RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.58■■■□□ 2.17
USP21-201ENST00000289865 P3H3Q8IVL6 736 aa28.58■■■□□ 2.17
USP21-201ENST00000289865 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
USP21-201ENST00000289865 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.56■■■□□ 2.16
USP21-201ENST00000289865 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
USP21-201ENST00000289865 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.54■■■□□ 2.16
USP21-201ENST00000289865 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.54■■■□□ 2.16
USP21-201ENST00000289865 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.54■■■□□ 2.16
USP21-201ENST00000289865 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.53■■■□□ 2.16
USP21-201ENST00000289865 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
USP21-201ENST00000289865 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.49■■■□□ 2.15
USP21-201ENST00000289865 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.49■■■□□ 2.15
USP21-201ENST00000289865 ITGAEP38570 1179 aa28.45■■■□□ 2.15
USP21-201ENST00000289865 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
USP21-201ENST00000289865 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.44■■■□□ 2.14
USP21-201ENST00000289865 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.41■■■□□ 2.14
USP21-201ENST00000289865 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.4■■■□□ 2.14
USP21-201ENST00000289865 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.142e-6■■■■□ 26.1
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USP21-201ENST00000289865 FMN1Q68DA7 1419 aa28.33■■■□□ 2.13
USP21-201ENST00000289865 SAMD9Q5K651 1589 aa28.32■■■□□ 2.12
USP21-201ENST00000289865 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.29■■■□□ 2.12
USP21-201ENST00000289865 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.28■■■□□ 2.12
USP21-201ENST00000289865 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
USP21-201ENST00000289865 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
USP21-201ENST00000289865 PBRM1Q86U86 1689 aa28.26■■■□□ 2.11
USP21-201ENST00000289865 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.24■■■□□ 2.11
USP21-201ENST00000289865 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.22■■■□□ 2.11
USP21-201ENST00000289865 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
USP21-201ENST00000289865 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.18■■■□□ 2.1
USP21-201ENST00000289865 NEUROD1Q13562 356 aa28.16■■■□□ 2.1
USP21-201ENST00000289865 GRIN2BQ13224 1484 aa28.14■■■□□ 2.1
USP21-201ENST00000289865 MAPKBP1O60336 1514 aa28.13■■■□□ 2.09
USP21-201ENST00000289865 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
USP21-201ENST00000289865 ADAMTS12P58397 1594 aa28.13■■■□□ 2.09
USP21-201ENST00000289865 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.12■■■□□ 2.09
USP21-201ENST00000289865 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
USP21-201ENST00000289865 MIER1Q8N108 512 aa28.1■■■□□ 2.09
USP21-201ENST00000289865 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
USP21-201ENST00000289865 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.08■■■□□ 2.09
USP21-201ENST00000289865 IQGAP2Q13576 1575 aa28.06■■■□□ 2.08
USP21-201ENST00000289865 IFT140Q96RY7 1462 aa28.02■■■□□ 2.08
USP21-201ENST00000289865 WDR62O43379 1518 aa28.02■■■□□ 2.08
USP21-201ENST00000289865 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
USP21-201ENST00000289865 NCOA2Q15596 1464 aa28■■■□□ 2.07
USP21-201ENST00000289865 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28■■■□□ 2.07
USP21-201ENST00000289865 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
USP21-201ENST00000289865 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.95■■■□□ 2.06
USP21-201ENST00000289865 HECW1Q76N89 1606 aa27.95■■■□□ 2.06
USP21-201ENST00000289865 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.95■■■□□ 2.06
USP21-201ENST00000289865 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
USP21-201ENST00000289865 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.92■■■□□ 2.06
USP21-201ENST00000289865 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.89■■■□□ 2.06
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USP21-201ENST00000289865 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.87■■■□□ 2.05
USP21-201ENST00000289865 ARHGEF11O15085 1522 aa27.87■■■□□ 2.05
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USP21-201ENST00000289865 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
USP21-201ENST00000289865 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.85■■■□□ 2.05
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USP21-201ENST00000289865 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.82■■■□□ 2.04
USP21-201ENST00000289865 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
USP21-201ENST00000289865 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.8■■■□□ 2.04
USP21-201ENST00000289865 GRIN2AQ12879 1464 aa27.77■■■□□ 2.04
USP21-201ENST00000289865 KIAA0556O60303 1618 aa27.77■■■□□ 2.04
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USP21-201ENST00000289865 ARID3CA6NKF2 412 aa27.73■■■□□ 2.03
USP21-201ENST00000289865 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
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USP21-201ENST00000289865 UACAQ9BZF9 1416 aa27.73■■■□□ 2.03
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USP21-201ENST00000289865 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.62■■■□□ 2.01
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USP21-201ENST00000289865 SYNJ2O15056 1496 aa27.61■■■□□ 2.01
USP21-201ENST00000289865 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
USP21-201ENST00000289865 CEP170Q5SW79 1584 aa27.6■■■□□ 2.01
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USP21-201ENST00000289865 TONSLQ96HA7 1378 aa27.58■■■□□ 2
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USP21-201ENST00000289865 FBLN2P98095 1184 aa27.53■■■□□ 2
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USP21-201ENST00000289865 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
USP21-201ENST00000289865 NUP160Q12769 1436 aa27.46■■□□□ 1.99
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USP21-201ENST00000289865 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.42■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 JPH4Q96JJ6 628 aa27.41■■□□□ 1.98
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