RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000005558.8

IFRD1-201, Transcript of interferon related developmental regulator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFRD1, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1-201ENST00000005558 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.5■■■□□ 2.47
IFRD1-201ENST00000005558 ARAP1Q96P48 1450 aa30.46■■■□□ 2.47
IFRD1-201ENST00000005558 CEP170Q5SW79 1584 aa30.44■■■□□ 2.46
IFRD1-201ENST00000005558 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
IFRD1-201ENST00000005558 CHD1O14646 1710 aa30.4■■■□□ 2.46
IFRD1-201ENST00000005558 NUP160Q12769 1436 aa30.4■■■□□ 2.46
IFRD1-201ENST00000005558 IQGAP2Q13576 1575 aa30.37■■■□□ 2.45
IFRD1-201ENST00000005558 FBLN2P98095 1184 aa30.37■■■□□ 2.45
IFRD1-201ENST00000005558 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.37■■■□□ 2.45
IFRD1-201ENST00000005558 SAMD9Q5K651 1589 aa30.33■■■□□ 2.45
IFRD1-201ENST00000005558 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.31■■■□□ 2.44
IFRD1-201ENST00000005558 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.3■■■□□ 2.44
IFRD1-201ENST00000005558 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.27■■■□□ 2.44
IFRD1-201ENST00000005558 P3H3Q8IVL6 736 aa30.23■■■□□ 2.43
IFRD1-201ENST00000005558 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.22■■■□□ 2.43
IFRD1-201ENST00000005558 DISP1Q96F81 1524 aa30.18■■■□□ 2.42
IFRD1-201ENST00000005558 KIAA0556O60303 1618 aa30.1■■■□□ 2.41
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IFRD1-201ENST00000005558 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.08■■■□□ 2.41
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IFRD1-201ENST00000005558 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.97■■■□□ 2.39
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IFRD1-201ENST00000005558 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.92■■■□□ 2.38
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IFRD1-201ENST00000005558 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.91■■■□□ 2.38
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IFRD1-201ENST00000005558 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.82■■■□□ 2.36
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IFRD1-201ENST00000005558 APLP2Q06481 763 aa29.78■■■□□ 2.36
IFRD1-201ENST00000005558 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.75■■■□□ 2.35
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IFRD1-201ENST00000005558 ABCA8O94911 1581 aa29.73■■■□□ 2.35
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IFRD1-201ENST00000005558 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.71■■■□□ 2.35
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IFRD1-201ENST00000005558 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
IFRD1-201ENST00000005558 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.64■■■□□ 2.34
IFRD1-201ENST00000005558 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.64■■■□□ 2.34
IFRD1-201ENST00000005558 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.62■■■□□ 2.33
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IFRD1-201ENST00000005558 UACAQ9BZF9 1416 aa29.54■■■□□ 2.32
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IFRD1-201ENST00000005558 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.28■■■□□ 2.28
IFRD1-201ENST00000005558 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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IFRD1-201ENST00000005558 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
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IFRD1-201ENST00000005558 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.04■■■□□ 2.24
IFRD1-201ENST00000005558 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
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IFRD1-201ENST00000005558 ASXL2Q76L83 1435 aa29■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 PTPRKQ15262 1439 aa28.99■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.98■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 KCNH8Q96L42 1107 aa28.97■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 ITGAEP38570 1179 aa28.95■■■□□ 2.23
IFRD1-201ENST00000005558 PREX2Q70Z35 1606 aa28.95■■■□□ 2.22
IFRD1-201ENST00000005558 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
IFRD1-201ENST00000005558 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.9■■■□□ 2.22
IFRD1-201ENST00000005558 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.89■■■□□ 2.21
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