RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-201ENST00000262291 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
VMP1-201ENST00000262291 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.58■□□□□ 0.88
VMP1-201ENST00000262291 CUL7Q14999 1698 aa20.58■□□□□ 0.88
VMP1-201ENST00000262291 ERCC6Q03468 1493 aa20.57■□□□□ 0.88
VMP1-201ENST00000262291 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
VMP1-201ENST00000262291 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
VMP1-201ENST00000262291 ITGAEP38570 1179 aa20.47■□□□□ 0.87
VMP1-201ENST00000262291 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.47■□□□□ 0.87
VMP1-201ENST00000262291 PBRM1Q86U86 1689 aa20.44■□□□□ 0.86
VMP1-201ENST00000262291 WDR62O43379 1518 aa20.44■□□□□ 0.86
VMP1-201ENST00000262291 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
VMP1-201ENST00000262291 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.4■□□□□ 0.86
VMP1-201ENST00000262291 TIAM1Q13009 1591 aa20.39■□□□□ 0.86
VMP1-201ENST00000262291 IFT140Q96RY7 1462 aa20.39■□□□□ 0.86
VMP1-201ENST00000262291 GRIN2BQ13224 1484 aa20.38■□□□□ 0.85
VMP1-201ENST00000262291 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.35■□□□□ 0.85
VMP1-201ENST00000262291 ADAMTS12P58397 1594 aa20.34■□□□□ 0.85
VMP1-201ENST00000262291 FBLN2P98095 1184 aa20.34■□□□□ 0.85
VMP1-201ENST00000262291 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.34■□□□□ 0.85
VMP1-201ENST00000262291 ARID3CA6NKF2 412 aa20.33■□□□□ 0.85
VMP1-201ENST00000262291 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.32■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.32■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.3■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.29■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 FMN1Q68DA7 1419 aa20.27■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.27■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 SAMD9Q5K651 1589 aa20.27■□□□□ 0.84
VMP1-201ENST00000262291 MAP3K1Q13233 1512 aa20.24■□□□□ 0.83
VMP1-201ENST00000262291 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.24■□□□□ 0.83
VMP1-201ENST00000262291 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
VMP1-201ENST00000262291 IQGAP2Q13576 1575 aa20.23■□□□□ 0.83
VMP1-201ENST00000262291 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.19■□□□□ 0.82
VMP1-201ENST00000262291 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.18■□□□□ 0.82
VMP1-201ENST00000262291 GRIN2AQ12879 1464 aa20.17■□□□□ 0.82
VMP1-201ENST00000262291 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VMP1-201ENST00000262291 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.1■□□□□ 0.81
VMP1-201ENST00000262291 MYT1Q01538 1121 aa20.1■□□□□ 0.81
VMP1-201ENST00000262291 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
VMP1-201ENST00000262291 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 SYNJ2O15056 1496 aa20.07■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.07■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 CEP170Q5SW79 1584 aa20.07■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.06■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 DISP1Q96F81 1524 aa20.06■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.06■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 NCOA2Q15596 1464 aa20.04■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.02■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 KIAA0556O60303 1618 aa20.02■□□□□ 0.8
VMP1-201ENST00000262291 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
VMP1-201ENST00000262291 JPH4Q96JJ6 628 aa20.01■□□□□ 0.79
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VMP1-201ENST00000262291 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.99■□□□□ 0.79
VMP1-201ENST00000262291 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.96■□□□□ 0.79
VMP1-201ENST00000262291 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.96■□□□□ 0.79
VMP1-201ENST00000262291 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.95■□□□□ 0.78
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VMP1-201ENST00000262291 PTPRKQ15262 1439 aa19.94■□□□□ 0.78
VMP1-201ENST00000262291 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.94■□□□□ 0.78
VMP1-201ENST00000262291 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.94■□□□□ 0.78
VMP1-201ENST00000262291 NUP160Q12769 1436 aa19.93■□□□□ 0.78
VMP1-201ENST00000262291 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
VMP1-201ENST00000262291 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
VMP1-201ENST00000262291 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
VMP1-201ENST00000262291 NEUROD1Q13562 356 aa19.92■□□□□ 0.78
VMP1-201ENST00000262291 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.88■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.87■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.87■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.86■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.86■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.86■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.771e-15■■■■□ 25.8
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VMP1-201ENST00000262291 ARHGEF11O15085 1522 aa19.84■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 MAPKBP1O60336 1514 aa19.84■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa19.84■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
VMP1-201ENST00000262291 CHD1O14646 1710 aa19.81■□□□□ 0.76
VMP1-201ENST00000262291 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
VMP1-201ENST00000262291 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
VMP1-201ENST00000262291 NAIPQ13075 1403 aa19.75■□□□□ 0.75
VMP1-201ENST00000262291 HFM1A2PYH4 1435 aa19.73■□□□□ 0.75
VMP1-201ENST00000262291 PTPRGP23470 1445 aa19.72■□□□□ 0.75
VMP1-201ENST00000262291 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
VMP1-201ENST00000262291 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
VMP1-201ENST00000262291 TRIM52Q96A61 297 aa19.71■□□□□ 0.75
VMP1-201ENST00000262291 KIF14Q15058 1648 aa19.71■□□□□ 0.75
VMP1-201ENST00000262291 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
VMP1-201ENST00000262291 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.69■□□□□ 0.74
VMP1-201ENST00000262291 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.69■□□□□ 0.74
VMP1-201ENST00000262291 ATP10BO94823 1461 aa19.68■□□□□ 0.74
VMP1-201ENST00000262291 MIA2Q96PC5 1412 aa19.68■□□□□ 0.74
VMP1-201ENST00000262291 ABCA8O94911 1581 aa19.67■□□□□ 0.74
VMP1-201ENST00000262291 KDM6BO15054 1643 aa19.66■□□□□ 0.74
VMP1-201ENST00000262291 MIER1Q8N108 512 aa19.63■□□□□ 0.73
VMP1-201ENST00000262291 ABCC5O15440 1437 aa19.63■□□□□ 0.73
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