RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 OSCARQ8IYS5 282 aa17.64■□□□□ 0.41
TTPA-201ENST00000260116 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
TTPA-201ENST00000260116 P3H3Q8IVL6 736 aa17.61■□□□□ 0.41
TTPA-201ENST00000260116 NUP160Q12769 1436 aa17.6■□□□□ 0.41
TTPA-201ENST00000260116 JPH4Q96JJ6 628 aa17.54■□□□□ 0.4
TTPA-201ENST00000260116 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.54■□□□□ 0.4
TTPA-201ENST00000260116 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.52■□□□□ 0.4
TTPA-201ENST00000260116 IQGAP2Q13576 1575 aa17.52■□□□□ 0.4
TTPA-201ENST00000260116 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.51■□□□□ 0.39
TTPA-201ENST00000260116 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.51■□□□□ 0.39
TTPA-201ENST00000260116 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.5■□□□□ 0.39
TTPA-201ENST00000260116 CEP162Q5TB80 1403 aa17.48■□□□□ 0.39
TTPA-201ENST00000260116 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
TTPA-201ENST00000260116 CLIP1P30622 1438 aa17.43■□□□□ 0.38
TTPA-201ENST00000260116 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.43■□□□□ 0.38
TTPA-201ENST00000260116 DISP1Q96F81 1524 aa17.42■□□□□ 0.38
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.41■□□□□ 0.38
TTPA-201ENST00000260116 ARID3CA6NKF2 412 aa17.4■□□□□ 0.38
TTPA-201ENST00000260116 ARAP1Q96P48 1450 aa17.38■□□□□ 0.37
TTPA-201ENST00000260116 SHROOM2Q13796 1616 aa17.37■□□□□ 0.37
TTPA-201ENST00000260116 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.37■□□□□ 0.37
TTPA-201ENST00000260116 ARHGEF11O15085 1522 aa17.36■□□□□ 0.37
TTPA-201ENST00000260116 KIAA0556O60303 1618 aa17.35■□□□□ 0.37
TTPA-201ENST00000260116 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
TTPA-201ENST00000260116 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.34■□□□□ 0.37
TTPA-201ENST00000260116 SAMD9Q5K651 1589 aa17.33■□□□□ 0.36
TTPA-201ENST00000260116 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.32■□□□□ 0.36
TTPA-201ENST00000260116 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.31■□□□□ 0.36
TTPA-201ENST00000260116 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.31■□□□□ 0.36
TTPA-201ENST00000260116 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.31■□□□□ 0.36
TTPA-201ENST00000260116 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.3■□□□□ 0.36
TTPA-201ENST00000260116 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.28■□□□□ 0.36
TTPA-201ENST00000260116 PTPRGP23470 1445 aa17.27■□□□□ 0.36
TTPA-201ENST00000260116 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.26■□□□□ 0.35
TTPA-201ENST00000260116 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TTPA-201ENST00000260116 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TTPA-201ENST00000260116 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
TTPA-201ENST00000260116 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TTPA-201ENST00000260116 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.17■□□□□ 0.34
TTPA-201ENST00000260116 FMN1Q68DA7 1419 aa17.16■□□□□ 0.34
TTPA-201ENST00000260116 UACAQ9BZF9 1416 aa17.13■□□□□ 0.33
TTPA-201ENST00000260116 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
TTPA-201ENST00000260116 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.12■□□□□ 0.33
TTPA-201ENST00000260116 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TTPA-201ENST00000260116 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.12■□□□□ 0.33
TTPA-201ENST00000260116 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.11■□□□□ 0.33
TTPA-201ENST00000260116 ABCA8O94911 1581 aa17.1■□□□□ 0.33
TTPA-201ENST00000260116 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.08■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 ABCC2Q92887 1545 aa17.07■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 ATP10BO94823 1461 aa17.05■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.05■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 HECW1Q76N89 1606 aa17.03■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 KCNH8Q96L42 1107 aa17.03■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 APLP2Q06481 763 aa17.02■□□□□ 0.32
TTPA-201ENST00000260116 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TTPA-201ENST00000260116 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
TTPA-201ENST00000260116 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17■□□□□ 0.31
TTPA-201ENST00000260116 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.98■□□□□ 0.31
TTPA-201ENST00000260116 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.98■□□□□ 0.31
TTPA-201ENST00000260116 TIAM1Q13009 1591 aa16.95■□□□□ 0.3
TTPA-201ENST00000260116 ASXL2Q76L83 1435 aa16.94■□□□□ 0.3
TTPA-201ENST00000260116 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.94■□□□□ 0.3
TTPA-201ENST00000260116 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.94■□□□□ 0.3
TTPA-201ENST00000260116 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.91■□□□□ 0.3
TTPA-201ENST00000260116 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.9■□□□□ 0.3
TTPA-201ENST00000260116 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.9■□□□□ 0.3
TTPA-201ENST00000260116 KIF14Q15058 1648 aa16.89■□□□□ 0.29
TTPA-201ENST00000260116 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTPA-201ENST00000260116 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.87■□□□□ 0.29
TTPA-201ENST00000260116 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TTPA-201ENST00000260116 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TTPA-201ENST00000260116 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.85■□□□□ 0.29
TTPA-201ENST00000260116 MAPKBP1O60336 1514 aa16.81■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.81■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.81■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 NCOA2Q15596 1464 aa16.8■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.8■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 MAP3K1Q13233 1512 aa16.79■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TTPA-201ENST00000260116 TSPOAP1O95153 1857 aa16.76■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 DIP2BQ9P265 1576 aa16.75■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.75■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.73■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.73■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 ITGAEP38570 1179 aa16.71■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 CD109Q6YHK3 1445 aa16.71■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
TTPA-201ENST00000260116 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTPA-201ENST00000260116 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.69■□□□□ 0.26
TTPA-201ENST00000260116 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.68■□□□□ 0.26
TTPA-201ENST00000260116 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPA-201ENST00000260116 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.67■□□□□ 0.26
TTPA-201ENST00000260116 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.65■□□□□ 0.26
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