RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
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PTPRR-201ENST00000283228 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
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PTPRR-201ENST00000283228 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
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PTPRR-201ENST00000283228 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.03■□□□□ -0
PTPRR-201ENST00000283228 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.03■□□□□ -0
PTPRR-201ENST00000283228 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRR-201ENST00000283228 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.03■□□□□ -0
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC7Q96M83 1385 aa15.02■□□□□ -0
PTPRR-201ENST00000283228 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRR-201ENST00000283228 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.02□□□□□ -0.01
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