RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 BlmO88700 1416 aa38.43■■■■□ 3.74
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slx4Q6P1D7 1565 aa38.33■■■■□ 3.73
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Carmil1Q6EDY6 1374 aa38.25■■■■□ 3.71
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Duox2A2AQ99 1517 aa38.21■■■■□ 3.71
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam135aQ6NS59 1506 aa38.08■■■■□ 3.69
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa37.97■■■■□ 3.67
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SynmQ70IV5 1561 aa37.97■■■■□ 3.67
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fyco1Q8VDC1 1437 aa37.93■■■■□ 3.66
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aebp1Q640N1 1128 aa37.89■■■■□ 3.66
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rad54l2Q99NG0 1466 aa37.87■■■■□ 3.65
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpap1Q80TE0 1409 aa37.67■■■■□ 3.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa37.65■■■■□ 3.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Crocc2F6XLV1 1638 aa37.64■■■■□ 3.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vps8Q0P5W1 1427 aa37.6■■■■□ 3.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Naip2Q9QUK4 1447 aa37.6■■■■□ 3.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NclP09405 707 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif21aQ9QXL2 1672 aa37.55■■■■□ 3.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa37.54■■■■□ 3.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pla2r1Q62028 1487 aa37.54■■■■□ 3.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa37.53■■■■□ 3.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A2mQ6GQT1 1474 aa37.51■■■■□ 3.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 UacaQ8CGB3 1411 aa37.49■■■■□ 3.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccnb3Q810T2 1396 aa37.46■■■■□ 3.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CadpsQ80TJ1 1355 aa37.45■■■■□ 3.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpatch8A2A6A1 1505 aa37.43■■■■□ 3.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Magi3Q9EQJ9 1476 aa37.41■■■■□ 3.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chic2Q9D9G3 165 aa37.4■■■■□ 3.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abca5Q8K448 1642 aa37.39■■■■□ 3.58
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif27Q7M6Z4 1394 aa37.34■■■■□ 3.57
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grin2aP35436 1464 aa37.31■■■■□ 3.56
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa37.31■■■■□ 3.56
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plb1Q3TTY0 1478 aa37.27■■■■□ 3.56
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aplp2Q06335 707 aa37.25■■■■□ 3.55
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm13697A2AK42 830 aa37.23■■■■□ 3.55
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NexmifQ5DTT1 1515 aa37.21■■■■□ 3.55
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 BC005561E9Q5E2 1589 aa37.19■■■■□ 3.54
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Disp1Q3TDN0 1521 aa37.19■■■■□ 3.54
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adamts12Q811B3 1600 aa37.16■■■■□ 3.54
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gcc2Q8CHG3 1679 aa37.14■■■■□ 3.54
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Soga1E1U8D0 1418 aa37.11■■■■□ 3.53
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cul7Q8VE73 1689 aa37.1■■■■□ 3.53
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Naip5Q9R016 1403 aa37.1■■■■□ 3.53
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm38655A0A286YDK6 273 aa37.09■■■■□ 3.53
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PxdnQ3UQ28 1475 aa37.09■■■■□ 3.53
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Camsap2Q8C1B1 1461 aa37.04■■■■□ 3.52
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37.03■■■■□ 3.52
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ncoa3O09000 1398 aa36.9■■■■□ 3.5
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rfx7F8VPJ6 1459 aa36.88■■■■□ 3.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcc5Q9R1X5 1436 aa36.86■■■■□ 3.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CenpbP27790 599 aa36.84■■■■□ 3.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp644E9QA22 1323 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ift140E9PY46 1464 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf710Q3U288 666 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap27A2AB59 869 aa36.82■■■■□ 3.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa36.81■■■■□ 3.48
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