RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP1-210ENST00000552189 A0A096LNT2 108 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BKO60814 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BJP06899 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BOP23527 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BBP33778 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BDP58876 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BCP62807 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.84□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 MED14OSP0DP75 135 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 SFTA2Q6UW10 78 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 TIRAPP58753 221 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 GATD1Q8NB37 220 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 AGRNO00468 2067 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 F8WEM9 126 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 LECT2O14960 151 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 SPINK8P0C7L1 97 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 FHL3Q13643 280 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 LEPROTO15243 131 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 NFE4Q86UQ8 179 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 FRYQ5TBA9 3013 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 CCL25O15444 150 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 NDUFA1O15239 70 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 MUC4Q99102 2169 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 REG3AQ06141 175 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 SPAG11BQ08648 103 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 COL12A1Q99715 3063 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 ITPR2Q14571 2701 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 ADCYAP1P18509 176 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 GTSF1Q8WW33 167 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 Q8N976 141 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 DKK2Q9UBU2 259 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 LAMA1P25391 3075 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 TSPAN13O95857 204 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 FABP2P12104 132 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 TMEM126AQ9H061 195 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 SMIM6P0DI80 62 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 ATMQ13315 3056 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 KLLNB2CW77 178 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 CTRLP40313 264 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 A0A0J9YXV3 536 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 ESDP10768 282 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 COLCA2A8K830 154 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 STPG4Q8N801 248 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 K7EMI3 77 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 F8VRH5 84 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 C3orf79P0CE67 100 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 PRR9Q5T870 116 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 EYSQ5T1H1 3165 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP1-210ENST00000552189 GAGE10A6NGK3 116 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP1-210ENST00000552189 MUC7Q8TAX7 377 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP1-210ENST00000552189 Q9H8V8 135 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP1-210ENST00000552189 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP1-210ENST00000552189 TACC2O95359 2948 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP1-210ENST00000552189 RS1O15537 224 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP1-210ENST00000552189 LELP1Q5T871 98 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP1-210ENST00000552189 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP1-210ENST00000552189 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.2 ms