMD9Q5K651 1589 aa24.61■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.61■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.58■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.56■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.56■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 NCOA2Q15596 1464 aa24.54■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.52■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 GRIN2AQ12879 1464 aa24.52■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.48■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 JPH4Q96JJ6 628 aa24.47■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.47■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 MIER1Q8N108 512 aa24.45■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.45■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.42■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 TRIM52Q96A61 297 aa24.41■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 PTPRKQ15262 1439 aa24.4■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.39■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 HECW1Q76N89 1606 aa24.39■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.39■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 SYNJ2O15056 1496 aa24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 DISP1Q96F81 1524 aa24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 MAPKBP1O60336 1514 aa24.33■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 KIAA0556O60303 1618 aa24.32■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.482e-6■■■■□ 20.3
PKN3-201ENST00000291906 CEP170Q5SW79 1584 aa24.31■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.31■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.29■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.27■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 NAIPQ13075 1403 aa24.23■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 HFM1A2PYH4 1435 aa24.22■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.2■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 FOXD1Q16676 465 aa24.2■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.19■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 TONSLQ96HA7 1378 aa24.19■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 NUP160Q12769 1436 aa24.17■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF11O15085 1522 aa24.14■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 UACAQ9BZF9 1416 aa24.13■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 MIA2Q96PC5 1412 aa24.1■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 PTPRGP23470 1445 aa24.09■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.06■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 DAPK1P53355 1430 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms