RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 A0A0J9YY99 117 aa16.79■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 TMEM223A0PJW6 202 aa16.79■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3-53P01767 116 aa16.79■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 FAM104AQ969W3 186 aa16.79■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 WNK1Q9H4A3 2382 aa16.79■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 ZNF479Q96JC4 524 aa16.78■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 A0A0J9YXV3 536 aa16.77■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 J3QQQ9 107 aa16.77■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 AMELXQ99217 191 aa16.77■□□□□ 0.28
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 IL17DQ8TAD2 202 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 DNAJC30Q96LL9 226 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 CHCHD7Q9BUK0 85 aa16.76■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 LEPROTO15243 131 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 RRN3P1Q2M238 152 aa16.75■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 A6NJY4 79 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 CRYBA4P53673 196 aa16.74■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 RNF151Q2KHN1 245 aa16.73■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 NF1P21359 2839 aa16.73■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 SAP30O75446 220 aa16.72■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.72■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 UBE2D1P51668 147 aa16.72■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.72■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 CUBNO60494 3623 aa16.71■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.71■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa16.71■□□□□ 0.27
EHD4-202ENST00000569223 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 ACANP16112 2415 aa16.7■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa16.7■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa16.7■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 K7ERU9 68 aa16.7■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3-30P01768 117 aa16.69■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa16.69■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 COTL1Q14019 142 aa16.69■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 HILS1P60008 231 aa16.69■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 IGLV1-51P01701 117 aa16.67■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 Q6ZTI0 123 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 Q6ZUT4 128 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 NDUFA7O95182 113 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-202ENST00000569223 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 APOMO95445 188 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 TIMM21Q9BVV7 248 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 C19orf73Q9NVV2 129 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 ITPR2Q14571 2701 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 TSPAN13O95857 204 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 NDUFA11Q86Y39 141 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 H3BMG7 143 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 C10orf126Q8N4M7 172 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 VPS25Q9BRG1 176 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 K7EQD1 137 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 MTORP42345 2549 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 CFC1BP0CG36 223 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 CFC1P0CG37 223 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 SMR3AQ99954 134 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 F8W1H4 67 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 A0A0J9YXY3 114 aa16.58■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 G3V4G9 280 aa16.58■□□□□ 0.25
EHD4-202ENST00000569223 PLAC8L1A1L4L8 177 aa16.58■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 C16orf74Q96GX8 76 aa16.58■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 UNC79Q9P2D8 2635 aa16.57■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 TMEM238C9JI98 176 aa16.57■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 WFDC2Q14508 124 aa16.57■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 VSIG2Q96IQ7 327 aa16.56■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 SPINK8P0C7L1 97 aa16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 PRO0461Q9UI25 63 aa16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 KRTAP10-3P60369 221 aa16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 UBE2D3P61077 147 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms