RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 TSPAN19P0C672 248 aa-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 Q5VV11 94 aa-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 RPRMQ9NS64 109 aa-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 PKD1P98161 4303 aa-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 PLXNB2O15031 1838 aa-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 DISP2A7MBM2 1401 aa-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.65□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 COL12A1Q99715 3063 aa-0.65□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00694P0DN24 101 aa-0.65□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.65□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.65□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.66□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.66□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.66□□□□□ -2.51
ITGA4-211ENST00000490435 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.66□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.66□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 SPRR2BP35325 72 aa-0.66□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2G1P62253 170 aa-0.66□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 WNK3Q9BYP7 1800 aa-0.66□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.67□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-0.67□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 HIVEP1P15822 2718 aa-0.67□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 A0A0D9SFI3 127 aa-0.67□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 WFDC2Q14508 124 aa-0.67□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 Q6ZUT4 128 aa-0.67□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.67□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.67□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 TGP01266 2768 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 ITPR3Q14573 2671 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 PIN1P1O15428 100 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 NCR2O95944 276 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 IFNA17P01571 189 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 PRM1P04553 51 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 SPRR2EP22531 72 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 DAPK1P53355 1430 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 MYH8P13535 1937 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.68□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 M0R3E3 92 aa-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 CKS1BP61024 79 aa-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.69□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.7□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 CUBNO60494 3623 aa-0.7□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.7□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.7□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.7□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-0.7□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 PYDC1Q8WXC3 89 aa-0.7□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 LAMA1P25391 3075 aa-0.7□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 PRDM2Q13029 1718 aa-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 A6NIN4 97 aa-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 IL5P05113 134 aa-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 SPRR2AP35326 72 aa-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 LAMC1P11047 1609 aa-0.71□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.72□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 ARPC5O15511 151 aa-0.72□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 CBLN1P23435 193 aa-0.72□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 Q5VSD8 79 aa-0.72□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 AKAP14Q86UN6 197 aa-0.72□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.72□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 GSKIPQ9P0R6 139 aa-0.72□□□□□ -2.52
ITGA4-211ENST00000490435 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 USF3Q68DE3 2245 aa-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF609O15014 1411 aa-0.73□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 CEP152O94986 1710 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 FAM92AA1XBS5 289 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 J3QR89 54 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 M0R2Z0 102 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 DR1Q01658 176 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.74□□□□□ -2.53
ITGA4-211ENST00000490435 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.74□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms