RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233535.8

SLC30A3-201, Transcript of solute carrier family 30 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC30A3, Length 2,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A3-201ENST00000233535 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.08■■■■□ 3.21
SLC30A3-201ENST00000233535 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.08■■■■□ 3.21
SLC30A3-201ENST00000233535 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
SLC30A3-201ENST00000233535 MAP3K1Q13233 1512 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC30A3-201ENST00000233535 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
SLC30A3-201ENST00000233535 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.01■■■■□ 3.19
SLC30A3-201ENST00000233535 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35■■■■□ 3.19
SLC30A3-201ENST00000233535 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
SLC30A3-201ENST00000233535 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.97■■■■□ 3.19
SLC30A3-201ENST00000233535 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.97■■■■□ 3.19
SLC30A3-201ENST00000233535 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
SLC30A3-201ENST00000233535 ITGAEP38570 1179 aa34.88■■■■□ 3.17
SLC30A3-201ENST00000233535 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC30A3-201ENST00000233535 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC30A3-201ENST00000233535 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC30A3-201ENST00000233535 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.83■■■■□ 3.17
SLC30A3-201ENST00000233535 PBRM1Q86U86 1689 aa34.82■■■■□ 3.16
SLC30A3-201ENST00000233535 FMN1Q68DA7 1419 aa34.81■■■■□ 3.16
SLC30A3-201ENST00000233535 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
SLC30A3-201ENST00000233535 SAMD9Q5K651 1589 aa34.78■■■■□ 3.16
SLC30A3-201ENST00000233535 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.73■■■■□ 3.15
SLC30A3-201ENST00000233535 WDR62O43379 1518 aa34.71■■■■□ 3.15
SLC30A3-201ENST00000233535 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
SLC30A3-201ENST00000233535 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
SLC30A3-201ENST00000233535 GRIN2BQ13224 1484 aa34.68■■■■□ 3.14
SLC30A3-201ENST00000233535 IFT140Q96RY7 1462 aa34.68■■■■□ 3.14
SLC30A3-201ENST00000233535 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
SLC30A3-201ENST00000233535 ADAMTS12P58397 1594 aa34.67■■■■□ 3.14
SLC30A3-201ENST00000233535 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
SLC30A3-201ENST00000233535 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.66■■■■□ 3.14
SLC30A3-201ENST00000233535 ERCC6Q03468 1493 aa34.6■■■■□ 3.13
SLC30A3-201ENST00000233535 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.56■■■■□ 3.12
SLC30A3-201ENST00000233535 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.56■■■■□ 3.12
SLC30A3-201ENST00000233535 IQGAP2Q13576 1575 aa34.54■■■■□ 3.12
SLC30A3-201ENST00000233535 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.53■■■■□ 3.12
SLC30A3-201ENST00000233535 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC30A3-201ENST00000233535 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
SLC30A3-201ENST00000233535 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
SLC30A3-201ENST00000233535 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.4■■■■□ 3.1
SLC30A3-201ENST00000233535 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
SLC30A3-201ENST00000233535 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
SLC30A3-201ENST00000233535 NCOA2Q15596 1464 aa34.35■■■■□ 3.09
SLC30A3-201ENST00000233535 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.34■■■■□ 3.09
SLC30A3-201ENST00000233535 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.32■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 GRIN2AQ12879 1464 aa34.31■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.3■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.29■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.29■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 MAPKBP1O60336 1514 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 HECW1Q76N89 1606 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.27■■■■□ 3.08
SLC30A3-201ENST00000233535 ARID3CA6NKF2 412 aa34.25■■■■□ 3.07
SLC30A3-201ENST00000233535 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
SLC30A3-201ENST00000233535 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
SLC30A3-201ENST00000233535 DISP1Q96F81 1524 aa34.22■■■■□ 3.07
SLC30A3-201ENST00000233535 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
SLC30A3-201ENST00000233535 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
SLC30A3-201ENST00000233535 PTPRKQ15262 1439 aa34.19■■■■□ 3.06
SLC30A3-201ENST00000233535 FBLN2P98095 1184 aa34.19■■■■□ 3.06
SLC30A3-201ENST00000233535 KIAA0556O60303 1618 aa34.18■■■■□ 3.06
SLC30A3-201ENST00000233535 ARHGEF11O15085 1522 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC30A3-201ENST00000233535 SYNJ2O15056 1496 aa34.15■■■■□ 3.06
SLC30A3-201ENST00000233535 CEP170Q5SW79 1584 aa34.1■■■■□ 3.05
SLC30A3-201ENST00000233535 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.1■■■■□ 3.05
SLC30A3-201ENST00000233535 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.09■■■■□ 3.05
SLC30A3-201ENST00000233535 MIER1Q8N108 512 aa34.07■■■■□ 3.04
SLC30A3-201ENST00000233535 HFM1A2PYH4 1435 aa34.05■■■■□ 3.04
SLC30A3-201ENST00000233535 NEUROD1Q13562 356 aa34.05■■■■□ 3.04
SLC30A3-201ENST00000233535 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
SLC30A3-201ENST00000233535 NAIPQ13075 1403 aa33.98■■■■□ 3.03
SLC30A3-201ENST00000233535 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.98■■■■□ 3.03
SLC30A3-201ENST00000233535 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
SLC30A3-201ENST00000233535 JPH4Q96JJ6 628 aa33.96■■■■□ 3.03
SLC30A3-201ENST00000233535 NUP160Q12769 1436 aa33.95■■■■□ 3.03
SLC30A3-201ENST00000233535 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.94■■■■□ 3.02
SLC30A3-201ENST00000233535 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
SLC30A3-201ENST00000233535 MIA2Q96PC5 1412 aa33.91■■■■□ 3.02
SLC30A3-201ENST00000233535 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
SLC30A3-201ENST00000233535 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.9■■■■□ 3.02
SLC30A3-201ENST00000233535 UACAQ9BZF9 1416 aa33.88■■■■□ 3.01
SLC30A3-201ENST00000233535 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.88■■■■□ 3.01
SLC30A3-201ENST00000233535 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
SLC30A3-201ENST00000233535 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.85■■■■□ 3.01
SLC30A3-201ENST00000233535 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
SLC30A3-201ENST00000233535 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.82■■■■□ 3
SLC30A3-201ENST00000233535 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
SLC30A3-201ENST00000233535 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
SLC30A3-201ENST00000233535 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
SLC30A3-201ENST00000233535 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
SLC30A3-201ENST00000233535 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
SLC30A3-201ENST00000233535 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.71■■■□□ 2.99
SLC30A3-201ENST00000233535 AKNAQ7Z591 1439 aa33.69■■■□□ 2.98
SLC30A3-201ENST00000233535 KDM6BO15054 1643 aa33.68■■■□□ 2.98
SLC30A3-201ENST00000233535 DAPK1P53355 1430 aa33.66■■■□□ 2.98
SLC30A3-201ENST00000233535 TRIM52Q96A61 297 aa33.66■■■□□ 2.98
SLC30A3-201ENST00000233535 TONSLQ96HA7 1378 aa33.64■■■□□ 2.98
SLC30A3-201ENST00000233535 ABCC5O15440 1437 aa33.63■■■□□ 2.97
SLC30A3-201ENST00000233535 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
SLC30A3-201ENST00000233535 KIF14Q15058 1648 aa33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms