RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ANP32CO43423 234 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-201ENST00000234111 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.79■■■□□ 2.36
ODC1-201ENST00000234111 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
ODC1-201ENST00000234111 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
ODC1-201ENST00000234111 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.77■■■□□ 2.36
ODC1-201ENST00000234111 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.72■■■□□ 2.35
ODC1-201ENST00000234111 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
ODC1-201ENST00000234111 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
ODC1-201ENST00000234111 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.53■■■□□ 2.32
ODC1-201ENST00000234111 NBR1Q14596 966 aa29.53■■■□□ 2.32
ODC1-201ENST00000234111 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.51■■■□□ 2.31
ODC1-201ENST00000234111 PRXQ9BXM0 1461 aa29.48■■■□□ 2.31
ODC1-201ENST00000234111 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.47■■■□□ 2.31
ODC1-201ENST00000234111 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
ODC1-201ENST00000234111 NCAPD3P42695 1498 aa29.46■■■□□ 2.31
ODC1-201ENST00000234111 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.42■■■□□ 2.3
ODC1-201ENST00000234111 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
ODC1-201ENST00000234111 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.41■■■□□ 2.3
ODC1-201ENST00000234111 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.38■■■□□ 2.29
ODC1-201ENST00000234111 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
ODC1-201ENST00000234111 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.35■■■□□ 2.29
ODC1-201ENST00000234111 TOP2BQ02880 1626 aa29.35■■■□□ 2.29
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.33■■■□□ 2.29
ODC1-201ENST00000234111 HMGXB3Q12766 1538 aa29.31■■■□□ 2.28
ODC1-201ENST00000234111 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ODC1-201ENST00000234111 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-201ENST00000234111 TIAM1Q13009 1591 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-201ENST00000234111 TONSLQ96HA7 1378 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-201ENST00000234111 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.18■■■□□ 2.26
ODC1-201ENST00000234111 IL27Q8NEV9 243 aa29.17■■■□□ 2.26
ODC1-201ENST00000234111 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ODC1-201ENST00000234111 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.16■■■□□ 2.26
ODC1-201ENST00000234111 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.15■■■□□ 2.26
ODC1-201ENST00000234111 CCDC184Q52MB2 194 aa29.12■■■□□ 2.25
ODC1-201ENST00000234111 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.12■■■□□ 2.25
ODC1-201ENST00000234111 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
ODC1-201ENST00000234111 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ODC1-201ENST00000234111 MAP3K1Q13233 1512 aa29.07■■■□□ 2.24
ODC1-201ENST00000234111 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
ODC1-201ENST00000234111 KIF27Q86VH2 1401 aa29.04■■■□□ 2.24
ODC1-201ENST00000234111 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.03■■■□□ 2.24
ODC1-201ENST00000234111 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.03■■■□□ 2.24
ODC1-201ENST00000234111 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ODC1-201ENST00000234111 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29■■■□□ 2.23
ODC1-201ENST00000234111 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.98■■■□□ 2.23
ODC1-201ENST00000234111 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
ODC1-201ENST00000234111 CFTRP13569 1480 aa28.94■■■□□ 2.22
ODC1-201ENST00000234111 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
ODC1-201ENST00000234111 MRS2Q9HD23 443 aa28.9■■■□□ 2.22
ODC1-201ENST00000234111 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.88■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.87■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 CUX1P39880 1505 aa28.87■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.87■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.86■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 AKNAQ7Z591 1439 aa28.85■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 NCOA2Q15596 1464 aa28.83■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
ODC1-201ENST00000234111 NESP48681 1621 aa28.82■■■□□ 2.2
ODC1-201ENST00000234111 UACAQ9BZF9 1416 aa28.81■■■□□ 2.2
ODC1-201ENST00000234111 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.81■■■□□ 2.2
ODC1-201ENST00000234111 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa28.76■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.195e-16■■□□□ 13.7
ODC1-201ENST00000234111 NEFMP07197 916 aa28.75■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 P3H3Q8IVL6 736 aa28.73■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ODC1-201ENST00000234111 HFM1A2PYH4 1435 aa28.7■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.182e-7■■■■□ 21.2
ODC1-201ENST00000234111 PTPRKQ15262 1439 aa28.68■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.67■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.67■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 NUDCQ9Y266 331 aa28.66■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 CCDC7Q96M83 1385 aa28.66■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 IGF1RP08069 1367 aa28.66■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.66■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 USP35Q9P2H5 1018 aa28.65■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.65■■■□□ 2.18
ODC1-201ENST00000234111 NCOA1Q15788 1441 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-201ENST00000234111 NAIPQ13075 1403 aa28.59■■■□□ 2.17
ODC1-201ENST00000234111 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.59■■■□□ 2.17
ODC1-201ENST00000234111 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.59■■■□□ 2.17
ODC1-201ENST00000234111 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.56■■■□□ 2.16
ODC1-201ENST00000234111 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.56■■■□□ 2.16
ODC1-201ENST00000234111 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.54■■■□□ 2.16
ODC1-201ENST00000234111 FMN1Q68DA7 1419 aa28.51■■■□□ 2.16
ODC1-201ENST00000234111 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
ODC1-201ENST00000234111 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.51■■■□□ 2.15
ODC1-201ENST00000234111 PRDM2Q13029 1718 aa28.5■■■□□ 2.15
ODC1-201ENST00000234111 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ODC1-201ENST00000234111 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
ODC1-201ENST00000234111 PDE4AP27815 886 aa28.49■■■□□ 2.15
ODC1-201ENST00000234111 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.47■■■□□ 2.15
ODC1-201ENST00000234111 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.46■■■□□ 2.15
ODC1-201ENST00000234111 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
ODC1-201ENST00000234111 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms