RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051454.3

Fam171b-201, Transcript of Protein FAM171B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fam171b, Length 5,614 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Polr3glQ8R0C0 218 aa23.09■■□□□ 1.29
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa23.04■■□□□ 1.28
Fam171b-201ENSMUST00000051454 ScribQ80U72 1612 aa23.04■■□□□ 1.28
Fam171b-201ENSMUST00000051454 CftrP26361 1476 aa23.03■■□□□ 1.28
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Arid3cA6PWV5 409 aa23.03■■□□□ 1.28
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Kif27Q7M6Z4 1394 aa23.02■■□□□ 1.28
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa22.93■■□□□ 1.26
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Kdm2aP59997 1161 aa22.93■■□□□ 1.26
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.88■■□□□ 1.25
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm20521D3Z5F7 333 aa22.86■■□□□ 1.25
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Aebp1Q640N1 1128 aa22.85■■□□□ 1.25
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Amer1Q7TS75 1132 aa22.82■■□□□ 1.24
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22.81■■□□□ 1.24
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Fam171b-201ENSMUST00000051454 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mia2Q91ZV0 1396 aa22.78■■□□□ 1.24
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.78■■□□□ 1.24
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cep162Q6ZQ06 1403 aa22.77■■□□□ 1.24
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Synj1Q8CHC4 1574 aa22.73■■□□□ 1.23
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa22.69■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Carmil1Q6EDY6 1374 aa22.68■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Card11Q8CIS0 1159 aa22.68■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map4P27546 1125 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 NgefQ8CHT1 710 aa22.67■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.66■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rsph4aQ8BYM7 716 aa22.66■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.64■■□□□ 1.22
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mrs2Q5NCE8 434 aa22.63■■□□□ 1.21
Fam171b-201ENSMUST00000051454 CntlnA2AM05 1397 aa22.62■■□□□ 1.21
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fyco1Q8VDC1 1437 aa22.59■■□□□ 1.21
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Zfp777B9EKF4 885 aa22.57■■□□□ 1.2
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Soga1E1U8D0 1418 aa22.5■■□□□ 1.19
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Psme1P97371 249 aa22.49■■□□□ 1.19
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Kif3bQ61771 747 aa22.48■■□□□ 1.19
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Irx6Q9ER75 438 aa22.47■■□□□ 1.19
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Txndc2Q6P902 515 aa22.47■■□□□ 1.19
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cabp1Q9JLK7 227 aa22.47■■□□□ 1.19
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ggt6Q6PDE7 497 aa22.46■■□□□ 1.19
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pkd2O35245 966 aa22.42■■□□□ 1.18
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Iqcf3Q9D498 203 aa22.41■■□□□ 1.18
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Fam171b-201ENSMUST00000051454 Trim26Q99PN3 545 aa22.39■■□□□ 1.18
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Trak1Q6PD31 939 aa22.39■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Jph4Q80WT0 628 aa22.38■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Csrnp3P59055 597 aa22.38■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 WrnO09053 1401 aa22.37■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Arhgap35Q91YM2 1499 aa22.37■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Stk26Q99JT2 416 aa22.36■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Plekhh2Q8C115 1491 aa22.35■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Aplp2Q06335 707 aa22.35■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cnga1P29974 684 aa22.34■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Anp32aO35381 247 aa22.33■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa22.33■■□□□ 1.17
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa22.32■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa22.32■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 HdgfP51859 237 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mrc2Q64449 1479 aa22.29■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rtl5Q5DTT4 599 aa22.29■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ncoa2Q61026 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Efcab5A0JP43 1406 aa22.28■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mphosph9A6H5Y1 991 aa22.27■■□□□ 1.16
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccnb3Q810T2 1396 aa22.25■■□□□ 1.15
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fhad1A6PWD2 1420 aa22.22■■□□□ 1.15
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rundc1Q0VDN7 615 aa22.21■■□□□ 1.15
Fam171b-201ENSMUST00000051454 ArxO35085 564 aa22.2■■□□□ 1.15
Fam171b-201ENSMUST00000051454 NudcO35685 332 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Fam171b-201ENSMUST00000051454 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa22.17■■□□□ 1.14
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sox12Q04890 314 aa22.16■■□□□ 1.14
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Calr4Q3TQS0 420 aa22.15■■□□□ 1.14
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ofd1Q80Z25 1017 aa22.15■■□□□ 1.14
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.13■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fgd6Q69ZL1 1399 aa22.13■■□□□ 1.13
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