RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.33■■□□□ 1.48
GINS2-201ENST00000253462 ERCC6Q03468 1493 aa24.31■■□□□ 1.48
GINS2-201ENST00000253462 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
GINS2-201ENST00000253462 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.29■■□□□ 1.48
GINS2-201ENST00000253462 PBRM1Q86U86 1689 aa24.26■■□□□ 1.47
GINS2-201ENST00000253462 WDR62O43379 1518 aa24.25■■□□□ 1.47
GINS2-201ENST00000253462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GINS2-201ENST00000253462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.21■■□□□ 1.47
GINS2-201ENST00000253462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GINS2-201ENST00000253462 IFT140Q96RY7 1462 aa24.19■■□□□ 1.46
GINS2-201ENST00000253462 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.19■■□□□ 1.46
GINS2-201ENST00000253462 TIAM1Q13009 1591 aa24.18■■□□□ 1.46
GINS2-201ENST00000253462 GRIN2BQ13224 1484 aa24.15■■□□□ 1.46
GINS2-201ENST00000253462 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
GINS2-201ENST00000253462 ADAMTS12P58397 1594 aa24.12■■□□□ 1.45
GINS2-201ENST00000253462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GINS2-201ENST00000253462 MAP3K1Q13233 1512 aa24.1■■□□□ 1.45
GINS2-201ENST00000253462 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.09■■□□□ 1.45
GINS2-201ENST00000253462 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GINS2-201ENST00000253462 ITGAEP38570 1179 aa24.07■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 SAMD9Q5K651 1589 aa24.07■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.06■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.06■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 FMN1Q68DA7 1419 aa24.06■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.05■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.04■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.02■■□□□ 1.44
GINS2-201ENST00000253462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.99■■□□□ 1.43
GINS2-201ENST00000253462 IQGAP2Q13576 1575 aa23.99■■□□□ 1.43
GINS2-201ENST00000253462 FBLN2P98095 1184 aa23.94■■□□□ 1.42
GINS2-201ENST00000253462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.92■■□□□ 1.42
GINS2-201ENST00000253462 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GINS2-201ENST00000253462 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
GINS2-201ENST00000253462 GRIN2AQ12879 1464 aa23.9■■□□□ 1.42
GINS2-201ENST00000253462 NEUROD1Q13562 356 aa23.88■■□□□ 1.41
GINS2-201ENST00000253462 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.88■■□□□ 1.41
GINS2-201ENST00000253462 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
GINS2-201ENST00000253462 ARID3CA6NKF2 412 aa23.85■■□□□ 1.41
GINS2-201ENST00000253462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
GINS2-201ENST00000253462 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.84■■□□□ 1.41
GINS2-201ENST00000253462 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
GINS2-201ENST00000253462 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.81■■□□□ 1.4
GINS2-201ENST00000253462 SYNJ2O15056 1496 aa23.8■■□□□ 1.4
GINS2-201ENST00000253462 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
GINS2-201ENST00000253462 CEP170Q5SW79 1584 aa23.76■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 DISP1Q96F81 1524 aa23.76■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 KIAA0556O60303 1618 aa23.74■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 HECW1Q76N89 1606 aa23.74■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.73■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.72■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 NCOA2Q15596 1464 aa23.72■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.71■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.71■■□□□ 1.39
GINS2-201ENST00000253462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
GINS2-201ENST00000253462 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.68■■□□□ 1.38
GINS2-201ENST00000253462 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.66■■□□□ 1.38
GINS2-201ENST00000253462 JPH4Q96JJ6 628 aa23.66■■□□□ 1.38
GINS2-201ENST00000253462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.64■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 NUP160Q12769 1436 aa23.63■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.63■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.63■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 MIER1Q8N108 512 aa23.6■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.58■■□□□ 1.37
GINS2-201ENST00000253462 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
GINS2-201ENST00000253462 ARHGEF11O15085 1522 aa23.56■■□□□ 1.36
GINS2-201ENST00000253462 PTPRKQ15262 1439 aa23.55■■□□□ 1.36
GINS2-201ENST00000253462 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.55■■□□□ 1.36
GINS2-201ENST00000253462 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.55■■□□□ 1.36
GINS2-201ENST00000253462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.53■■□□□ 1.36
GINS2-201ENST00000253462 MAPKBP1O60336 1514 aa23.49■■□□□ 1.35
GINS2-201ENST00000253462 CHD1O14646 1710 aa23.48■■□□□ 1.35
GINS2-201ENST00000253462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.47■■□□□ 1.35
GINS2-201ENST00000253462 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GINS2-201ENST00000253462 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GINS2-201ENST00000253462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.42■■□□□ 1.34
GINS2-201ENST00000253462 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.41■■□□□ 1.34
GINS2-201ENST00000253462 HFM1A2PYH4 1435 aa23.4■■□□□ 1.34
GINS2-201ENST00000253462 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GINS2-201ENST00000253462 NAIPQ13075 1403 aa23.38■■□□□ 1.33
GINS2-201ENST00000253462 MIA2Q96PC5 1412 aa23.38■■□□□ 1.33
GINS2-201ENST00000253462 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GINS2-201ENST00000253462 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GINS2-201ENST00000253462 ABCA8O94911 1581 aa23.33■■□□□ 1.33
GINS2-201ENST00000253462 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
GINS2-201ENST00000253462 PTPRGP23470 1445 aa23.32■■□□□ 1.32
GINS2-201ENST00000253462 KIF14Q15058 1648 aa23.31■■□□□ 1.32
GINS2-201ENST00000253462 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.29■■□□□ 1.32
GINS2-201ENST00000253462 ATP10BO94823 1461 aa23.29■■□□□ 1.32
GINS2-201ENST00000253462 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GINS2-201ENST00000253462 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GINS2-201ENST00000253462 UACAQ9BZF9 1416 aa23.27■■□□□ 1.32
GINS2-201ENST00000253462 DAPK1P53355 1430 aa23.24■■□□□ 1.31
GINS2-201ENST00000253462 TRIM52Q96A61 297 aa23.24■■□□□ 1.31
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