RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281456.10

SLC25A4-201, Transcript of solute carrier family 25 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A4, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A4-201ENST00000281456 KCNH8Q96L42 1107 aa22.29■■□□□ 1.16
SLC25A4-201ENST00000281456 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SLC25A4-201ENST00000281456 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC25A4-201ENST00000281456 TSPY4P0CV99 314 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC25A4-201ENST00000281456 TSPY10P0CW01 314 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC25A4-201ENST00000281456 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC25A4-201ENST00000281456 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SLC25A4-201ENST00000281456 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC25A4-201ENST00000281456 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC25A4-201ENST00000281456 CUX1P39880 1505 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC25A4-201ENST00000281456 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A4-201ENST00000281456 TONSLQ96HA7 1378 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A4-201ENST00000281456 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A4-201ENST00000281456 FMN1Q68DA7 1419 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC25A4-201ENST00000281456 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 25.6
SLC25A4-201ENST00000281456 TOP2BQ02880 1626 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC25A4-201ENST00000281456 JPH4Q96JJ6 628 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC25A4-201ENST00000281456 TOPBP1Q92547 1522 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC25A4-201ENST00000281456 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC25A4-201ENST00000281456 NEFLP07196 543 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC25A4-201ENST00000281456 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SLC25A4-201ENST00000281456 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SLC25A4-201ENST00000281456 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC25A4-201ENST00000281456 PRXQ9BXM0 1461 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC25A4-201ENST00000281456 ANP32CO43423 234 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC25A4-201ENST00000281456 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC25A4-201ENST00000281456 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC25A4-201ENST00000281456 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC25A4-201ENST00000281456 KIF21BO75037 1637 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC25A4-201ENST00000281456 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SLC25A4-201ENST00000281456 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC25A4-201ENST00000281456 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC25A4-201ENST00000281456 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC25A4-201ENST00000281456 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC25A4-201ENST00000281456 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC25A4-201ENST00000281456 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC25A4-201ENST00000281456 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SLC25A4-201ENST00000281456 GRIN2BQ13224 1484 aa21.83■■□□□ 1.08
SLC25A4-201ENST00000281456 ARAP1Q96P48 1450 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC25A4-201ENST00000281456 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC25A4-201ENST00000281456 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC25A4-201ENST00000281456 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SLC25A4-201ENST00000281456 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.76■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.76■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 IFT140Q96RY7 1462 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 RGL3Q3MIN7 710 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 PTPRGP23470 1445 aa21.73■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 BCANQ96GW7 911 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC25A4-201ENST00000281456 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC25A4-201ENST00000281456 FOXD1Q16676 465 aa21.66■■□□□ 1.06
SLC25A4-201ENST00000281456 MIER1Q8N108 512 aa21.66■■□□□ 1.06
SLC25A4-201ENST00000281456 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
SLC25A4-201ENST00000281456 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.06
SLC25A4-201ENST00000281456 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.62■■□□□ 1.05
SLC25A4-201ENST00000281456 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.62■■□□□ 1.05
SLC25A4-201ENST00000281456 OSCARQ8IYS5 282 aa21.61■■□□□ 1.05
SLC25A4-201ENST00000281456 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.61■■□□□ 1.05
SLC25A4-201ENST00000281456 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.6■■□□□ 1.05
SLC25A4-201ENST00000281456 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SLC25A4-201ENST00000281456 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC25A4-201ENST00000281456 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC25A4-201ENST00000281456 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.56■■□□□ 1.04
SLC25A4-201ENST00000281456 PKD2Q13563 968 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC25A4-201ENST00000281456 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC25A4-201ENST00000281456 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC25A4-201ENST00000281456 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 NUP155O75694 1391 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC25A4-201ENST00000281456 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 PRDM2Q13029 1718 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 GGT6Q6P531 493 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 NCOA2Q15596 1464 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
SLC25A4-201ENST00000281456 CUL7Q14999 1698 aa21.37■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 KIF3BO15066 747 aa21.37■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 MLECQ14165 292 aa21.36■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 MRS2Q9HD23 443 aa21.35■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 MYT1Q01538 1121 aa21.35■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 SYNJ2O15056 1496 aa21.34■■□□□ 1.01
SLC25A4-201ENST00000281456 TMC1Q8TDI8 760 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms