RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
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USP18-201ENST00000215794 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
USP18-201ENST00000215794 SYNJ2O15056 1496 aa28.08■■■□□ 2.09
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USP18-201ENST00000215794 CHD1O14646 1710 aa28.02■■■□□ 2.08
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USP18-201ENST00000215794 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.94■■■□□ 2.06
USP18-201ENST00000215794 CEP170Q5SW79 1584 aa27.93■■■□□ 2.06
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USP18-201ENST00000215794 NUP160Q12769 1436 aa27.83■■■□□ 2.05
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USP18-201ENST00000215794 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.77■■■□□ 2.04
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.74■■■□□ 2.03
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USP18-201ENST00000215794 OSCARQ8IYS5 282 aa27.61■■■□□ 2.01
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USP18-201ENST00000215794 KIAA0556O60303 1618 aa27.54■■■□□ 2
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USP18-201ENST00000215794 FMN1Q68DA7 1419 aa27.34■■□□□ 1.97
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USP18-201ENST00000215794 PTPRGP23470 1445 aa27.28■■□□□ 1.96
USP18-201ENST00000215794 TIAM1Q13009 1591 aa27.27■■□□□ 1.96
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USP18-201ENST00000215794 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.2■■□□□ 1.94
USP18-201ENST00000215794 ARHGEF11O15085 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
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USP18-201ENST00000215794 ATP10BO94823 1461 aa27■■□□□ 1.91
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USP18-201ENST00000215794 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.84■■□□□ 1.89
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USP18-201ENST00000215794 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.78■■□□□ 1.88
USP18-201ENST00000215794 NCOA2Q15596 1464 aa26.78■■□□□ 1.88
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USP18-201ENST00000215794 KCNH8Q96L42 1107 aa26.77■■□□□ 1.88
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USP18-201ENST00000215794 ASXL2Q76L83 1435 aa26.7■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.7■■□□□ 1.87
USP18-201ENST00000215794 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
USP18-201ENST00000215794 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.65■■□□□ 1.86
USP18-201ENST00000215794 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.62■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 MAPKBP1O60336 1514 aa26.61■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.6■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.6■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
USP18-201ENST00000215794 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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