RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254051.10

TNS4-201, Transcript of tensin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS4, Length 4,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS4-201ENST00000254051 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS4-201ENST00000254051 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS4-201ENST00000254051 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS4-201ENST00000254051 TOPBP1Q92547 1522 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS4-201ENST00000254051 ARAP1Q96P48 1450 aa11.56□□□□□ -0.56
TNS4-201ENST00000254051 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.55□□□□□ -0.56
TNS4-201ENST00000254051 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TNS4-201ENST00000254051 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.54□□□□□ -0.56
TNS4-201ENST00000254051 IGF1RP08069 1367 aa11.54□□□□□ -0.56
TNS4-201ENST00000254051 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TNS4-201ENST00000254051 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.51□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 IFT140Q96RY7 1462 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 TRIM52Q96A61 297 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 WDR97A6NE52 1622 aa11.47□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 JPH4Q96JJ6 628 aa11.46□□□□□ -0.57
TNS4-201ENST00000254051 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
TNS4-201ENST00000254051 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS4-201ENST00000254051 GRIN2BQ13224 1484 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS4-201ENST00000254051 KCNH8Q96L42 1107 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS4-201ENST00000254051 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS4-201ENST00000254051 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
TNS4-201ENST00000254051 FMN1Q68DA7 1419 aa11.4□□□□□ -0.58
TNS4-201ENST00000254051 OSCARQ8IYS5 282 aa11.4□□□□□ -0.58
TNS4-201ENST00000254051 NEUROD1Q13562 356 aa11.39□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.38□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.38□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.38□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.38□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 TSPY4P0CV99 314 aa11.37□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 TSPY10P0CW01 314 aa11.37□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 CUL7Q14999 1698 aa11.36□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.36□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.35□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TNS4-201ENST00000254051 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 TIAM1Q13009 1591 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 PTPRGP23470 1445 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 MAP3K1Q13233 1512 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.28□□□□□ -0.6
TNS4-201ENST00000254051 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 PBRM1Q86U86 1689 aa11.26□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 SAMD9Q5K651 1589 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.25□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.24□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 SYNJ2O15056 1496 aa11.23□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 PLEKHG5O94827 1062 aa11.22□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.21□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TNS4-201ENST00000254051 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 GRIN2AQ12879 1464 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 WDR62O43379 1518 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 ADAMTS12P58397 1594 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 BCANQ96GW7 911 aa11.16□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TNS4-201ENST00000254051 IQGAP2Q13576 1575 aa11.14□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 TONSLQ96HA7 1378 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 MAPKBP1O60336 1514 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.12□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.1□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.09□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.09□□□□□ -0.63
TNS4-201ENST00000254051 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
TNS4-201ENST00000254051 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.08□□□□□ -0.64
TNS4-201ENST00000254051 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms