RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.75■■□□□ 1.71
CCL25-201ENST00000253451 OSCARQ8IYS5 282 aa25.72■■□□□ 1.71
CCL25-201ENST00000253451 IQGAP2Q13576 1575 aa25.67■■□□□ 1.7
CCL25-201ENST00000253451 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.67■■□□□ 1.7
CCL25-201ENST00000253451 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CCL25-201ENST00000253451 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.62■■□□□ 1.69
CCL25-201ENST00000253451 SHROOM2Q13796 1616 aa25.6■■□□□ 1.69
CCL25-201ENST00000253451 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.54■■□□□ 1.68
CCL25-201ENST00000253451 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.52■■□□□ 1.68
CCL25-201ENST00000253451 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.48■■□□□ 1.67
CCL25-201ENST00000253451 JPH4Q96JJ6 628 aa25.47■■□□□ 1.67
CCL25-201ENST00000253451 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CCL25-201ENST00000253451 SAMD9Q5K651 1589 aa25.44■■□□□ 1.66
CCL25-201ENST00000253451 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CCL25-201ENST00000253451 KIAA0556O60303 1618 aa25.44■■□□□ 1.66
CCL25-201ENST00000253451 DISP1Q96F81 1524 aa25.42■■□□□ 1.66
CCL25-201ENST00000253451 ARHGEF11O15085 1522 aa25.4■■□□□ 1.66
CCL25-201ENST00000253451 CEP162Q5TB80 1403 aa25.39■■□□□ 1.66
CCL25-201ENST00000253451 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.39■■□□□ 1.66
CCL25-201ENST00000253451 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.37■■□□□ 1.65
CCL25-201ENST00000253451 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.37■■□□□ 1.65
CCL25-201ENST00000253451 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.37■■□□□ 1.65
CCL25-201ENST00000253451 CLIP1P30622 1438 aa25.36■■□□□ 1.65
CCL25-201ENST00000253451 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.35■■□□□ 1.65
CCL25-201ENST00000253451 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.35■■□□□ 1.65
CCL25-201ENST00000253451 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.29■■□□□ 1.64
CCL25-201ENST00000253451 P3H3Q8IVL6 736 aa25.29■■□□□ 1.64
CCL25-201ENST00000253451 ARAP1Q96P48 1450 aa25.26■■□□□ 1.63
CCL25-201ENST00000253451 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CCL25-201ENST00000253451 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CCL25-201ENST00000253451 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.19■■□□□ 1.62
CCL25-201ENST00000253451 PTPRGP23470 1445 aa25.18■■□□□ 1.62
CCL25-201ENST00000253451 ABCA8O94911 1581 aa25.1■■□□□ 1.61
CCL25-201ENST00000253451 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.1■■□□□ 1.61
CCL25-201ENST00000253451 FMN1Q68DA7 1419 aa25.1■■□□□ 1.61
CCL25-201ENST00000253451 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CCL25-201ENST00000253451 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.09■■□□□ 1.61
CCL25-201ENST00000253451 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.07■■□□□ 1.6
CCL25-201ENST00000253451 ABCC2Q92887 1545 aa25.05■■□□□ 1.6
CCL25-201ENST00000253451 UACAQ9BZF9 1416 aa25.04■■□□□ 1.6
CCL25-201ENST00000253451 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.03■■□□□ 1.6
CCL25-201ENST00000253451 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCL25-201ENST00000253451 HECW1Q76N89 1606 aa25.01■■□□□ 1.59
CCL25-201ENST00000253451 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25■■□□□ 1.59
CCL25-201ENST00000253451 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.99■■□□□ 1.59
CCL25-201ENST00000253451 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.98■■□□□ 1.59
CCL25-201ENST00000253451 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CCL25-201ENST00000253451 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.98■■□□□ 1.59
CCL25-201ENST00000253451 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCL25-201ENST00000253451 ARID3CA6NKF2 412 aa24.9■■□□□ 1.58
CCL25-201ENST00000253451 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CCL25-201ENST00000253451 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CCL25-201ENST00000253451 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.89■■□□□ 1.57
CCL25-201ENST00000253451 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CCL25-201ENST00000253451 ATP10BO94823 1461 aa24.86■■□□□ 1.57
CCL25-201ENST00000253451 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.85■■□□□ 1.57
CCL25-201ENST00000253451 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.83■■□□□ 1.57
CCL25-201ENST00000253451 TIAM1Q13009 1591 aa24.79■■□□□ 1.56
CCL25-201ENST00000253451 MAPKBP1O60336 1514 aa24.75■■□□□ 1.55
CCL25-201ENST00000253451 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CCL25-201ENST00000253451 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
CCL25-201ENST00000253451 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CCL25-201ENST00000253451 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.73■■□□□ 1.55
CCL25-201ENST00000253451 MAP3K1Q13233 1512 aa24.72■■□□□ 1.55
CCL25-201ENST00000253451 ASXL2Q76L83 1435 aa24.71■■□□□ 1.55
CCL25-201ENST00000253451 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.69■■□□□ 1.54
CCL25-201ENST00000253451 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.65■■□□□ 1.54
CCL25-201ENST00000253451 APLP2Q06481 763 aa24.64■■□□□ 1.54
CCL25-201ENST00000253451 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CCL25-201ENST00000253451 KIF14Q15058 1648 aa24.63■■□□□ 1.53
CCL25-201ENST00000253451 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.63■■□□□ 1.53
CCL25-201ENST00000253451 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.61■■□□□ 1.53
CCL25-201ENST00000253451 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.6■■□□□ 1.53
CCL25-201ENST00000253451 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CCL25-201ENST00000253451 DIP2BQ9P265 1576 aa24.59■■□□□ 1.53
CCL25-201ENST00000253451 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CCL25-201ENST00000253451 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.55■■□□□ 1.52
CCL25-201ENST00000253451 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CCL25-201ENST00000253451 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.54■■□□□ 1.52
CCL25-201ENST00000253451 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.54■■□□□ 1.52
CCL25-201ENST00000253451 KCNH8Q96L42 1107 aa24.53■■□□□ 1.52
CCL25-201ENST00000253451 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
CCL25-201ENST00000253451 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.51■■□□□ 1.51
CCL25-201ENST00000253451 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CCL25-201ENST00000253451 GLI2P10070 1586 aa24.5■■□□□ 1.51
CCL25-201ENST00000253451 NCOA2Q15596 1464 aa24.48■■□□□ 1.51
CCL25-201ENST00000253451 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.46■■□□□ 1.51
CCL25-201ENST00000253451 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.44■■□□□ 1.5
CCL25-201ENST00000253451 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.44■■□□□ 1.5
CCL25-201ENST00000253451 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.42■■□□□ 1.5
CCL25-201ENST00000253451 PREX2Q70Z35 1606 aa24.41■■□□□ 1.5
CCL25-201ENST00000253451 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.4■■□□□ 1.5
CCL25-201ENST00000253451 TSPOAP1O95153 1857 aa24.38■■□□□ 1.49
CCL25-201ENST00000253451 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCL25-201ENST00000253451 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.37■■□□□ 1.49
CCL25-201ENST00000253451 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.36■■□□□ 1.49
CCL25-201ENST00000253451 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.36■■□□□ 1.49
CCL25-201ENST00000253451 CD109Q6YHK3 1445 aa24.35■■□□□ 1.49
CCL25-201ENST00000253451 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CCL25-201ENST00000253451 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.32■■□□□ 1.48
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