RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 AP1S3Q96PC3 154 aa2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 H3BTX0 84 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TCAPO15273 167 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R17O96001 155 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 P01737 135 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 OR5AL1P0C617 328 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TRGC1P0CF51 173 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 AKR1C3P42330 323 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 CACNG7P62955 275 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 GCSAMLQ5JQS6 135 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 PRNTQ86SH4 94 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 Q86TA4 180 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 RNF185Q96GF1 192 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 SFRP2Q96HF1 295 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.79□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 FAM74A7A6NL05 159 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 SIX6O95475 246 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 LTAP01374 205 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ERASQ7Z444 233 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 RPH3ALQ9UNE2 315 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 ALG5Q9Y673 324 aa2.78□□□□□ -1.96
HDAC2-216ENST00000523628 PKHD1P08F94 4074 aa2.78□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 CCL25O15444 150 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 BCL2L11O43521 198 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 SNAI2O43623 268 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 NCR2O95944 276 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV2-8P01709 118 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 SFTA3P0C7M3 94 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00694P0DN24 101 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 PRR9Q5T870 116 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 LCE3AQ5TA76 89 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 NIT1Q86X76 327 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 MBD3L1Q8WWY6 194 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 BORCS7Q96B45 105 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 VAX2Q9UIW0 290 aa2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 KRBOX1C9JBD0 128 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 F8WDY8 70 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 GNRH2O43555 120 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 OXTP01178 125 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2D3P61077 147 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2D2P62837 147 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 Q5VSD8 79 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZSA8 131 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 WFDC10BQ8IUB3 73 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 KCNRGQ8N5I3 272 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 GTSF1Q8WW33 167 aa2.76□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 HERC2O95714 4834 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 FAM231BA6NCW3 169 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM250H0YL14 139 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 H3BVH4 76 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2L6O14933 153 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 ARPC5O15511 151 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 SH2D1AO60880 128 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 PRM2P04554 102 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 GNG4P50150 75 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 GNG5P63218 68 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 CCL20P78556 96 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF56Q15929 161 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 IQCJQ1A5X6 159 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 TMUB2Q71RG4 321 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 BAGE2Q86Y30 109 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 TSKUQ8WUA8 353 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.75□□□□□ -1.97
HDAC2-216ENST00000523628 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms