RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Carmil1Q6EDY6 1374 aa31,34■■■□□ 2,61
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa31,33■■■□□ 2,61
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcf11G3X9Z4 1553 aa31,3■■■□□ 2,6
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SynmQ70IV5 1561 aa31,3■■■□□ 2,6
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crocc2F6XLV1 1638 aa31,28■■■□□ 2,6
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cux1P53564 1515 aa31,24■■■□□ 2,59
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Naip1Q9QWK5 1403 aa31,23■■■□□ 2,59
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdm5bQ80Y84 1544 aa31,22■■■□□ 2,59
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slx4Q6P1D7 1565 aa31,18■■■□□ 2,58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rad54l2Q99NG0 1466 aa31,16■■■□□ 2,58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TonslQ6NZL6 1363 aa31,15■■■□□ 2,58
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Peg3Q3URU2 1571 aa31,11■■■□□ 2,57
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP31,11■■■□□ 2,57
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BlmO88700 1416 aa31,04■■■□□ 2,56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CntlnA2AM05 1397 aa31,03■■■□□ 2,56
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr66E9Q743 1299 aa31,01■■■□□ 2,55
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ClspnQ80YR7 1315 aa31■■■□□ 2,55
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pla2r1Q62028 1487 aa30,97■■■□□ 2,55
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plb1Q3TTY0 1478 aa30,96■■■□□ 2,55
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpap1Q80TE0 1409 aa30,96■■■□□ 2,55
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aebp1Q640N1 1128 aa30,85■■■□□ 2,53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Disp1Q3TDN0 1521 aa30,84■■■□□ 2,53
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ift140E9PY46 1464 aa30,69■■■□□ 2,5
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa30,64■■■□□ 2,49
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP30,62■■■□□ 2,49
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif27Q7M6Z4 1394 aa30,49■■■□□ 2,47
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccer2J3QPU5 274 aa30,46■■■□□ 2,47
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A2mQ6GQT1 1474 aa30,44■■■□□ 2,46
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UacaQ8CGB3 1411 aa30,4■■■□□ 2,46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccnb3Q810T2 1396 aa30,39■■■□□ 2,46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BC005561E9Q5E2 1589 aa30,36■■■□□ 2,45
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Camsap2Q8C1B1 1461 aa30,17■■■□□ 2,42
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Setbp1Q9Z180 1582 aa30,04■■■□□ 2,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncoa2Q61026 1462 aa30,04■■■□□ 2,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa30,03■■■□□ 2,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP30,03■■■□□ 2,4
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13697A2AK42 830 aa29,99■■■□□ 2,39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP29,99■■■□□ 2,39
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa29,98■■■□□ 2,39
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