RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483973.5

TRAPPC10-210, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC10, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-210ENST00000483973 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 hDV102S1A0JD36 115 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 F5H697 171 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 RBX1P62877 108 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 CHTF8P0CG12 524 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 CT83Q5H943 113 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 LINC01551Q86U37 167 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRR34Q9NV39 138 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A087WYN8 130 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF727A8MUV8 499 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 SSTP61278 116 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 TPPP3Q9BW30 176 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 TRGC1P0CF51 173 aa8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMIM17P0DL12 118 aa8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 CEBPGP53567 150 aa8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 GTSF1Q8WW33 167 aa8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 A8MWL6 223 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 C9JQL5 133 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 PHOX2AO14813 284 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 NTF3P20783 257 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 REG3AQ06141 175 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 PEA15Q15121 130 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 RNF185Q96GF1 192 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 RNF213Q63HN8 5207 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM231BA6NCW3 169 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 M0QY20 66 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 LRP2P98164 4655 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 ODF1Q14990 250 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 C7orf33Q8WU49 177 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 OSTCQ9NRP0 149 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 H7C1H1 209 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 SLPIP03973 132 aa8.38□□□□□ -1.07
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TRAPPC10-210ENST00000483973 TSKUQ8WUA8 353 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 ISOC2Q96AB3 205 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 NAT8Q9UHE5 227 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 MGPP08493 103 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 TWIST1Q15672 202 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 IQCJQ1A5X6 159 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 LINC01600Q96MT4 127 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 V9GYV3 84 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 MAJINQ3KP22 176 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 RASL11AQ6T310 242 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 HIGD1CA8MV81 97 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 COX6A2Q02221 97 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM243Q9BU79 118 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 NIT2Q9NQR4 276 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A1B0GUT8 65 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 RAB14P61106 215 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 ADIRFQ15847 76 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 CLLU1Q5K131 121 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A1B0GUV1 79 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 UBE2L6O14933 153 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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TRAPPC10-210ENST00000483973 CFAP161Q6P656 301 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 GATD1Q8NB37 220 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 BORCS7Q96B45 105 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 TNXBP22105 4242 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A0J9YXV3 536 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 IFITM2Q01629 132 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 STPG4Q8N801 248 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC10-210ENST00000483973 NUP35Q8NFH5 326 aa8.32□□□□□ -1.08
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