RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
PTPN3-201ENST00000262539 WDR97A6NE52 1622 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPN3-201ENST00000262539 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
PTPN3-201ENST00000262539 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPN3-201ENST00000262539 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPN3-201ENST00000262539 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPN3-201ENST00000262539 CUL7Q14999 1698 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPN3-201ENST00000262539 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPN3-201ENST00000262539 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPN3-201ENST00000262539 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPN3-201ENST00000262539 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPN3-201ENST00000262539 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPN3-201ENST00000262539 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 NESP48681 1621 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 FBLN2P98095 1184 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 ARAP1Q96P48 1450 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPN3-201ENST00000262539 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 P3H3Q8IVL6 736 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 PRDM2Q13029 1718 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 MIA2Q96PC5 1412 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 SYNJ2O15056 1496 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 WDR62O43379 1518 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 TSPY4P0CV99 314 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 TSPY10P0CW01 314 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 JPH4Q96JJ6 628 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 NEFLP07196 543 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPN3-201ENST00000262539 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 ITGAEP38570 1179 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 AKNAQ7Z591 1439 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 GRIN2AQ12879 1464 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 TIAM1Q13009 1591 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 PTPRGP23470 1445 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 IQGAP2Q13576 1575 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPN3-201ENST00000262539 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 TONSLQ96HA7 1378 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 NUP160Q12769 1436 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 HECW1Q76N89 1606 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 ADAMTS12P58397 1594 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM52Q96A61 297 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPN3-201ENST00000262539 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 NCOA2Q15596 1464 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 ROCK1Q13464 1354 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 HFM1A2PYH4 1435 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 STAC3Q96MF2 364 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 SLC24A1O60721 1099 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 UACAQ9BZF9 1416 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPN3-201ENST00000262539 SAMD9Q5K651 1589 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPN3-201ENST00000262539 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPN3-201ENST00000262539 MYT1Q01538 1121 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPN3-201ENST00000262539 BCANQ96GW7 911 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPN3-201ENST00000262539 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PTPN3-201ENST00000262539 OSCARQ8IYS5 282 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPN3-201ENST00000262539 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 KIAA0556O60303 1618 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 KANK1Q14678 1352 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 ANP32CO43423 234 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPN3-201ENST00000262539 NEUROD1Q13562 356 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPN3-201ENST00000262539 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.39□□□□□ -0.59
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