RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.03■■□□□ 1.6
PKN3-201ENST00000291906 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.02■■□□□ 1.6
PKN3-201ENST00000291906 ERCC6Q03468 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
PKN3-201ENST00000291906 CUL7Q14999 1698 aa25■■□□□ 1.59
PKN3-201ENST00000291906 MRC2Q9UBG0 1479 aa25■■□□□ 1.59
PKN3-201ENST00000291906 FBLN2P98095 1184 aa24.97■■□□□ 1.59
PKN3-201ENST00000291906 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.95■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 WDR97A6NE52 1622 aa24.94■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 TIAM1Q13009 1591 aa24.94■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.91■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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PKN3-201ENST00000291906 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.9■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PKN3-201ENST00000291906 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.87■■□□□ 1.57
PKN3-201ENST00000291906 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.86■■□□□ 1.57
PKN3-201ENST00000291906 FMN1Q68DA7 1419 aa24.84■■□□□ 1.57
PKN3-201ENST00000291906 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.83■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.81■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 GRIN2BQ13224 1484 aa24.79■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.77■■□□□ 1.56
PKN3-201ENST00000291906 IFT140Q96RY7 1462 aa24.75■■□□□ 1.55
PKN3-201ENST00000291906 PBRM1Q86U86 1689 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-201ENST00000291906 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-201ENST00000291906 MAP3K1Q13233 1512 aa24.73■■□□□ 1.55
PKN3-201ENST00000291906 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.69■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 NEUROD1Q13562 356 aa24.68■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 WDR62O43379 1518 aa24.67■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 ADAMTS12P58397 1594 aa24.66■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.65■■□□□ 1.54
PKN3-201ENST00000291906 IQGAP2Q13576 1575 aa24.63■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.62■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 SAMD9Q5K651 1589 aa24.61■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.61■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.58■■□□□ 1.53
PKN3-201ENST00000291906 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.56■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.56■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 NCOA2Q15596 1464 aa24.54■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.52■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 GRIN2AQ12879 1464 aa24.52■■□□□ 1.52
PKN3-201ENST00000291906 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.48■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 JPH4Q96JJ6 628 aa24.47■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.47■■□□□ 1.51
PKN3-201ENST00000291906 MIER1Q8N108 512 aa24.45■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.45■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.42■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 TRIM52Q96A61 297 aa24.41■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 PTPRKQ15262 1439 aa24.4■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.39■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 HECW1Q76N89 1606 aa24.39■■□□□ 1.5
PKN3-201ENST00000291906 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.39■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 SYNJ2O15056 1496 aa24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 DISP1Q96F81 1524 aa24.38■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 MAPKBP1O60336 1514 aa24.33■■□□□ 1.49
PKN3-201ENST00000291906 KIAA0556O60303 1618 aa24.32■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.482e-6■■■■□ 20.3
PKN3-201ENST00000291906 CEP170Q5SW79 1584 aa24.31■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.31■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.29■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.27■■□□□ 1.48
PKN3-201ENST00000291906 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 NAIPQ13075 1403 aa24.23■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 HFM1A2PYH4 1435 aa24.22■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.2■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 FOXD1Q16676 465 aa24.2■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.19■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 TONSLQ96HA7 1378 aa24.19■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 NUP160Q12769 1436 aa24.17■■□□□ 1.46
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF11O15085 1522 aa24.14■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 UACAQ9BZF9 1416 aa24.13■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 MIA2Q96PC5 1412 aa24.1■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 PTPRGP23470 1445 aa24.09■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PKN3-201ENST00000291906 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.06■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PKN3-201ENST00000291906 DAPK1P53355 1430 aa24.03■■□□□ 1.44
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