RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239151.5

HOXB5-201, Transcript of homeobox B5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB5, Length 2,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5-201ENST00000239151 NUP160Q12769 1436 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXB5-201ENST00000239151 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB5-201ENST00000239151 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB5-201ENST00000239151 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.64■■□□□ 1.85
HOXB5-201ENST00000239151 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB5-201ENST00000239151 JPH4Q96JJ6 628 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB5-201ENST00000239151 IQGAP2Q13576 1575 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB5-201ENST00000239151 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXB5-201ENST00000239151 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB5-201ENST00000239151 SHROOM2Q13796 1616 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB5-201ENST00000239151 P3H3Q8IVL6 736 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB5-201ENST00000239151 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB5-201ENST00000239151 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB5-201ENST00000239151 DISP1Q96F81 1524 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB5-201ENST00000239151 CEP162Q5TB80 1403 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB5-201ENST00000239151 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HOXB5-201ENST00000239151 CLIP1P30622 1438 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB5-201ENST00000239151 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXB5-201ENST00000239151 ARHGEF11O15085 1522 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB5-201ENST00000239151 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB5-201ENST00000239151 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXB5-201ENST00000239151 KIAA0556O60303 1618 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB5-201ENST00000239151 SAMD9Q5K651 1589 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXB5-201ENST00000239151 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB5-201ENST00000239151 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB5-201ENST00000239151 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB5-201ENST00000239151 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB5-201ENST00000239151 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXB5-201ENST00000239151 ARAP1Q96P48 1450 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB5-201ENST00000239151 PTPRGP23470 1445 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB5-201ENST00000239151 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB5-201ENST00000239151 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB5-201ENST00000239151 FMN1Q68DA7 1419 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXB5-201ENST00000239151 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXB5-201ENST00000239151 ARID3CA6NKF2 412 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB5-201ENST00000239151 UACAQ9BZF9 1416 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXB5-201ENST00000239151 ABCA8O94911 1581 aa26■■□□□ 1.75
HOXB5-201ENST00000239151 VPS8Q8N3P4 1428 aa26■■□□□ 1.75
HOXB5-201ENST00000239151 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB5-201ENST00000239151 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB5-201ENST00000239151 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXB5-201ENST00000239151 ABCC2Q92887 1545 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXB5-201ENST00000239151 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB5-201ENST00000239151 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXB5-201ENST00000239151 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB5-201ENST00000239151 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB5-201ENST00000239151 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXB5-201ENST00000239151 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXB5-201ENST00000239151 ATP10BO94823 1461 aa25.87■■□□□ 1.73
HOXB5-201ENST00000239151 HECW1Q76N89 1606 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXB5-201ENST00000239151 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXB5-201ENST00000239151 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
HOXB5-201ENST00000239151 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXB5-201ENST00000239151 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HOXB5-201ENST00000239151 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXB5-201ENST00000239151 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXB5-201ENST00000239151 APLP2Q06481 763 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXB5-201ENST00000239151 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXB5-201ENST00000239151 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXB5-201ENST00000239151 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXB5-201ENST00000239151 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB5-201ENST00000239151 ASXL2Q76L83 1435 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXB5-201ENST00000239151 TIAM1Q13009 1591 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB5-201ENST00000239151 KCNH8Q96L42 1107 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB5-201ENST00000239151 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXB5-201ENST00000239151 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB5-201ENST00000239151 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB5-201ENST00000239151 MAPKBP1O60336 1514 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB5-201ENST00000239151 MAP3K1Q13233 1512 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB5-201ENST00000239151 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB5-201ENST00000239151 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXB5-201ENST00000239151 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXB5-201ENST00000239151 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXB5-201ENST00000239151 KIF14Q15058 1648 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXB5-201ENST00000239151 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB5-201ENST00000239151 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB5-201ENST00000239151 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB5-201ENST00000239151 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXB5-201ENST00000239151 DIP2BQ9P265 1576 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXB5-201ENST00000239151 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
HOXB5-201ENST00000239151 NCOA2Q15596 1464 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXB5-201ENST00000239151 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXB5-201ENST00000239151 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXB5-201ENST00000239151 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXB5-201ENST00000239151 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXB5-201ENST00000239151 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB5-201ENST00000239151 GLI2P10070 1586 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB5-201ENST00000239151 CD109Q6YHK3 1445 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXB5-201ENST00000239151 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXB5-201ENST00000239151 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXB5-201ENST00000239151 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 TSPOAP1O95153 1857 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 PLCH2O75038 1416 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXB5-201ENST00000239151 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms