RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219271.3

MMP15-201, Transcript of matrix metallopeptidase 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP15, Length 4,250 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP15-201ENST00000219271 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
MMP15-201ENST00000219271 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
MMP15-201ENST00000219271 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.5■■□□□ 1.35
MMP15-201ENST00000219271 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
MMP15-201ENST00000219271 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.356e-6■□□□□ 11
MMP15-201ENST00000219271 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.45■■□□□ 1.34
MMP15-201ENST00000219271 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.44■■□□□ 1.34
MMP15-201ENST00000219271 OSCARQ8IYS5 282 aa23.43■■□□□ 1.34
MMP15-201ENST00000219271 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.41■■□□□ 1.34
MMP15-201ENST00000219271 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.4■■□□□ 1.34
MMP15-201ENST00000219271 IGF1RP08069 1367 aa23.4■■□□□ 1.34
MMP15-201ENST00000219271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.39■■□□□ 1.34
MMP15-201ENST00000219271 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.38■■□□□ 1.33
MMP15-201ENST00000219271 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.31■■□□□ 1.32
MMP15-201ENST00000219271 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
MMP15-201ENST00000219271 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MMP15-201ENST00000219271 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.3■■□□□ 1.32
MMP15-201ENST00000219271 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
MMP15-201ENST00000219271 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.27■■□□□ 1.32
MMP15-201ENST00000219271 TOPBP1Q92547 1522 aa23.25■■□□□ 1.31
MMP15-201ENST00000219271 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
MMP15-201ENST00000219271 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.23■■□□□ 1.31
MMP15-201ENST00000219271 FMN1Q68DA7 1419 aa23.2■■□□□ 1.3
MMP15-201ENST00000219271 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
MMP15-201ENST00000219271 SYNJ1O43426 1573 aa23.19■■□□□ 1.3
MMP15-201ENST00000219271 TONSLQ96HA7 1378 aa23.18■■□□□ 1.3
MMP15-201ENST00000219271 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.17■■□□□ 1.3
MMP15-201ENST00000219271 PTPRGP23470 1445 aa23.16■■□□□ 1.3
MMP15-201ENST00000219271 CUX1P39880 1505 aa23.15■■□□□ 1.3
MMP15-201ENST00000219271 GRIN2BQ13224 1484 aa23.13■■□□□ 1.29
MMP15-201ENST00000219271 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.12■■□□□ 1.29
MMP15-201ENST00000219271 MLECQ14165 292 aa23.12■■□□□ 1.29
MMP15-201ENST00000219271 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.11■■□□□ 1.29
MMP15-201ENST00000219271 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
MMP15-201ENST00000219271 IFT140Q96RY7 1462 aa23.09■■□□□ 1.29
MMP15-201ENST00000219271 RGL3Q3MIN7 710 aa23.08■■□□□ 1.28
MMP15-201ENST00000219271 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.05■■□□□ 1.28
MMP15-201ENST00000219271 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
MMP15-201ENST00000219271 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.99■■□□□ 1.27
MMP15-201ENST00000219271 GGT6Q6P531 493 aa22.99■■□□□ 1.27
MMP15-201ENST00000219271 TOP2BQ02880 1626 aa22.97■■□□□ 1.27
MMP15-201ENST00000219271 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
MMP15-201ENST00000219271 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.95■■□□□ 1.26
MMP15-201ENST00000219271 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
MMP15-201ENST00000219271 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.94■■□□□ 1.26
MMP15-201ENST00000219271 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MMP15-201ENST00000219271 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
MMP15-201ENST00000219271 NEFLP07196 543 aa22.92■■□□□ 1.26
MMP15-201ENST00000219271 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MMP15-201ENST00000219271 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
MMP15-201ENST00000219271 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.86■■□□□ 1.25
MMP15-201ENST00000219271 ANP32CO43423 234 aa22.85■■□□□ 1.25
MMP15-201ENST00000219271 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
MMP15-201ENST00000219271 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.83■■□□□ 1.25
MMP15-201ENST00000219271 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.81■■□□□ 1.24
MMP15-201ENST00000219271 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.8■■□□□ 1.24
MMP15-201ENST00000219271 KIF3BO15066 747 aa22.79■■□□□ 1.24
MMP15-201ENST00000219271 PRXQ9BXM0 1461 aa22.78■■□□□ 1.24
MMP15-201ENST00000219271 FOXD1Q16676 465 aa22.78■■□□□ 1.24
MMP15-201ENST00000219271 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
MMP15-201ENST00000219271 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
MMP15-201ENST00000219271 PLEKHG5O94827 1062 aa22.71■■□□□ 1.23
MMP15-201ENST00000219271 PKD2Q13563 968 aa22.71■■□□□ 1.23
MMP15-201ENST00000219271 C14orf37Q86TY3 774 aa22.7■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 KANK1Q14678 1352 aa22.69■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.67■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 NUP155O75694 1391 aa22.67■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.65■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 ARAP1Q96P48 1450 aa22.65■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.65■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 SLC24A1O60721 1099 aa22.65■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.65■■□□□ 1.22
MMP15-201ENST00000219271 PRDM2Q13029 1718 aa22.64■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 KIF21BO75037 1637 aa22.63■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.63■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 SYNJ2O15056 1496 aa22.61■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.6■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.59■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.58■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.58■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.58■■□□□ 1.21
MMP15-201ENST00000219271 TMC1Q8TDI8 760 aa22.56■■□□□ 1.2
MMP15-201ENST00000219271 GRIN2AQ12879 1464 aa22.55■■□□□ 1.2
MMP15-201ENST00000219271 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
MMP15-201ENST00000219271 AFAP1Q8N556 730 aa22.54■■□□□ 1.2
MMP15-201ENST00000219271 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.52■■□□□ 1.2
MMP15-201ENST00000219271 NEFMP07197 916 aa22.51■■□□□ 1.19
MMP15-201ENST00000219271 POGKQ9P215 609 aa22.48■■□□□ 1.19
MMP15-201ENST00000219271 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.48■■□□□ 1.19
MMP15-201ENST00000219271 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.19
MMP15-201ENST00000219271 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
MMP15-201ENST00000219271 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.42■■□□□ 1.18
MMP15-201ENST00000219271 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.42■■□□□ 1.18
MMP15-201ENST00000219271 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
MMP15-201ENST00000219271 IQGAP2Q13576 1575 aa22.42■■□□□ 1.18
MMP15-201ENST00000219271 STK26Q9P289 416 aa22.41■■□□□ 1.18
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