RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	HERVK_113	P61574	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZQT7	251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8N2B8	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8N6K4	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	RMI2	Q96E14	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	ICAM4	Q14773	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A087X002	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PS18	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		C9JCJ5	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		K7ERJ3	54 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		Q9H3A6	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	RELN	P78509	3460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ARID1A	O14497	2285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		E7EUB6	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	LTA	P01374	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IL4	P05112	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8N8P6	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	CCK	P06307	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	PRSS1	P07477	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF138	P52744	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	GNB1	P62873	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	BLCAP	P62952	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8N9W7	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	FLNC	Q14315	2725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	PRSS2	P07478	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	GCHFR	P30047	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	FXYD3	Q14802	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	PLGLA	Q15195	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	TNC	P24821	2201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971		A6NDX4	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	BMPR1B	O00238	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	NPY	P01303	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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